Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475751
• Subject: XM_006525518.2
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1278
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCGAGCCTCAGTACCAACGGGCTAGGCAG  74

Query   75  CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCCGGGCAGCGCCGGGCATATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148

Query  149  ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGAAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222

Query  223  GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GAGGAGTTCGGCAAGATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCTTT  296

Query  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACCCTGCCCGGGA  370

Query  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAG--------------------------  418

Query  445  TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC  518
             .|.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  419  -AAGATAGAAAACTCTTCGTGGGTATGCTCAACAAGCAACAATCTGAGGACGACGTGCGCCGCCTCTTCGAGGC  491

Query  519  CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  592
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CTTCGGGAACATCGAGGAGTGCACTATCCTGCGCGGGCCGGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  565

Query  593  ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC  666
            ||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  566  ACTCCTCCCATGCCGAGGCACAAGCCGCCATCAACGCTCTACATGGCAGCCAGACCATGCCTGGAGCCTCCTCC  639

Query  667  AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  740
            ||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  AGCCTGGTGGTCAAGTTTGCAGACACTGACAAGGAGCGCACAATGCGACGGATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  713

Query  741  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCCTTCGGAGCCTATGGCGCCTATGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  787

Query  815  CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG  888
            |.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  788  CAGCCCTCATGGCATCGGTCGCGCAAGGAGGCTACCTGAATCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAAATGCAG  861

Query  889  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCAGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  935

Query  963  GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC  1036
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  936  AGGCATCACTGCACCAGCTGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAACGGCTTCACGGGCCTCCCCCCTC  1009

Query 1037  AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1110
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  AGGCCAATGGGCAGCCTGCTGCGGAAGCTGTGTTTGCCAATGGCATTCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1083

Query 1111  GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAG---CAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1181
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  GCAGCCGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCTGGAGTGCAGCAGTATGCAGGACCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1157

Query 1182  TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT  1255
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||             
Sbjct 1158  TGGTCAGATTAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCACCGCCAATGATTCCCCAGCAACAGAGAGAA-------------  1218

Query 1256  GTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGC  1329
                                                                                   |||
Sbjct 1219  -----------------------------------------------------------------------GGC  1221

Query 1330  TTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATGAA  1403
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1222  TTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCACAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATAGGCATGAA  1295

Query 1404  GAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC  1452
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296  GAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC  1344