Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475838
• Subject: NM_001168600.1
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1504
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGATGAAACTTAGACACAAAAATAAAAAGCCAGGTGAAGGTTCCAAGGGCCACAAGAAGATAAGTTGGCCCTA  74
            ||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||.|||...||||                
Sbjct    1  ATGATGAAGATTAGACACAAAAACAAAAAACCAGGTAAAGGTTCCAAAGGCTGTAAGA----------------  58

Query   75  CCCTCAGCCTGCAAAGCAAAATGGGAAGAAAGCAACCTCCAAAGTGCCC----TCTGCACCTCATTTTGTTCAC  144
                 |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||    |.||    |||||.||.||..|||||||.
Sbjct   59  -----AGCCTGCAAGGCAAAATGGGAAGAAAGTAACCTCCA----GACCATCATCTGCTCCCCAGATTGTTCAT  123

Query  145  CCCAATGATCATGCCAATCGAGAGGCTGAATTAAAGAAGAAGTGGGTTGAGGAGATGAGGGAGAAGCAGCAAGC  218
            ..||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  124  GGCAATGACCATGCCAGTCGCGAGGCCGAATTAAAGAAGAAAAGGGTCGAGGAGATGAGGGAGAAGCAGCAAGT  197

Query  219  CGCCCGGGAGCAAGAAAGACAAAAACGCAGGACCATTGAGAGCTACTGTCAGGATGTCCTAAGACGCCAGGAGG  292
            .||||||||||||||.|||||.|.||.|||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.|||.|||.|||
Sbjct  198  TGCCCGGGAGCAAGAGAGACAGAGACACAGGACCATGGAGAGCTATTGTCAGGATGTCCTGAAACGTCAGCAGG  271

Query  293  AGTTTGAGCATAAGGAGGAAGTTTTGCAGGAATTAAATATGTTTCCTCAGCTGGATGACGAGGCCACGAGGAAG  366
            |.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||
Sbjct  272  AATTTGAACAAAAGGAGGAAGTTTTGCAGGAATTAAACATGTTTCCTCAGTTGGATGATGAGGCCACAAGGAAG  345

Query  367  GCTTATTACAAGGAGTTCCGTAAGGTGGTGGAATACTCTGATGTGATTCTGGAAGTCCTGGATGCCAGAGACCC  440
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  346  GCCTATTACAAGGAATTCCGGAAGGTGGTAGAGTACTCTGATGTGATTCTGGAAGTCCTAGATGCCAGAGACCC  419

Query  441  ATTAGGCTGCCGCTGCTTCCAAATGGAGGAGGCTGTCCTGCGAGCACAAGGCAACAAGAAGCTGGTCCTGGTCT  514
            |||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||.|||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  420  ATTGGGCTGCCGCTGTTTCCAGATGGAGGAGACTGTCCTTCGTGCAGAAGGCAACAAGAAGCTGGTCTTGGTCT  493

Query  515  TGAACAAGATTGACCTGGTCCCCAAGGAGGTTGTGGAGAAATGGCTGGATTACCTTCGGAATGAGTTGCCAACC  588
            |.||.|||||.||.||.||.|||||||||.|||||||.||.||||||||.|||||||..|||||..|||||||.
Sbjct  494  TAAATAAGATAGATCTCGTTCCCAAGGAGATTGTGGAAAAGTGGCTGGAATACCTTCTCAATGAACTGCCAACT  567

Query  589  GTGGCTTTCAAGGCCAGTACCCAG---CATCAGGTCAAAAACCTGAATCGTTGCAGTGTGCCAGTAGATCAGGC  659
            |||||||||||||||||.||||||   |||||||||||||||.|||.||||||.|..||.|||||.||.|||||
Sbjct  568  GTGGCTTTCAAGGCCAGCACCCAGCATCATCAGGTCAAAAACTTGACTCGTTGTAAAGTTCCAGTGGACCAGGC  641

Query  660  CTCTGAGTCACTGCTGAAAAGCAAAGCCTGCTTTGGAGCTGAAAACCTCATGAGGGTTCTGGGGAACTATTGCC  733
            |||||||||.||..|||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  642  CTCTGAGTCGCTTTTGAAAAGCAGAGCCTGCTTTGGAGCCGAAAATCTCATGAGGGTCCTGGGGAACTATTGTC  715

Query  734  GCCTTGGTGAAGTGCGCACCCACATTCGTGTGGGTGTTGTGGGTCTTCCCAATGTTGGGAAGAGCAGCCTGATC  807
            ||||.||.||||||||...|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  716  GCCTGGGGGAAGTGCGTGGCCACATTCGTGTGGGTGTTGTAGGCCTTCCCAATGTGGGGAAGAGCAGTCTGATC  789

Query  808  AATAGCCTGAAGCGCAGCCGCGCATGCAGCGTGGGAGCTGTTCCTGGAATTACCAAATTCATGCAGGAGGTCTA  881
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  790  AATAGCCTGAAGCGCAGCCGTGCTTGTAGTGTGGGAGCTGTTCCTGGTGTCACAAAATTCATGCAGGAGGTCTA  863

Query  882  CCTGGACAAGTTCATCCGGCTCTTGGATGCTCCAGGCATTGTCCCAGGGCCCAACTCAGAGGTGGGCACCATCC  955
            |||.||||||||.|||.||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  864  CCTAGACAAGTTTATCAGGCTTCTGGATGCACCAGGCATTGTCCCAGGACCCAATTCAGAGGTGGGCACCATCC  937

Query  956  TGCGTAACTGCGTCCACGTGCAGAAGCTGGCAGACCCTGTGACCCCAGTGGAGACCATCCTGCAGCGCTGCAAC  1029
            |||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  938  TGCGTAATTGCATCCATGTGCAGAAGCTGGCAGACCCTGTGACCCCGGTGGAGACCATCCTTCAGCGCTGCAAC  1011

Query 1030  CTGGAGGAGATTTCCAACTATTATGGCGTCTCTGGGTTCCAGACCACTGAGCACTTTCTGACGGCAGTGGCCCA  1103
            ||||||||||||||||.|||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1012  CTGGAGGAGATTTCCAGCTACTATGGTGTATCTGGATTCCAGACGACTGAGCACTTTCTGACTGCAGTGGCCCA  1085

Query 1104  CCGTTTGGGGAAGAAGAAGAAGGGAGGCTTATATAGTCAGGAACAGGCGGCCAAAGCTGTCCTAGCTGACTGGG  1177
            .||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1086  TCGCTTGGGAAAGAAGAAGAAGGGAGGTGTATATAGTCAGGAACAGGCTGCCAAAGCTGTGCTGGCTGACTGGG  1159

Query 1178  TGAGCGGGAAGATCAGCTTCTATATACCACCACCAGCCACTCACACTCTGCCCACCCATCTCAGTGCTGAGATC  1251
            ||||.|||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1160  TGAGTGGGAAGATCAGCTTCTATACACTACCACCGCCCACTCACACTCTGCCCACCCATCTCAGTGCTGAGATT  1233

Query 1252  GTTAAGGAAATGACCGAGGTCTTTGACATCGAGGATACTGAGCAGGCCAATGAAGACACCATGGAATGCTTGGC  1325
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1234  GTTAAGGAGATGACTGAGGTCTTTGATATAGAAGATACTGAGCACGCCAATGAAGACACCATGGAATGCTTAGC  1307

Query 1326  CACCGGAGAATCTGATGAGCTGTTGGGTGACACGGACCCACTTGAAATGGAGATCAAGTTGCTCCATTCTCCGA  1399
            ....||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||.|||.||.||||||||||||..
Sbjct 1308  TGTGGGAGAATCCGATGAGCTGTTGGGTGACATGGACCCACAAGAAATGGAGGTCAGGTGGCTCCATTCTCCAC  1381

Query 1400  TGACGAAAATAGCAGATGCCATTGAAAATAAAACCACCGTGTATAAGATTGGAGATCTCACTGGGTATTGCACC  1473
            ||..|||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 1382  TGGTGAAAATAGCAGATGCTATTGAAAATAGAAGCACCGTGTATAAGATTGGAAATCTCACTGGGTATTGTACC  1455

Query 1474  AATCCGAACCGTCATCAGATGGGGTGGGCTAAACGCAATGTGGACCACC---GCCCTAAGAGCAACAGTATGGT  1544
            ||.||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||   ||||..|.|..|||.||.|.||
Sbjct 1456  AAACCAAACCGTAATCAGATGGGGTGGCCTAAACGCAATGTGGACCACCATTGCCCCCAAAATAACCGTGTAGT  1529

Query 1545  GGATGTCTGCTCAGTGGACCGCCGCTCAGTGCTGCAGAGGATCATGGAGACGGACCCCCTGCAACAGGGCCAGG  1618
            .||.|||.|.||.||||||||||||.|..||.|||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1530  AGAGGTCAGTTCTGTGGACCGCCGCCCGATGTTGCAGAGGATCCTGGAGACAGACCCACTTCAGCAAGGCCAGG  1603

Query 1619  CTCTGGCATCTGCCCTGAAAAATAAGAAGAAGATGCAGAAACGTGCAGATAAAATCGCCAGCAAGCTGTCTGAT  1692
            ||||||||||||||.||||.||||||||.||..|||||||.|||.|||||||||||||||..|||.|||||||.
Sbjct 1604  CTCTGGCATCTGCCTTGAAGAATAAGAAAAAATTGCAGAAGCGTTCAGATAAAATCGCCACTAAGTTGTCTGAC  1677

Query 1693  TCCATGATGTC--TGCTCTCGACCTCTCTGGCAATGCTGATGATGGTGTTGGTGAC  1746
            |||||||||||  ||  ||.||||||||||||||..|.|||||..|||..||||||
Sbjct 1678  TCCATGATGTCCATG--CTTGACCTCTCTGGCAACTCCGATGACTGTGCAGGTGAC  1731