Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476703
• Subject: NM_001290640.1
• Aligned Length: 3337
• Identities: 2793
• Gaps: 230

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCCTCTGTGGCCTTGGACTCCTCGGTGACAACCTTGGCAAGATCCTGTGCTGGTCTGGAGGTGCCACTCT  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGCCGA  7
                                                                               |||||.|
Sbjct   75  CTGGAGGCCCAGCCATCCTCGGAAGCCTCATCTGGCTGCTGGGCCTCAGATGCCCAGGTCCCATCTGATGCCAA  148

Query    8  GGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATG  81
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GGCTGAAGGAGTCTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCTCAGCATG  222

Query   82  GAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTC  155
            |||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  223  GAGGAGGAGGTGATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACAACATC  296

Query  156  ATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGG  229
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|
Sbjct  297  ATCAGGAAGCAAGTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGGCGAGCAG  370

Query  230  TGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTG  303
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  371  TGCACCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAAGGATCTG  444

Query  304  CCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAA  377
            ||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct  445  CCGGCCAAGAAGAAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCAAGCTCAA  518

Query  378  GACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACC  451
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  519  GACGGACAATGTCTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACTGTGCACC  592

Query  452  TGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCC  525
            ||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGTATCGGGAGACTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCCTGCCGCC  666

Query  526  TCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCC  599
            ||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  TCTGTGGCTGGGCGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCAAAGGCCC  740

Query  600  TGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCG  673
            |||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  TGGGCCCATGATCCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAGGAGTTTG  814

Query  674  CTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAG  747
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGGAGCACATCACTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAG  888

Query  748  GAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGAT  821
            ||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  889  GAGATGGCGTCGGCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACCTGATGAT  962

Query  822  GTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTG  895
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  GTCAGAGGTGGACCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATCG  1036

Query  896  AGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAG  969
            ||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  AGGAATACCTCAAACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCTGTATGAG  1110

Query  970  TCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAA  1043
            ||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAGATGAAAATTGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCAACCTCAA  1184

Query 1044  GATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGT  1117
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.|||||||
Sbjct 1185  GATGTGCTGTGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAGGAGGTGT  1258

Query 1118  TTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTC  1191
            |.|||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGCCTCATGGCGGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGCCTCCCTC  1332

Query 1192  TTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCG  1265
            |||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1333  TTCCTTCGCTTCCTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTGACGACCG  1406

Query 1266  CACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGG  1339
            |||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  CACGGCTCGCACCCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGCAGCAAGG  1480

Query 1340  AGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATC  1413
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1481  AAGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTTGGAGATC  1554

Query 1414  TCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCT  1487
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1555  TCCAACCCCGAGACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCTCTAGCCT  1628

Query 1488  GCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGA  1561
            ||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1629  GCACTCCCTGCTCTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTGCCTCGTA  1702

Query 1562  TCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCC  1635
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCCTGAGGGATGTCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCTGGCCTCC  1776

Query 1636  ACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCT  1709
            ||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 1777  ACCCCGGGCTCCGGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCTCTGGTCT  1850

Query 1710  GATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGG  1783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGG  1924

Query 1784  TCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGC  1857
            |||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||..||
Sbjct 1925  TCCAGCCTTCACCTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAATGGCAGC  1998

Query 1858  AAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGA  1931
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.||
Sbjct 1999  AAGAGCCTGTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGGGCCCAGA  2072

Query 1932  CGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGA  2005
            ||.|||.||..|.||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||
Sbjct 2073  CGCCCTACCTGCTGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCCCCAGTGA  2146

Query 2006  ACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCC  2078
            .|||||||||..|||||||.||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2147  GCCTGGCAGGATTGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGTGCACC  2219

Query 2079  AGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGT  2152
            |||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2220  AGGACGGCCCCAGTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTGCCACTGT  2293

Query 2153  CACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTG  2226
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.||
Sbjct 2294  CACCCCGTGGCCTTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGAAGAGCTG  2367

Query 2227  GCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACG  2300
            ||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.||||||||
Sbjct 2368  GCAGCCGCTGCCAAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAACTGGCACG  2441

Query 2301  GCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGA  2374
            |.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.||||||.|||
Sbjct 2442  GAGGCAGATGTCACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCCCAGCGGA  2515

Query 2375  GGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTG  2448
            ||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.|||||||
Sbjct 2516  GGATTGACCAGCCGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTACCCTGCTG  2589

Query 2449  AGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTAC  2522
            ||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..|||||..|.||
Sbjct 2590  AGCACCCTACAGTACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCCCTGGCAC  2663

Query 2523  CCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGG  2596
            |||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||
Sbjct 2664  CCGGCTGCGGCAACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCACAAGCAGG  2737

Query 2597  GCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTA  2670
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738  GCCCTTCACCCGTCAGTCCCAATGCCCTGGACCGCACGGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTA  2811

Query 2671  GAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGA  2744
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2812  GAAGACGAGGGTCTGGGCCCAGATCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGAGGAACTCAGCCAAGCAGA  2885

Query 2745  AAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCA  2818
            ||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2886  AAAGGATCTGGCAGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTATTCA  2959

Query 2819  AGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTG  2892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2960  AGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGAGCGGCTG  3033

Query 2893  CGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACT  2966
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 3034  CGGCGGCAGCAGGAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAGAAGAACT  3107

Query 2967  GAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCA  3040
            |||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 3108  GAAGAAGGATCATGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAAAAGCGCA  3181

Query 3041  TTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT----  3108
            ||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| .||||    
Sbjct 3182  TTGCCTCGCTGGATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAA  3255

Query 3109  --------------------------------------------------------------------------  3108
                                                                                      
Sbjct 3256  GCCCGTAACGGCGTCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAG  3329

Query 3109  -------  3108
                   
Sbjct 3330  CAATTGT  3336