Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475266
• Subject: XM_017008711.1
• Aligned Length: 1854
• Identities: 1560
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  ATGAGTG---------------CAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC  59
            |||.|.|               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGTGCCAGGGGGAGACACAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC  74

Query   60  GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA  148

Query  134  TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC  222

Query  208  ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT  296

Query  282  GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG  370

Query  356  GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC  444

Query  430  GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC  518

Query  504  CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA  592

Query  578  GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA  666

Query  652  TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG  740

Query  726  CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG  814

Query  800  CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC  888

Query  874  TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT  962

Query  948  TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG  1036

Query 1022  CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCA  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCA  1110

Query 1096  AGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTC----  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1111  AGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGG  1184

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1185  CAGTGAAAGTGGCCGGAGCACCCCCAGCCTCTCCGTGCTCTCTGACAGCAAGCCGCCCCCCTCCACCTACCAGC  1258

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1259  AGGCACCTCGCCACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTACAGA  1332

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1333  CAGCATGGTCCTGTAGCCCAATCCCAAATTTCCAAGCTCTCTGGCCTGGTATCAGTCTTGTCCTTGGTGGTGCA  1406

Query 1166  --------------------------------------------------CAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGG  1189
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGGCAGGGTACGGCAAAAGACAGACGGGCCCGAGCCCGCCGCCCGCTGCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGG  1480

Query 1190  AGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACA  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACA  1554

Query 1264  AGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAG  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAG  1628

Query 1338  GATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTC  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTC  1702

Query 1412  GCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTG  1485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTG  1776

Query 1486  TTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTT  1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTT  1850

Query 1560  GTTC  1563
            ||||
Sbjct 1851  GTTC  1854