Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476468
• Subject: XM_017011202.1
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1390
• Gaps: 71

Alignment

Query    1  -------------------------------------ATGCAAA-TGGATA-------------ACCGG-----  18
                                                 .||.||| |.||.|             |.|||     
Sbjct    1  ATGGGGCTAAACTTGGTAATCCTAGAAAGTCAATATTGTGTAAAGTTGAGAGAAAAGTCTTCACAGCGGAAGAA  74

Query   19  ------------TTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTCCTTGTGCA  80
                        |||  ||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAATCACTTTTTTG--TCCCGAATCAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTCCTTGTGCA  146

Query   81  CTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAATAGCACAG  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAATAGCACAG  220

Query  155  ATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATAATTGGAGC  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  ATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATAATTGGAGC  294

Query  229  CCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTTGGATACTT  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  CCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTTGGATACTT  368

Query  303  CTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCTGCTCATCC  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  CTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCTGCTCATCC  442

Query  377  CACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGGGGATAGTT  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  CACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGGGGATAGTT  516

Query  451  GCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCTATGAGTAC  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCTATGAGTAC  590

Query  525  ATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGGCTGGCCCA  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  ATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGGCTGGCCCA  664

Query  599  TGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATGATGACCCC  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATGATGACCCC  738

Query  673  AAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTCAGTTCAAG  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  AAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTCAGTTCAAG  812

Query  747  TAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAGTTTTACGT  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  TAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAGTTTTACGT  886

Query  821  TTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTAATATAAAA  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  TTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTAATATAAAA  960

Query  895  GAGAATGGGTTCTTGTCTTCCCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCAGTTATCAG  968
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GAGAATGGGTTCTTGTCTT-CCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCAGTTATCAG  1033

Query  969  ACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACCCTTCACAGCAGCAGGATTTCTCCTT  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  ACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACTCTTCACAGCAGCAGGATTTCTCCTT  1107

Query 1043  CCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTAATACTTGC  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  CCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTAATACTTGC  1181

Query 1117  TGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATATTTTGGAT  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATATTTTGGAT  1255

Query 1191  TTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGATTGATCCTT  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  TTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGATTGATCCTT  1329

Query 1265  AAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGCCTAATTTT  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  AAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGCCTAATTTT  1403

Query 1339  CTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1467