Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476621
- Subject:
- XM_011541058.3
- Aligned Length:
- 2084
- Identities:
- 1662
- Gaps:
- 388
Alignment
Query 1 ATGGCGAAAGTCAACATAACTAGAGACCTCATCCGTAGGCAGATCAAGGAGCGGGGTGCCCTGAGCTTTGAGCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAAAGTCAACATAACTAGAGACCTCATCCGTAGGCAGATCAAGGAGCGGGGTGCCCTGAGCTTTGAGCG 74
Query 75 GCGCTACCATGTCACTGACCCCTTTATCCGGCGGCTGGGCCTGGAAGCAGAGCTGCAGGGTCACTCAGGATGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGCTACCATGTCACTGACCCCTTTATCCGGCGGCTGGGCCTGGAAGCAGAGCTGCAGGGTCACTCAGGATGTG 148
Query 149 TCAACTGTCTGGAGTGGAATGAGAAAGGAGACTTGCTGGCCTCTGGTTCCGATGACCAGCACACGATTGTGTGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAACTGTCTGGAGTGGAATGAGAAAGGAGACTTGCTGGCCTCTGGTTCCGATGACCAGCACACGATTGTGTGG 222
Query 223 GACCCGCTGCACCACAAGAAGCTGCTCTCCATGCACACGGGACACACCGCAAATATCTTCTCTGTCAAGTTCCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCCGCTGCACCACAAGAAGCTGCTCTCCATGCACACGGGACACACCGCAAATATCTTCTCTGTCAAGTTCCT 296
Query 297 GCCTCACGCTGGGGACCGCATCTTGATCACGGGGGCAGCCGACTCTAAGGTGCATGTGCACGACCTGACAGTAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCTCACGCTGGGGACCGCATCTTGATCACGGGGGCAGCCGACTCTAAGGTGCATGTGCACGACCTGACAGTAA 370
Query 371 AGGAGACCATCCACATGTTTGGAGACCACACAAACCGGGTGAAGCGCATCGCCACAGCGCCCATGTGGCCCAAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGAGACCATCCACATGTTTGGAGACCACACAAACCGGGTGAAGCGCATCGCCACAGCGCCCATGTGGCCCAAC 444
Query 445 ACATTCTGGAGTGCTGCTGAGGATGGGCTTATCCGCCAGTATGACCTTCGAGAGAACAGCAAACACTCGGAGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACATTCTGGAGTGCTGCTGAGGATGGGCTTATCCGCCAGTATGACCTTCGAGAGAACAGCAAACACTCGGAGGT 518
Query 519 GCTGATTGACCTGACAGAGTACTGTGGCCAGCTGGTGGAGGCCAAGTGCCTCACTGTCAACCCCCAGGACAACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGATTGACCTGACAGAGTACTGTGGCCAGCTGGTGGAGGCCAAGTGCCTCACTGTCAACCCCCAGGACAACA 592
Query 593 ACTGCCTGGCAGTTGGGGCCAGCGGGCCCTTCGTGAGGCTCTATGACATCCGCATGATCCATAACCACAGAAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTGCCTGGCAGTTGGGGCCAGCGGGCCCTTCGTGAGGCTCTATGACATCCGCATGATCCATAACCACAGAAAG 666
Query 667 AGCATGAAGCAGAGCCCTTCAGCGGGTGTGCACACCTTCTGTGACCGGCAGAAACCCCTTCCGGACGGTGCAGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCATGAAGCAGAGCCCTTCAGCGGGTGTGCACACCTTCTGTGACCGGCAGAAACCCCTTCCGGACGGTGCAGC 740
Query 741 CCAGTATTACGTAGCAGGTCACCTGCCAGTGAAGCTTCCTGACTACAACAACCGTTTGAGAGTGCTGGTTGCCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCAGTATTACGTAGCAGGTCACCTGCCAGTGAAGCTTCCTGACTACAACAACCGTTTGAGAGTGCTGGTTGCCA 814
Query 815 CCTATGTGACCTTCAGCCCCAATGGCACAGAGCTACTAGTCAACATGGGGGGGGAACAGGTCTATTTGTTTGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCTATGTGACCTTCAGCCCCAATGGCACAGAGCTACTAGTCAACATGGGGGGGGAACAGGTCTATTTGTTTGAC 888
Query 889 TTGACTTACAAGCAGCGGCCGTACACCTTCCTCTTGCCTAGAAAATGCCACTCCTCGGGG---GTCCAGAATGG 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 889 TTGACTTACAAGCAGCGGCCGTACACCTTCCTCTTGCCTAGAAAATGCCACTCCTCGGGGGAAGTCCAGAATGG 962
Query 960 CAAGATGTCCACCAACGGTGTGTCCAACGGTGTGTCCAATGGCCTGCACCTTCATAGCAATGGCTTCCGGCTGC 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGATGTCCACCAACGGTGTGTCCAACGGTGTGTCCAATGGCCTGCACCTTCATAGCAATGGCTTCCGGCTGC 1036
Query 1034 CGGAGAGTAGGGGACATGTCAGCCCCCAAGTAGAGCTACCACCATACCTGGAGCGTGTGAAACAGCAAGCCAAT 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGGAGAGTAGGGGACATGTCAGCCCCCAAGTAGAGCTACCACCATACCTGGAGCGTGTGAAACAGCAAGCCAAT 1110
Query 1108 GAGGCTTTTGCCTGCCAGCAGTGGACCCAAGCCATTCAGCTTTACAGCAAGGCTGTGCAGAGGGCCCCTCACAA 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGGCTTTTGCCTGCCAGCAGTGGACCCAAGCCATTCAGCTTTACAGCAAGGCTGTGCAGAGGGCCCCTCACAA 1184
Query 1182 TGCCATGCTTTATGGAAACCGAGCAGCAGCCTACATGAAGCGCAAGTGGGATGGTGACCACTATGATGCCCTGA 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCATGCTTTATGGAAACCGAGCAGCAGCCTACATGAAGCGCAAGTGGGATGGTGACCACTATGATGCCCTGA 1258
Query 1256 GGGACTGCCTCAAGGCCATCTCCCTAAACCCATGCCACCTGAAGGCACACTTTCGCCTGGCCCGCTGCCTCTTT 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGACTGCCTCAAGGCCATCTCCCTAAACCCATGCCACCTGAAGGCACACTTTCGCCTGGCCCGCTGCCTCTTT 1332
Query 1330 GAGCTCAAGTATGTGGCTGAAGCCCTGGAGTGCCTGGACGACTTCAAAGGGAAATTTCCGGAGCAGGCCCACAG 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGCTCAAGTATGTGGCTGAAGCCCTGGAGTGCCTGGACGACTTCAAAGGGAAATTTCCGGAGCAGGCCCACAG 1406
Query 1404 CAGCGCTTGTGATGCATTGGGCCGCGACATCACAGCTGCCCTCTTCTCTAAAAATGATGGTGAGGAGAAGAAGG 1477
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAGCGCTTGTGATGCATTGGGCCGCGACATCACAGCTGCCCTCTTCTCTAAAAATGATGGT------------- 1467
Query 1478 GACCTGGTGGCGGCGCCCCAGTCCGCCTCCGCAGCACGAGCCGCAAGGACT------CCATCTCAGAGGATGAA 1545
||.||| ||.||| |||| ||.| ||.|||
Sbjct 1468 --------------GCTCCA--CCACCT-------------------GACTGTGTGGCCTT-------GAAGAA 1499
Query 1546 ATGGTGCTGCGGGAGCGAAGCTACGACTATCAGTTCCGCTACTGCGGCCACTGCAACACCACCACGGATATCAA 1619
|||..||| ||.|| |.| |||| ||||| |||
Sbjct 1500 -------------AGCACAGC-----CTCTC--TAC--CTAC--------CTGCA----------------CAA 1527
Query 1620 AGAGGCCAATTTCTTTGGCAGCAACGCTCAGTATATCGTCAGTGGCTCTGACGATGGCTCCTTCTTCATCTGGG 1693
||| |||..|| ||.|||.|.| |||||
Sbjct 1528 AGA--------------GCACGAA--------------------GCCCTGCCCA--GCTCC------------- 1552
Query 1694 AAAAGGAGACCACCAACCTGGTCCGTGTGCTCCAAGG-GGATGAGTCCATTGTCAACTGCCTGCAGCCACACCC 1766
|| ||.||||||| || |.||| |||||
Sbjct 1553 ---------CC----------TCAGTGTGCT----GGAGAATG-----------AACTG--------------- 1577
Query 1767 CAGCTACTGCTTCCTGGCCACCAGTGGCATC-GATCCTGTTGTGCGGCTCTGGAACCCCCGACCAGAGAGTGAA 1839
||| |||| || |||.|| ||||.||.| |||||
Sbjct 1578 ---------------GGC---------CATCGGA-------GTGTGG-TCTGTAAAC------------GTGAA 1607
Query 1840 ----GACCTCACAGGCCGAGTCGTGGAAGATATGGAGGGTGCTTCA-------------CAG---GCCAACCAG 1893
||.||||.|| |.||.|||.||||| .||||| ||| .|||||||
Sbjct 1608 CGGTGAGCTCATAG--------GAGGCAGACATGGA----TCTTCACCTCTCTCCTTTGCAGTTTACCAACCA- 1668
Query 1894 CGGCG------------------CATGAAT-----GCAGACCCGTTGGAGGTGATGCTGCTCAACATGGGCTAC 1944
|| .|||||| .|||||.| |||| ||||.||
Sbjct 1669 ---CGTGATAAATTAATTTGTTTAATGAATAGTTATCAGACAC-------------CTGC----CATGTGC--- 1719
Query 1945 CGGATCACGGGC-CTGAGCAGTGGGGGTGCCGGGGCCTCTGATGAT-GAGGACAGCTCTGAGGGCCAGGTGCAG 2016
|.||| || ||||.|||.|||..|| || ||| |||
Sbjct 1720 -------CAGGCACT-----------GTGCTGGGTCCTGGGA--ATAGAG-------CTG-------------- 1752
Query 2017 TGCCGGCCCAGC 2028
Sbjct 1753 ------------ 1752