Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475334
- Subject:
- XM_006499508.3
- Aligned Length:
- 2210
- Identities:
- 1935
- Gaps:
- 55
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAA 23
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGTACCGCGACTTCTCTGCTGACAGCCAGCCACCAGGTTTTTACATCATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAA 74
Query 24 GATTGAAATATCTGGCCCGTCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGGTTTGATGCACAAGAGCAGAAGTTTA 97
|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATCGAAATATCTGGCCCATCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGATTTGATCCACAAGAGCAGAAGTTTA 148
Query 98 CCGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGATACGGCCAACAGGCCAAAGCCTATGGTGGACCCTTCA 171
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 149 CTGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGACACAGCCAACAGGCCCAAGCCCATGGTGGACCCATCA 222
Query 172 TGCATCACACCCATCCAGCTGGCTCCTATGAAGACAATCGTTAGAGGAAACAAACCCTGCAAGGAAACCTCCAT 245
||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.||
Sbjct 223 TGCATCACACCCATACAGCTGGCTCCCATGAAGACAATCGTCAGAGGAAATAAATCCTGCAAGGAAACCTCTAT 296
Query 246 CAACGGCCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCGGTGACTCGCTCCAACTCCCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCA 319
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAATGGTCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCCGTGACTCGCTCCAACTCTCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCA 370
Query 320 CCCCAGATCAGGGAGCCTCCAGCCACGGTCCAGGCCACGCGGAAGAAAATGGCTTCATCACCTTCTCCCAGTAT 393
||||||||||||||||..|.||||.|..||.|||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 371 CCCCAGATCAGGGAGCAGCTAGCCGCATTCAAGGCCACTCGGAAGAGAACGGCTTCATCACTTTCTCACAATAT 444
Query 394 TCCAGCGAATCCGATACTACTGCTGACTACACGACCGAAAAGTACAGGGAGAAGAGTCTCTATGGAGATGATCT 467
|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|.||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 TCCAGTGAATCCGATACGACTGCGGACTACACAACTGAAAAGTACAGAGACAGGAGTCTCTATGGAGATGACCT 518
Query 468 GGATCCGTATTATAGAGGCAGCCACGCAGCCAAGCAAAATGGGCACGTAATGAAAATGAAGCACGGGGAGGCCT 541
|||||.|||.||||.|.|||||||.||||||||||||||||||||.|..|||||.|||||.||.||.||.||.|
Sbjct 519 GGATCTGTACTATAAAAGCAGCCATGCAGCCAAGCAAAATGGGCATGCCATGAAGATGAAACATGGAGACGCTT 592
Query 542 ACTATTCTGAGGTGAAGCCTTTGAAATCCGATTTTGCCAGATTTTCTGCCGATTATCACTCACATTTGGACTCA 615
||||..|||||.|||||.||||||||.||||..|.|||.||||..|||.|||.||||||.|.||.||||||||.
Sbjct 593 ACTACCCTGAGATGAAGTCTTTGAAAACCGACCTGGCCGGATTCCCTGTCGACTATCACACCCACTTGGACTCT 666
Query 616 CTGAGCAAACCAAGTGAATACAGTGACCTCAAGTGGGAGTATCAGAGAGCCTCGAGTAGCTCCCCTCTGGATTA 689
|||||.|||.||||||||||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 667 CTGAGAAAATCAAGTGAATATGGTGACCTTAGGTGGGATTATCAGAGAGCCTCTAGTAGCTCCCCTCTGGACTA 740
Query 690 TTCATTCCAATTCACACCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCGGGTGCTCCAAGGAGAGCCTGGCGTACAGTGAAA 763
.||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 741 CTCATTCCAGCTCACGCCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCAGGTGCTCCAAGGAGAGTCTGGCATACAGTGAAA 814
Query 764 GTGAATGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAGTCTTCGTACCTGAATCAGACAAGCCCTCAG 837
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 815 GTGATTGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAATCATCATACCTGCATCAGACGAGCCCTCAG 888
Query 838 CCCACCATGCGGCAGAGGTCCAGGTCAGGCTCGGGACTCCAGGAACCGATGATGCCATTTGGAGCAAGTGCATT 911
||..|||||||.|||||.||||.|||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCAGCCATGCGCCAGAGATCCAAGTCCGGCTCAGGGCTTCAGGAACCCATGATGCCATTTGGAGCAAGTGCATT 962
Query 912 TAAAACCCATCCCCAAGGACACTCCTACAACTCCTACACCTACCCTCGCTTGTCCGAGCCCACAATGTGCATTC 985
||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAAACTCATCCTCAAGGACACTCGTACAACTCCTACACCTACCCTCGATTGTCCGAGCCCACAATGTGCATTC 1036
Query 986 CAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCCTCAGCCCTCCACTGTCAGGGTCTGACACCTACCCCAGGGGC 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1037 CAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCTTCAGTCCTCCACTGTCAGGGTCCGACACTTACCCCAGAGGC 1110
Query 1060 CCTGCCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAATCGGGCTATTCCTCAAGCAGTCACCAGTACCCGTCTGGGTACCA 1133
||..||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111 CCCACCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAAGCAGGCTACTCTTCAGGCAGCCACCAGTACCCTTCTGGGTACCA 1184
Query 1134 CAAAGCCACCT-TGTACCATCACCCCTCCCTGCAGAGCAGTTCGCAGTACATCTCCACGGCTTCCTACCTGAGC 1206
||||| ||.|| |.|||||.||.||.||||||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||
Sbjct 1185 CAAAG-CATCTCTATACCACCATCCATCCCTGCAAACCAGTTCTCAGTACATCTCCACCGCTTCTTACTTAAGC 1257
Query 1207 TACCTCAGCCTCTCATCCAGCACCTACCCGCCGCCCAGCTGGGGCTCCTCCTCCGACCAGCAGCCCTCCAGGGT 1280
|..|||||..||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1258 TCTCTCAGTATCTCCTCGAGCACCTACCCTCCACCTAGCTGGGGCTCCTCCTCAGACCAGCAGCCCTCAAGGGT 1331
Query 1281 GTCCCATGAACAGTTTCGGGCGGCCCTGCAGCTGGTGGTCAGCCCAGGAGACCCCAGGGAATACTTGGCCAACT 1354
.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||
Sbjct 1332 ATCCCATGAACAATTCCGAGCTGCCCTGCAACTGGTGGTCAGCCCAGGAGACCCCAGGGAATATTTGGATAACT 1405
Query 1355 TTATCAAAATCGGGGAAGGCTCAACCGGCATCGTATGCATCGCCACCGAGAAACACACAGGGAAACAAGTTGCA 1428
||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1406 TTATTAAAATCGGAGAAGGGTCGACAGGCATCGTGTGCATTGCAACAGAGAAACACACAGGCAAGCAAGTGGCA 1479
Query 1429 GTGAAGAAAATGGACCTCCGGAAGCAACAGAGACGAGAACTGCTTTTCAATGAGGTCGTGATCATGCGGGATTA 1502
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1480 GTGAAGAAAATGGACCTCCGAAAGCAGCAGAGACGGGAACTCCTTTTTAATGAGGTCGTGATAATGCGTGATTA 1553
Query 1503 CCACCATGACAATGTGGTTGACATGTACAGCAGCTACCTTGTCGGCGATGAGCTCTGGGTGGTCATGGAGTTTC 1576
||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 CCACCATGACAACGTAGTTGACATGTACAACAGCTACCTTGTTGGAGATGAGCTCTGGGTGGTCATGGAGTTTC 1627
Query 1577 TAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTGACTCACACCAGAATGAATGAAGAACAGATAGCTACTGTCTGCCTG 1650
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 TAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTCACTCATACCAGAATGAATGAAGAGCAGATAGCTACTGTCTGCCTG 1701
Query 1651 TCAGTTCTGAGAGCTCTCTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGGGACATAAAAAGTGACTCCATCCT 1724
||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1702 TCAGTTCTGAAAGCTCTGTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGGGACATAAAGAGTGACTCCATTCT 1775
Query 1725 CCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTGTCTGATTTTGGTTTCTGTGCTCAAGTTTCCAAAGAGGTGCCGAAGA 1798
.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1776 TCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTATCTGACTTTGGTTTCTGTGCTCAAGTTTCCAAAGAGGTGCCAAAGA 1849
Query 1799 GGAAATCATTGGTTGGCACTCCCTACTGGATGGCCCCTGAGGTGATTTCTAGGCTACCTTATGGGACAGAGGTG 1872
||||.|||.||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 GGAAGTCACTGGTGGGTACCCCATACTGGATGGCACCTGAGGTGATTTCCAGGCTACCTTATGGGACAGAGGTG 1923
Query 1873 GACATCTGGTCCCTCGGGATCATGGTGATAGAAATGATTGATGGCGAGCCCCCCTACTTCAATGAGCCTCCCCT 1946
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1924 GACATCTGGTCCCTCGGGATAATGGTGATAGAGATGATTGATGGGGAGCCCCCCTATTTCAATGAGCCTCCTCT 1997
Query 1947 CCAGGCGATGCGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCTACACAAGGTTTCTTCAGTGCTCC 2020
.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 1998 GCAGGCCATGAGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCTACACAAGGTTTCTTCCATGCTCC 2071
Query 2021 GGGGATTCCTAGA-CTTGATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAGAGAGCAACAGCCCAGGAACTCCTCGGACATCC 2093
|.||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 2072 GAGGATTCCTAGATCTT-ATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAAAGAGCCACAGCTCAAGAACTCCTTGGACATCC 2144
Query 2094 ATTCTTAAAACTAGCAGGTCCACCGTCTTGCATTGTCCCCCTCATGAGACAATACAGGCATCAC 2157
||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2145 ATTCTTAAAATTGGCAGGTCCACCATCTTGCATTGTTCCTCTCATGAGACAATACAGACATCAC 2208