Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475266
- Subject:
- XM_017008707.1
- Aligned Length:
- 1971
- Identities:
- 1562
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA 74
Query 75 CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT 148
Query 149 GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC 222
Query 223 TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG 296
Query 297 CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT 370
Query 371 TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG 444
Query 445 GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG 518
Query 519 GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC 592
Query 593 CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC 666
Query 667 GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA 740
Query 741 AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA 814
Query 815 GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC 888
Query 889 CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC 962
Query 963 CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA 1036
Query 1037 GCTACGG---------------------------------CGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAG 1077
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTACGGCGAGTCCCCTCAGTTGCTCTCGCCAACGCCGACCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAG 1110
Query 1078 TGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACA 1151
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGTCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACA 1184
Query 1152 GCACTACAGCCGTC------------------------------------------------------------ 1165
||||||||||||||
Sbjct 1185 GCACTACAGCCGTCCAGCTGGTACTGTGAGTGTGGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGTCCCAACACCCAAGCC 1258
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1259 CTACATCCGTGTTCAGACATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGGAGCACCCCCAGCCTC 1332
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1333 TCCGTGCTCTCTGACAGCAAGCCGCCCCCCTCCACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTTCCACGTCCCAGACAC 1406
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1407 TGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTACAGACAGCATGGTCCTGTAGCCCAATCCCAAATTT 1480
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1481 CCAAGCTCTCTGGCCTGGTATCAGTCTTGTCCTTGGTGGTGCAGGAGGCAGGGTACGGCAAAAGACAGACGGGC 1554
Query 1166 -------------------CAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAA 1220
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCGAGCCCGCCGCCCGCTGCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAA 1628
Query 1221 GCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGT 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGT 1702
Query 1295 CCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATAC 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATAC 1776
Query 1369 AAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGAC 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGAC 1850
Query 1443 GAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCC 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCC 1924
Query 1517 TGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1563
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1971