Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000476703
Subject:
NM_001114125.1
Aligned Length:
3397
Identities:
2794
Gaps:
290

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCCGACTCCCTCCTGGACCCAGGCGACTCCTACGAGTCGCCCCAAGAAAGGCCGGGCTCCCGGCGGAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTTCCCGGCAGCATGTCAGAGAAAAACCCCAGCATGGAGCCCTCGGCTTCAACCCCGTTCCGGGTCACGGGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCCTCAGCCGCCGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAACTGGACCGCAACCACAGCTTC  222

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGCCGAG  8
                                                                              |||||.||
Sbjct  223  CGCCACATCCTGCCGGGGTTCCGGAGCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCAAG  296

Query    9  GCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGG  82
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGAAGGAGTCTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCTCAGCATGG  370

Query   83  AGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCA  156
            ||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  371  AGGAGGAGGTGATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACAACATCA  444

Query  157  TCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGT  230
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||
Sbjct  445  TCAGGAAGCAAGTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGGCGAGCAGT  518

Query  231  GCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGC  304
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  519  GCACCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAAGGATCTGC  592

Query  305  CAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAG  378
            |.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||
Sbjct  593  CGGCCAAGAAGAAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCAAGCTCAAG  666

Query  379  ACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCT  452
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  ACGGACAATGTCTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACTGTGCACCT  740

Query  453  GTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCT  526
            |||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  GTATCGGGAGACTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCCTGCCGCCT  814

Query  527  CGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCT  600
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  815  CTGTGGCTGGGCGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCAAAGGCCCT  888

Query  601  GGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGC  674
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  889  GGGCCCATGATCCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAGGAGTTTGC  962

Query  675  TGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGG  748
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGCACATCACTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGG  1036

Query  749  AGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATG  822
            |||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATGGCGTCGGCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACCTGATGATG  1110

Query  823  TCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGA  896
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  TCAGAGGTGGACCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATCGA  1184

Query  897  GGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGT  970
            |||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  GGAATACCTCAAACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCTGTATGAGT  1258

Query  971  CAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAG  1044
            |||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGATGAAAATTGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCAACCTCAAG  1332

Query 1045  ATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTT  1118
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct 1333  ATGTGCTGTGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAGGAGGTGTT  1406

Query 1119  TGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCT  1192
            .|||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGCCTCATGGCGGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGCCTCCCTCT  1480

Query 1193  TCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGC  1266
            ||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1481  TCCTTCGCTTCCTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTGACGACCGC  1554

Query 1267  ACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGA  1340
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  ACGGCTCGCACCCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGCAGCAAGGA  1628

Query 1341  GGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCT  1414
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1629  AGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTTGGAGATCT  1702

Query 1415  CCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTG  1488
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1703  CCAACCCCGAGACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCTCTAGCCTG  1776

Query 1489  CACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGAT  1562
            |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777  CACTCCCTGCTCTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTGCCTCGTAT  1850

Query 1563  CCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCA  1636
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTGAGGGATGTCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCTGGCCTCCA  1924

Query 1637  CACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTG  1710
            |.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||
Sbjct 1925  CCCCGGGCTCCGGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCTCTGGTCTG  1998

Query 1711  ATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGT  1784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGT  2072

Query 1785  CCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCA  1858
            ||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||..|||
Sbjct 2073  CCAGCCTTCACCTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAATGGCAGCA  2146

Query 1859  AGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGAC  1932
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||
Sbjct 2147  AGAGCCTGTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGGGCCCAGAC  2220

Query 1933  GTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAA  2006
            |.|||.||..|.||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||.
Sbjct 2221  GCCCTACCTGCTGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCCCCAGTGAG  2294

Query 2007  CCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCA  2079
            |||||||||..|||||||.||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2295  CCTGGCAGGATTGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGTGCACCA  2367

Query 2080  GGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTC  2153
            ||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2368  GGACGGCCCCAGTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTGCCACTGTC  2441

Query 2154  ACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGG  2227
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|||
Sbjct 2442  ACCCCGTGGCCTTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGAAGAGCTGG  2515

Query 2228  CGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGG  2301
            |.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 2516  CAGCCGCTGCCAAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAACTGGCACGG  2589

Query 2302  CGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAG  2375
            .|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.||||||.||||
Sbjct 2590  AGGCAGATGTCACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCCCAGCGGAG  2663

Query 2376  GATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGA  2449
            |||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.||||||||
Sbjct 2664  GATTGACCAGCCGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTACCCTGCTGA  2737

Query 2450  GCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACC  2523
            |||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..|||||..|.|||
Sbjct 2738  GCACCCTACAGTACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCCCTGGCACC  2811

Query 2524  CGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGG  2597
            ||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..|||||||||||||
Sbjct 2812  CGGCTGCGGCAACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCACAAGCAGGG  2885

Query 2598  CCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAG  2671
            |||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886  CCCTTCACCCGTCAGTCCCAATGCCCTGGACCGCACGGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAG  2959

Query 2672  AAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAA  2745
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2960  AAGACGAGGGTCTGGGCCCAGATCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGAGGAACTCAGCCAAGCAGAA  3033

Query 2746  AAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAA  2819
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3034  AAGGATCTGGCAGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTATTCAA  3107

Query 2820  GTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGC  2893
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 3108  GTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGAGCGGCTGC  3181

Query 2894  GGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTG  2967
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 3182  GGCGGCAGCAGGAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAGAAGAACTG  3255

Query 2968  AAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCAT  3041
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 3256  AAGAAGGATCATGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAAAAGCGCAT  3329

Query 3042  TGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGTATGCAT  3108
            |||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3330  TGCCTCGCTGGATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGTATGCAT  3396