Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476467
- Subject:
- XM_017013297.1
- Aligned Length:
- 1398
- Identities:
- 1038
- Gaps:
- 360
Alignment
Query 1 ATGGGCTGGATCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGTCATTTTTTCCCTGGAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCCGGGATTTAAAAATTCTCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTTGAATATTTGAATTTAGCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACTTGACCTGACTGTGAATTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGCTCTTTCTCATGGGGAACC 370
||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------------ATGGGGAACC 10
Query 371 CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA 84
Query 445 GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA 158
Query 519 AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 159 AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG 232
Query 593 AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233 AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG 306
Query 667 AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT 380
Query 741 GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC 454
Query 815 GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG 528
Query 889 AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAAGCAGATCATCCTGGACCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAAGCAGATCATCCTGGACCT 602
Query 963 TGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 TGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA 676
Query 1037 AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA 750
Query 1111 ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 751 ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT 824
Query 1185 GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 825 GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC 898
Query 1259 CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA 972
Query 1333 CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 973 CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT 1038