Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476592
• Subject: XM_011251008.3
• Aligned Length: 2704
• Identities: 2371
• Gaps: 32

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGCCGCTCCCGGTCGGAGCCCAGCCGCTTGCCACTGTCGAGGGTATGGAGATGAAGGGTCCTCTCCG  74
            ||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||.||.|..||.|.||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGCCGCGGCTCCCGATTGGAGCTCAGCCCCTGGCAATGGTGGCGGGTTTGGAGATGAAGGGTCCCCTCCG  74

Query   75  GGAGCCCTGCGCCCTGACCCTAGCCCAGAGGAACGGGCAATATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGAGAAGGAAC  148
            |||.|||||||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct   75  GGAACCCTGCGTCCTGACCCTAGCCCGGAGGAATGGGCAGTATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGGAAAGGAAC  148

Query  149  AGCATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTCAAGAAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTC---AAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT  219

Query  223  GACATAGCTTCTAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTTCAGGGGGACTGGATCAGAGAGCGCCGCTTTGAAATCCC  296
            ||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  220  GATATTGCTTCAAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTACAGGGAGACTGGACCAGAGAGCGCCACTTTGAAATTCC  293

Query  297  TGATGAGGAACACTGTTTGAAGTTCCTCTCAGCTGTCCTTGCTGCTCAGAAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC  370
            ||||||.||||.||||||||||||||||||||..|||||.|..||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TGATGAAGAACGCTGTTTGAAGTTCCTCTCAGAGGTCCTCGAAGCTCAGGAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC  367

Query  371  CAGAGCAAAAGGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTAAGGACAAACCTTCTGTTTTTTCAGGGCTT  444
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||   |||.||.|||||||||.
Sbjct  368  CAGAACAAAAAGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTATGGATAAAC---CTGCTTATTCAGGGCTG  438

Query  445  CTTGGATTTGAAGACAATTTTTCTTCTATGAATTTGGACAAGAAAATAAATTCACAAAATCAGCCTA-CTGGGA  517
            |||||||||||.||.||||||||.|||.||.||||.||.||||||||.|||.||||||||| .||.| |.||||
Sbjct  439  CTTGGATTTGAGGATAATTTTTCATCTCTGGATTTAGATAAGAAAATGAATACACAAAATC-CCCGATCAGGGA  511

Query  518  TTCATCGGGAACCCCCACCTCCACCCTTTTCAGTGAATAAAATGCTTCCACGTGAAAAAGAAGCTTCTAACAAG  591
            .||||||||||||.||.||||||||.|.||||..||.||.|||||||.|.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  512  GTCATCGGGAACCACCCCCTCCACCTTCTTCATCGACTAGAATGCTTTCGCGTGAAAAGGAAGCTTCAAACAAA  585

Query  592  GAGCAGCCCAAAGTGACCAACACCATGCGGAAGCTCTTTGTACCAAATACCCAATCTGGGCAGCGGGAGGGTCT  665
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.||||||||
Sbjct  586  GAACAGCCCAAAGTGACCAATACCATGCGGAAGCTATTTGTCCCGAACACCCAAACCGGGCAGCGAGAGGGTCT  659

Query  666  CATCAAACATATCCTGGCAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATTCAGACTTTCAGATTTTTTGTTGGAACTT  739
            |||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct  660  CATTAAACATATCCTCACAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATCCAGTCTTTCAGGTTTTTTGTTGGAACTT  733

Query  740  GGAATGTGAATGGCCAGTCTCCAGATAGCGGGTTAGAACCTTGGCTGAACTGTGATCCCAATCCTCCTGATATC  813
            ||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  734  GGAATGTGAACGGCCAGTCTCCAGACAGCAGCTTAGAACCTTGGCTCGACTGTGATCCAAATCCTCCTGATATT  807

Query  814  TACTGCATTGGATTCCAAGAACTGGACTTGAGCACAGAAGCCTTCTTCTACTTTGAATCTGTGAAGGAACAAGA  887
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  808  TACTGCATTGGATTCCAAGAGCTGGACTTGAGCACCGAAGCCTTTTTCTACTTCGAGTCTGTGAAAGAGCAAGA  881

Query  888  ATGGTCCATGGCTGTAGAGAGAGGTTTGCATTCCAAAGCCAAGTATAAGAAAGTTCAACTGGTGCGCCTTGTTG  961
            .||||||.|||||||.||.||.||..|||.|||.||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  882  GTGGTCCTTGGCTGTGGAAAGGGGGCTGCCTTCGAAGGCCAAGTATAGAAAAGTTCAACTGGTCCGCCTTGTGG  955

Query  962  GGATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAGGATCAGTGTCGATACATTCGTGATATTGCTACAGAAACAGTTGGA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||.|||.||||||||||||||..||||
Sbjct  956  GGATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAAGATCAGTGTCAATACATCCGAGATGTTGCTACAGAAACAACTGGA  1029

Query 1036  ACTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTGAGATTTGTATTTCACAACACCACCTTTTG  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1030  ACTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTAAGATTTGTATTCCACAACACCACTTTCTG  1103

Query 1110  CATTGTCAATTCCCATCTGGCTGCACACGTGGAGGACTTTGAGAGAAGGAATCAAGATTATAAGGACATTTGTG  1183
            ||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||..||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1104  CATTGTCAATTCGCACCTGGCCGCCCACGTGGAAGAGTTCGAACGAAGGAATCAGGATTATAAAGACATCTGTG  1177

Query 1184  CGAGAATGAGTTTTGTGGTCCCAAATCAGACCCTCCCGCAGTTGAACATCATGAAACATGAGGTTGTCATTTGG  1257
            |.|||||||.||||...|||||.||||||||..|||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1178  CAAGAATGACTTTTTCAGTCCCCAATCAGACTGTCCCGCAAGTGAACATCATGAAGCATGATGTTGTCATTTGG  1251

Query 1258  TTGGGAGATTTGAATTATAGACTTGGCATGCCTGATGCCAATGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAGAAAGACCT  1331
            .|||||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1252  CTGGGAGACTTGAACTACAGACTTTGCATGCCTGATGCCAGTGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAAAATGAGCT  1325

Query 1332  TCAGAGACTCTTGAAATTCGACCAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAG  1405
            |||.|..||.||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||
Sbjct 1326  TCATAAGCTGTTGAAATTTGACCAGTTAAACATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGCGGATTTCAATGAAG  1399

Query 1406  GGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGG  1479
            |||||||.||.|||.|.|||||.||.||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1400  GGGAAATTAATTTCGTTCCCACGTACAAATATGATTCGAAAACTGACAGATGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGA  1473

Query 1480  GTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGA  1553
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1474  GTTCCCGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAATAAATGTTAATCAACTTCATTACCGGAGTCACATGGA  1547

Query 1554  ACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAACGAAGGT  1627
            |||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1548  ACTCAAAACTAGTGACCACAAACCTGTTAGCGCCCTGTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAGCGGAGGT  1621

Query 1628  ACCGGAAAGTCTTTGAAGATAGTGTACGCATCATGGACAGAATGGAAAATGACTTCCTTCCTTCCTTAGAACTC  1701
            |.|||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1622  ATCGGAAGGTCTTTGAAGATATCGTCCGCATTATGGACAGAATGGAAAACGACTTCCTTCCTTCATTAGAACTT  1695

Query 1702  AGCAGGAGGGAGTTTGTGTTTGAAAATGTGAAGTTTCGGCAACTACAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAA  1775
            ||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696  AGCAGGAGAGAGTTTTTTTTTGAGAATGTGAAGTTTCGGCAGCTGCAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAA  1769

Query 1776  TGGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAACTTAATGACAGCCAGTACTGCAAGCCATGGCTTCGGG  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1770  TGGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAGCTTAATGACAGCCAATACTGCAAGCCATGGCTTCGAG  1843

Query 1850  CTGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAATGAGACAGTGGACATTTCTCTTGATGTGTATGTCAGCAAAGAC  1923
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1844  CTGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAACGAGACCTTAGACATCTCCCTTGATGTATACGTCAGCAAAGAC  1917

Query 1924  TCTGTAACCATCCTGAACTCGGGAGAAGATAAGATTGAAGATATTCTCGTCCTTCACCTGGATCGAGGCAAAGA  1997
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||
Sbjct 1918  TCTGTAACCATCCTGAACTCCGGTGAAGATAAGATTGAAGATATTCTTGTCCTCCATTTGGATCGAGGCAAAGA  1991

Query 1998  TTACTTCTTGACTATCAGTGGAAATTACCTCCCAAGTTGTTTTGGCACATCCTTAGAGGCTCTGTGCCGTATGA  2071
            ||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.|||||||.||||
Sbjct 1992  TTACTTCTTGACCATCGGTGGGAATTACCTCCCAAGTTGCTTTGGAACCTCATTGGAGGCTTTGTGCCGAATGA  2065

Query 2072  AAAGACCAATCCGAGAAGTTCCTGTTACCAAACTCATAGACTT------------------------GGAGAAA  2121
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|                        |||||||
Sbjct 2066  AAAGACCAATTCGAGAAGTTCCTGTCACCAAACTCATAGACCTGGAAGAAGACAGCTACCTAGAAAAGGAGAAA  2139

Query 2122  TCCCTTCTGCAAATGGTTCCTTTGGATGAAGGTGCCAGTGAGAGGCCCCTTCAGGTTCCCAAGGAGATCTGGCT  2195
            |||||||||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||.|.||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2140  TCCCTTCTGCAGATGGTACCCTTGGATGAAGGTACCAGTGAGCGACCCCTTCAAGTCCCCAAAGAGATCTGGCT  2213

Query 2196  TCTAGTAGATCACCTATTCAAATACGCCTGTCACCAGGAGGACCTGTTCCAGACCCCTGGAATGCAGGAAGAGC  2269
            |||||||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct 2214  TCTAGTAGATCACTTGTTCAAATATGCATGTCACCAGGAGGACTTGTTCCAAACCCCTGGAATGCAGGAGGAGT  2287

Query 2270  TCCAGCAGATCATTGATTGTCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATCCCTGGCAGCAACCACTCTGTGGCTGAA  2343
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||||||||||||
Sbjct 2288  TACAGCAGATCATTGATTGCCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATTCCTGGCAATAACCATTCTGTGGCTGAA  2361

Query 2344  GCACTGCTCATTTTCTTGGAAGCCCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTACGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTC  2417
            |||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2362  GCACTGCTCATTTTCCTGGAAGCTCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTATGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTC  2435

Query 2418  TGCTTATGATCCCCGGATCTGCCGACAGGTGATCTCCCAGCTTCCGAGATGCCATAGAAATGTTTTCCGTTACT  2491
            ||||.|||||||.|||||||||..||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2436  TGCTCATGATCCTCGGATCTGCAAACAGGTCATTTCCCAGCTTCCAAGGTGCCATAGAAATGTTTTCCGCTACT  2509

Query 2492  TGATGGCATTCCTTCGAGAACTCTTAAAATTCTCTGAATACAATAGCGTCAATGCCAACATGATCGCTACTCTC  2565
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|...||||..||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2510  TGATGGCATTCCTTCGTGAACTCTTAAAATTCTCTGACTACAACAATATCAACACCAACATGATTGCTACCCTG  2583

Query 2566  TTCACTAGTCTTCTCCTGAGGCCTCCACCCAACCTTATGGCAAGACAGACTCCAAGTGACCGCCAGCGTGCTAT  2639
            ||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct 2584  TTCAGTAGCCTTCTCCTAAGACCTCCACCAAACCTCATGACAAGACAGACTCCAAATGACCGCCAGCATGCCAT  2657

Query 2640  TCAGTTCCTTCTGGGCTTTCTGCTTGGGAGCGAAGAAGAC  2679
            .||||||||..|||.|||.||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2658  CCAGTTCCTCTTGGTCTTCCTGCTTGGGAACGAGGAAGAC  2697