Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476518
• Subject: NM_011031.2
• Aligned Length: 1617
• Identities: 1307
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGCTCCAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGATGTCCTGGTTCGGTGTCCTGAGCTGGGTGCAGGCAGAATT  74

Query    1  -------------------ATGACTGACCTGATTTATGCAGAGAAAGAGCTGGTGCAGTCTCTGAAAGAGTACA  55
                               |||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CTTCACCTCCATTGGGCACATGACCGATCTGATTTACGCAGAGAAGGACCTGGTACAGTCTCTGAAGGAGTACA  148

Query   56  TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTTTCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAACAAAATGGAAGCCTTGACTAGCAAGTCA  129
            ||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||.||||..|||
Sbjct  149  TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTCGCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAGCAAGATGGAAGCCCTGACCAGCAGATCA  222

Query  130  GCTGCTGATGCTGAGGGCTACCTGGCTCACCCTGTGAATGCCTACAAACTGGTGAAGCGGCTAAACACAGACTG  203
            |||||.||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  223  GCTGCCGACCCCGAGGGCTACCTGGCTCATCCTGTGAATGCCTACAAGCTGGTGAAGCGGTTGAACACAGACTG  296

Query  204  GCCTGCGCTGGAGGACCTTGTCCTGCAGGACTCAGCTGCAGGTTTTATCGCCAACCTCTCTGTGCAGCGGCAGT  277
            ||||||.||||.||||||||||||.|||||..|..|.|||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  297  GCCTGCACTGGGGGACCTTGTCCTTCAGGATGCTTCGGCAGGTTTTGTCGCTAACCTCTCAGTTCAGCGGCAAT  370

Query  278  TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGATAGGAGCTGCCAAAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACATACAGGCTGGAC  351
            |||||||||||||||||||||||...||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.
Sbjct  371  TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGTCTGGAGCTGCCAGAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACGTACAAACTGGAT  444

Query  352  CCAGGCACAATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGAACCAAGTACCAGGCAATGCTGAGTGTGGATGACTGCTTTGG  425
            ||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CCGGACACGATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGCACAAAGTACCAGGCCATGCTGAGTGTGGACGACTGCTTTGG  518

Query  426  GATGGGCCGCTCGGCCTACAATGAAGGGGACTATTATCATACGGTGTTGTGGATGGAGCAGGTGCTAAAGCAGC  499
            |.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  GCTGGGCCGCTCAGCTTACAATGAAGGAGACTATTACCATACTGTGCTGTGGATGGAGCAGGTACTGAAGCAGC  592

Query  500  TTGATGCCGGGGAGGAGGCCACCACAACCAAGTCACAGGTGCTGGACTACCTCAGCTATGCTGTCTTCCAGTTG  573
            |.|||||.||||||||||||||....||||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||..||
Sbjct  593  TCGATGCTGGGGAGGAGGCCACTGTTACCAAGTCCCTGGTGCTGGACTACCTGAGCTATGCTGTCTTCCAACTG  666

Query  574  GGTGATCTGCACCGTGCCCTGGAGCTCACCCGCCGCCTGCTCTCCCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG  647
            |||||.|||||||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGACCTGCACCGTGCTGTGGAACTCACCCGCCGCCTGCTCTCTCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG  740

Query  648  GAATCTGCGGTACTTTGAGCAGTTATTGGAGGAAGAGAGAGAAAAAACGTTAACAAATCAGACAGAAGCTGAGC  721
            ||||||||||||||||||.|.|||.||.||||||||.||||..|||.|..|..|||||||||||||.||.|..|
Sbjct  741  GAATCTGCGGTACTTTGAACGGTTGTTAGAGGAAGAAAGAGGGAAATCACTGTCAAATCAGACAGACGCCGGAC  814

Query  722  TAGCAACCCCAGAAGGCATCTATGAGAGGCCTGTGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTTTACGAGAGCCTCTGT  795
            |.||.||||..|||..|.|.||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  TGGCCACCCAGGAAAACTTGTACGAGAGGCCCACGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTGTACGAGAGCCTGTGT  888

Query  796  CGTGGGGAGGGTGTCAAACTGACACCCCGTAGACAGAAGAGGCTTTTCTGTAGGTACCACCATGGCAACAGGGC  869
            ||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.
Sbjct  889  CGAGGGGAGGGCGTGAAACTGACACCCCGGAGGCAGAAGAAGCTTTTCTGTAGGTACCATCATGGAAACAGAGT  962

Query  870  CCCACAGCTGCTCATTGCCCCCTTCAAAGAGGAGGACGAGTGGGACAGCCCGCACATCGTCAGGTACTACGATG  943
            .||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GCCACAGCTCCTCATCGCCCCCTTCAAAGAGGAAGACGAGTGGGACAGCCCACACATCGTCAGGTACTATGATG  1036

Query  944  TCATGTCTGATGAGGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATCGCAAAACCTAAACTTGCACGAGCCACCGTTCGTGAT  1017
            |.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TGATGTCCGACGAAGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATTGCTAAGCCCAAACTTGCACGAGCCACTGTGCGTGAC  1110

Query 1018  CCCAAGACAGGAGTCCTCACTGTCGCCAGCTACCGGGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAAGATGATGACCC  1091
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  CCCAAGACAGGTGTCCTCACTGTTGCCAGCTACAGAGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAGGATGACGACCC  1184

Query 1092  TGTTGTGGCCCGAGTAAATCGTCGGATGCAGCATATCACAGGGTTAACAGTAAAGACTGCAGAATTGTTACAGG  1165
            ||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||||||||||..|.||.||||
Sbjct 1185  TGTTGTGGCCCGGGTCAACCGGCGGATGCAACATATCACCGGGCTAACGGTGAAGACTGCAGAGCTATTGCAGG  1258

Query 1166  TTGCAAATTATGGAGTGGGAGGACAGTATGAACCGCACTTCGACTTCTCTAG--GCGACCTTTTGA--CAGCGG  1235
            |.|||||.||.|||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||  ||||     |||  .||..|
Sbjct 1259  TCGCAAACTACGGAATGGGGGGACAGTACGAACCACACTTTGACTTCTCAAGGAGCGA-----TGAGCAAGATG  1327

Query 1236  CCTCAAAAC----AGAG---GGGAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTACATGAGTGATGTAGAAGCTGGTGGT  1302
            |.|..||.|    ||.|   |||||..|..|.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1328  CTTTCAAGCGTTTAGGGACTGGGAACCGTGTGGCCACGTTTCTAAACTACATGAGCGATGTCGAAGCTGGTGGT  1401

Query 1303  GCCACCGTCTTCCCTGATCTGGGGGCTGCAATTTGGCCTAAGAAGGGTACAGCTGTGTTCTGGTACAACC-TCT  1375
            |||||||||||.|||||..||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||| |||
Sbjct 1402  GCCACCGTCTTTCCTGACTTGGGAGCTGCTATTTGGCCCAAGAAGGGCACAGCTGTATTCTGGTACAACCTTCT  1475

Query 1376  TGCGGAGCGGGGAAGGTGACTACCGAACAAGACATGCTGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCC  1449
            | ||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  T-CGCAGTGGGGAAGGTGATTATCGGACGAGACATGCAGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCC  1548

Query 1450  AATAAGTGGTTCCATGAACGAGGACAGGAGTTCTTGAGACCTTGTGGATCAACAGAAGTTGAC  1512
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 1549  AACAAGTGGTTCCATGAGCGAGGACAGGAGTTCTTAAGACCTTGTGGAACAACGGAAGTTGAT  1611