Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476089
- Subject:
- NM_177243.4
- Aligned Length:
- 2379
- Identities:
- 2064
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGAGCCAGCCCAGGCCCCGCTACGTGGTAGACAGAGCCGCATACTCCCTTACCCTCTTCGACGATGAGTTTGA 74
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCAGCCCAGGCCCCGCTACGTGGTAGACAGAGCTGCGTACTCCCTCTCCCTCTTCGATGATGAGTTTGA 74
Query 75 GAAGAAGGACCGGACATACCCAGTGGGAGAGAAACTTCGCAATGCCTTCAGATGTTCCTCAGCCAAGATCAAAG 148
||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.||||||||..|.|||||.||.||||||||||||.||||||
Sbjct 75 GAAGAAGGACCGTGCCTACCCGGTGGGAGAGAAGCTTCGCAACACTTTCAGGTGCTCCTCAGCCAAGTTCAAAG 148
Query 149 CTGTGGTGTTTGGGCTGCTGCCTGTGCTCTCCTGGCTCCCCAACTACAAGATTAAAGACTACATCATTCCTGAC 222
|..|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 CCTTTGTGTTTGGGCTGTTGCCTGTGCTCTCCTGGCTCCCTAAATACAAGATCAAAGACTACATCATCCCTGAC 222
Query 223 CTGCTCGGTGGACTCAGCGGGGGATCCATCCAGGTCCCACAAGGCATGGCATTTGCTCTGCTGGCCAACCTTCC 296
.||||.|||||||||||.||.||.|..||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGCTGGGTGGACTCAGTGGAGGGTGTATCCAGGTGCCACAAGGCATGGCATTTGCATTGCTGGCCAACCTTCC 296
Query 297 TGCAGTCAATGGCCTCTACTCCTCCTTCTTCCCCCTCCTGACCTACTTCTTCCTGGGGGGTGTTCACCAGATGG 370
|||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||.||||||||||||
Sbjct 297 TGCTGTCAACGGTCTCTACTCCTCCTTCTTCCCCCTCCTGACCTATTTCTTCTTAGGGGGTATTCACCAGATGG 370
Query 371 TGCCAGGTACCTTTGCCGTTATCAGCATCCTGGTGGGTAACATCTGTCTGCAGCTGGCCCCAGAGTCGAAATTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCCAGGTACCTTTGCCGTTATCAGCATCCTGGTGGGTAACATCTGTCTGCAGCTGGCCCCAGAGTCGAAATTC 444
Query 445 CAGGTCTTCAACAATGCCACCAATGAGAGCTATGTGGACACAGCAGCCATGGAGGCTGAGAGGCTGCACGTGTC 518
|||.||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 445 CAGATCTTCAACAATGTCACCAATGAGACCTACGTGGACACAGCAGCCATGGAGGCAGAAAGACTGCATGTGTC 518
Query 519 AGCTACGCTAGCCTGCCTCACCGCCATCATCCAGATGGGTCTGGGCTTCATGCAGTTTGGCTTTGTGGCCATCT 592
.||.||.||.||||||||.||.||..||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TGCGACACTTGCCTGCCTGACTGCTGTCATCCAGATGGCCTTGGGCTTCATGCAGTTTGGCTTTGTTGCCATCT 592
Query 593 ACCTCTCCGAGTCCTTCATCCGGGGCTTCATGACGGCCGCCGGCCTGCAGATCCTGATTTCGGTGCTCAAGTAC 666
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 593 ACCTCTCTGAGTCCTTTATCCGGGGCTTCATGACAGCCGCTGGCCTGCAGATTCTCATCTCTGTGCTCAAGTAC 666
Query 667 ATCTTCGGACTGACCATCCCCTCCTACACAGGCCCAGGGTCCATCGTCTTTACCTTCATTGACATTTGCAAAAA 740
|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCTTTGGTCTGACCATTCCCTCCTATACAGGCCCTGGCTCCATCGTCTTTACCTTCATTGACATTTGCAAAAA 740
Query 741 CCTCCCCCACACCAACATCGCCTCGCTCATCTTCGCTCTCATCAGCGGTGCCTTCCTGGTGCTGGTGAAGGAGC 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 CCTCCCCCACACCAACATCGCCTCGCTCATCTTTGCCCTGGTCAGCGGTGTCTTCCTGGTGCTGGTGAAGGAAC 814
Query 815 TCAATGCTCGCTACATGCACAAGATTCGCTTCCCCATCCCTACAGAGATGATTGTGGTGGTGGTGGCAACAGCT 888
||||.|||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 815 TCAACGCTCGGTACATGCACAAGATCCACTTCCCCATCCCTACAGAGATGATTGTGGTGGTAGTTGCAACCGCT 888
Query 889 ATCTCCGGGGGCTGTAAGATGCCCAAAAAGTATCACATGCAGATCGTGGGAGAAATCCAACGCGGGTTCCCCAC 962
|||||.|||.||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||.||..|||||.|||||
Sbjct 889 ATCTCTGGGAGCTGCAAGATGCCAAAAAAATACCACATGCAGATTGTGGGGGAGATCCGACAAGGGTTTCCCAC 962
Query 963 CCCGGTGTCGCCTGTGGTCTCACAGTGGAAGGACATGATAGGCACAGCCTTCTCCCTAGCCATCGTGAGCTACG 1036
.||||||.|.||..||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||.|
Sbjct 963 TCCGGTGGCACCGATGGTTTCGCAGTGGAAGGACATGGTGGGCACAGCCTTCTCCCTGGCAATTGTGGGCTATG 1036
Query 1037 TCATCAACCTGGCTATGGGCCGGACCCTGGCCAACAAGCACGGCTACGACGTGGATTCGAACCAGGAGATGATC 1110
|||||||.||||||||||||||.||||||||||.||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037 TCATCAATCTGGCTATGGGCCGCACCCTGGCCAGCAAGCATGGCTATGATGTGGATTCTAACCAGGAGATGATT 1110
Query 1111 GCTCTCGGCTGCAGCAACTTCTTTGGCTCCTTCTTTAAAATTCATGTCATTTGCTGTGCGCTTTCTGTCACTCT 1184
||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||
Sbjct 1111 GCCCTGGGCTGTAGCAACTTCTTCGGCTCCTTTTTCAAGATCCACGTCATTTGCTGCGCTCTCTCAGTCACACT 1184
Query 1185 GGCTGTGGATGGAGCTGGAGGAAAATCCCAGGTGGCCAGCCTGTGTGTGTCTCTGGTGGTGATGATCACCATGC 1258
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCTGTGGATGGGGCTGGAGGGAAATCCCAGGTGGCCAGCTTGTGTGTGTCTCTGGTGGTGATGATCACCATGC 1258
Query 1259 TGGTCCTGGGGAT-CTATCTGTATCCTCTCCCTAAGTCTGTGCTAGGAGCCCTGATCGCTGTCAATCTCAAGAA 1331
||||||| ||||| |||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTCCT-GGGATCCTATCTGTACCCTCTCCCCAAGGCTGTGCTAGGTGCCCTGATCGCTGTCAATCTCAAGAA 1331
Query 1332 CTCCCTCAAGCAACTCACCGACCCCTACTACCTGTGGAGGAAGAGCAAGCTGGACTGTTGCATCTGGGTAGTGA 1405
||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||.||||
Sbjct 1332 CTCCCTGAAGCAGCTCACTGACCCCTACTACCTCTGGAGGAAGAGTAAGCTAGACTGTTGTGTCTGGGTGGTGA 1405
Query 1406 GCTTCCTCTCCTCCTTCTTCCTCAGCCTGCCCTATGGTGTGGCAGTGGGTGTCGCCTTCTCCGTCCTGGTCGTG 1479
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1406 GCTTCCTCTCCTCGTTCTTCCTGAGCCTGCCCTACGGTGTCGCAGTGGGTGTAGCCTTCTCCATCCTGGTTGTG 1479
Query 1480 GTCTTCCAGACTCAGTTTCGAAATGGCTATGCACTGGCCCAGGTCATGGACACTGACATTTATGTGAATCCCAA 1553
.||||||||||.||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1480 ATCTTCCAGACCCAGTTTCGAAATGGCTCCACACTGGCCCAGGTCATGGACACGGACATCTATGTGAACCCCAA 1553
Query 1554 GACCTATAATAGGGCCCAGGATATCCAGGGGATTAAAATCATCACGTACTGCTCCCCTCTCTACTTTGCCAACT 1627
||||||.||.|||||||||||.||...|||..||||.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GACCTACAACAGGGCCCAGGAAATTGCGGGAGTTAAGATTGTCACTTACTGCTCCCCTCTCTACTTTGCCAACT 1627
Query 1628 CAGAGATCTTCAGGCAAAAGGTCATCGCCAAGACAGGCATGGACCCCCAGAAAGTATTACTAGCCAAGCAAAAA 1701
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1628 CAGAGATCTTCAGGCAAAAAGTCATTGCCAAGACAGGTATGGACCCCCAGAAAGTATTACTCGCCAAGCAGAAA 1701
Query 1702 TACCTCAAGAAGCAGGAGAAGCGGAGAATGAGGCCCACACAACAGAGGAGGTCTCTATTCATGAAAACCAAGAC 1775
||.|||..|||||||||||||.|||....||..||||||||.|||||.|.|||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1702 TATCTCCGGAAGCAGGAGAAGAGGACGGCGATACCCACACAGCAGAGAAAGTCCCTCTTCATGAAAACCAAGAC 1775
Query 1776 TGTCTCCCTGCAGGAGCTGCAGCAGGACTTTGAGAATGCGCCCCCCACCGACCCCAACAACAACCAGACCC--- 1846
.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|.|||.|||.|.||.|||||||||||||||||..|.|
Sbjct 1776 GGTCTCTCTACAGGAACTCCAACAGGACTTTGAAAGTGCTCCCTCTACTGACCCCAACAACAACCAAGCTCCTG 1849
Query 1847 CGGCTAACGGCAC-CAGCGTGTCCTATATCACCTTCAGCCCTGACAGCTCCTCACCTGC-CCAGAGTGAGCCAC 1918
|||||.| |||.| || |.|||||.|||||||||||.||.|||..||||.||.|||| .|| .||||||..|
Sbjct 1850 CGGCTGA-GGCTCACA---TATCCTACATCACCTTCAGTCCAGACGCCTCCACAGCTGCTGCA-TGTGAGCTGC 1918
Query 1919 CAGCCTCCGCTGAGGCCCCCGGCGAGCCCAGTGACATGCTGGCCAGCGTCCCACCCTTCGTCACCTTCCACACC 1992
|.||||||.||..|.|||||...|||.|.|||||||..||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1919 CCGCCTCCACTCGGTCCCCCCAGGAGGCTAGTGACACTCTAGCCAGTGTGCCGCCCTTTGTCACCTTCCACACT 1992
Query 1993 CTCATCCTGGACATGAGTGGAGTCAGCTTCGTGGACTTGATGGGCATCAAGGCCCTGGCCAAGCTGAGCTCCAC 2066
||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1993 CTCATCCTTGACATGAGTGGAGTCAGCTTTGTGGATTTGATGGGCATCAAAGCTCTCGCCAAGCTAAGCTCCAC 2066
Query 2067 CTATGGGAAGATCGGCGTGAAGGTCTTCTTGGTGAACATCCATGCCCAGGTGTACAATGACATTAGCCATGGAG 2140
|||||.|||||||||.||..||.||||..||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 2067 CTATGAGAAGATCGGAGTCCAGATCTTTCTGGTAAACATCCACGCCCAGGTGTATAATGACATCAGCCACGGAG 2140
Query 2141 GCGTCTTTGAGGATGGGAGTCTAGAATGCAAGCACGTCTTTCCCAGCATACATGACGCAGTCCTCTTTGCCCAG 2214
|.||||||||.||||||.||.||.|..|||..|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2141 GTGTCTTTGAAGATGGGTGTGTACAGCGCAGTCACGTGTTCCCCAGCATCCACGATGCAGTCCTCTTTGCCCAA 2214
Query 2215 GCAAATGCTAGAGACGTGACCCCAGGACACAACTTCCAAGGGGCTCCAGGGGATGCTGAGCTCTCCTTGTACGA 2288
||||||||||||||.| ||||||..|.|||||||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||||.||
Sbjct 2215 GCAAATGCTAGAGAAG---CCCCAGACCGCAACTTCCATGGGGCTCCAGGGGATACTGAGTTCTCCTTGTATGA 2285
Query 2289 CTCAGAGGAGGACATTCGCAGCTACTGGGACTTAGAGCAGGAGATGTTCGGGAGCATGTTTCACGCAGAGACCC 2362
||||||.|||||...||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 2286 CTCAGAAGAGGAAGGTCCCAGCTATTGGGACTTAGAACAGGAGATGTTCGGGACCATGTTTCACACAGAGACCC 2359
Query 2363 TGACCGCCCTG 2373
||||.||||||
Sbjct 2360 TGACTGCCCTG 2370