Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475266
- Subject:
- XM_017008708.1
- Aligned Length:
- 1953
- Identities:
- 1560
- Gaps:
- 390
Alignment
Query 1 ATGAGTG---------------CAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC 59
|||.|.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGGTGCCAGGGGGAGACACAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC 74
Query 60 GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA 148
Query 134 TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC 222
Query 208 ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT 296
Query 282 GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG 370
Query 356 GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC 444
Query 430 GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC 518
Query 504 CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA 592
Query 578 GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA 666
Query 652 TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG 740
Query 726 CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG 814
Query 800 CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC 888
Query 874 TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT 962
Query 948 TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG 1036
Query 1022 CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCA 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCA 1110
Query 1096 AGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTC---- 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGC 1184
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1185 TGGTACTGTGAGTGTGGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGTCCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTCAGAC 1258
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1259 ATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGGAGCACCCCCAGCCTCTCCGTGCTCTCTGACAGC 1332
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1333 AAGCCGCCCCCCTCCACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACAT 1406
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1407 CTATAGGAAACCCCCTATCTACAGACAGCATGGTCCTGTAGCCCAATCCCAAATTTCCAAGCTCTCTGGCCTGG 1480
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1481 TATCAGTCTTGTCCTTGGTGGTGCAGGAGGCAGGGTACGGCAAAAGACAGACGGGCCCGAGCCCGCCGCCCGCT 1554
Query 1166 -CAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCT 1238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCT 1628
Query 1239 GATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCG 1312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCG 1702
Query 1313 GGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATACAAGATCTATCCGTATGAC 1386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATACAAGATCTATCCGTATGAC 1776
Query 1387 TCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTT 1460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTT 1850
Query 1461 GTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGA 1534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGA 1924
Query 1535 ATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1563
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1953