Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476703
• Subject: XM_005251721.1
• Aligned Length: 3483
• Identities: 3107
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCCGACTCCCTTCTGGACCAAGACGACTCCTACGAGTCGCCTCAAGAAAGGCCGGGCTCTCGGCGCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTGCCTGGCAGCCTTTCCGAGAAGAGCCCCAGCATGGAGCCCTCGGCCGCCACGCCGTTCCGGGTCACGGGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCCTCAGCCGCCGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAGCTGGACCGCAACCACAGCTTC  222

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGCCGAG  8
                                                                              ||||||||
Sbjct  223  CGCCACATCCTGCCGGGGTTCCGGAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCGAG  296

Query    9  GCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGG  82
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGG  370

Query   83  AGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCA  156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCA  444

Query  157  TCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGT  230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGT  518

Query  231  GCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGC  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGC  592

Query  305  CAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAG  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAG  666

Query  379  ACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCT  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCT  740

Query  453  GTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCT  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCT  814

Query  527  CGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCT  888

Query  601  GGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGC  674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGC  962

Query  675  TGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGG  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGG  1036

Query  749  AGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATG  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATG  1110

Query  823  TCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGA  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGA  1184

Query  897  GGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGT  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGT  1258

Query  971  CAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAG  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAG  1332

Query 1045  ATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTT  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTT  1406

Query 1119  TGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCT  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCT  1480

Query 1193  TCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGC  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGC  1554

Query 1267  ACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGA  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGA  1628

Query 1341  GGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCT  1414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCT  1702

Query 1415  CCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTG  1488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTG  1776

Query 1489  CACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGAT  1562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGAT  1850

Query 1563  CCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCA  1636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCA  1924

Query 1637  CACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTG  1710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTG  1998

Query 1711  ATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGT  1784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGT  2072

Query 1785  CCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCA  1858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCA  2146

Query 1859  AGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGAC  1932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGAC  2220

Query 1933  GTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAA  2006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAA  2294

Query 2007  CCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAG  2080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAG  2368

Query 2081  GCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCA  2154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCA  2442

Query 2155  CCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGC  2228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGC  2516

Query 2229  GGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGC  2302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGC  2590

Query 2303  GACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGG  2376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGG  2664

Query 2377  ATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAG  2450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAG  2738

Query 2451  CACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCC  2524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCC  2812

Query 2525  GCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGC  2598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGC  2886

Query 2599  CCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGA  2672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGA  2960

Query 2673  AGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAA  2746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAA  3034

Query 2747  AGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAG  2820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAG  3108

Query 2821  TGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCG  2894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCG  3182

Query 2895  GCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGA  2968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGA  3256

Query 2969  AGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATT  3042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATT  3330

Query 3043  GCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT------  3108
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| .||||      
Sbjct 3331  GCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAAGC  3404

Query 3109  --------------------------------------------------------------------------  3108
                                                                                      
Sbjct 3405  CCGTAACGGCATCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAGCA  3478

Query 3109  -----  3108
                 
Sbjct 3479  ATTGT  3483