Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476468
• Subject: XM_011514821.2
• Aligned Length: 1402
• Identities: 1187
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  ATGCAAATGGATAACCGGTTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTCCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTGCACTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAATA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCACAGATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATAAT  222
                                                                             |||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------ATGTATAAT  9

Query  223  TGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   10  TGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTTGG  83

Query  297  ATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  ATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCTGC  157

Query  371  TCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  158  TCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGGGG  231

Query  445  ATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCTAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  ATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCTAT  305

Query  519  GAGTACATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  306  GAGTACATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGGCT  379

Query  593  GGCCCATGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  380  GGCCCATGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATGAT  453

Query  667  GACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  GACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTCAG  527

Query  741  TTCAAGTAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAGTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  528  TTCAAGTAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAGTT  601

Query  815  TTACGTTTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  TTACGTTTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTAAT  675

Query  889  ATAAAAGAGAATGGGTTCTTGTCTTCCCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  676  ATAAAAGAGAATGGGTTCTTGTCTT-CCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCAGT  748

Query  963  TATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACCCTTCACAGCAGCAGGATTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  749  TATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACTCTTCACAGCAGCAGGATTT  822

Query 1037  CTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  CTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTAAT  896

Query 1111  ACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  ACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATATT  970

Query 1185  TTGGATTTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGATTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  TTGGATTTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGATTG  1044

Query 1259  ATCCTTAAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  ATCCTTAAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGCCT  1118

Query 1333  AATTTTCTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  AATTTTCTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1188