Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476703
• Subject: XM_006498304.3
• Aligned Length: 3547
• Identities: 2793
• Gaps: 440

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCGCTGGGCGCTCGGCCGGCCGAGCGCTCGCCTGGGCCTCCCTGCCGCTGCTGGGGCCTCCCGCGGGCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACTCTGCGGGGACACGCTCTGCAGCAGAGAGTCGCCCCAAGAAAGGCCGGGCTCCCGGCGGAGCCTTCCCGGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCATGTCAGAGAAAAACCCCAGCATGGAGCCCTCGGCTTCAACCCCGTTCCGGGTCACGGGCTTCCTCAGCCGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAACTGGACCGCAACCACAGCTTCCGCCACATCCT  296

Query    1  -------------------------------------------------------ATGCCGAGGCTGAAGGAGT  19
                                                                   |||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GCCGGGGTTCCGGAGCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCAAGGCTGAAGGAGT  370

Query   20  CTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTG  93
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  CTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCTCAGCATGGAGGAGGAGGTG  444

Query   94  GTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAA  167
            .|.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  ATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACAACATCATCAGGAAGCAA  518

Query  168  GTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACA  241
            |||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||||
Sbjct  519  GTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGGCGAGCAGTGCACCCCAACA  592

Query  242  AGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAG  315
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  593  AGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAAGGATCTGCCGGCCAAGAAG  666

Query  316  AAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGT  389
            |||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCAAGCTCAAGACGGACAATGT  740

Query  390  TTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGA  463
            .||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  CTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACTGTGCACCTGTATCGGGAGA  814

Query  464  CCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGG  537
            |.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  815  CTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCCTGCCGCCTCTGTGGCTGGG  888

Query  538  CGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGAT  611
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct  889  CGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCAAAGGCCCTGGGCCCATGAT  962

Query  612  CCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCA  685
            |||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  963  CCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAGGAGTTTGCGGAGCACATCA  1036

Query  686  CCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCT  759
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1037  CTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCGTCG  1110

Query  760  GCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGA  833
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGA  1184

Query  834  CCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCA  907
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185  CCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATCGAGGAATACCTCA  1258

Query  908  AGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAAC  981
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259  AACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCTGTATGAGTCAGATGAAAAT  1332

Query  982  TGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGA  1055
            ||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1333  TGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGTGA  1406

Query 1056  GCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGA  1129
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1407  GCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAGGAGGTGTTCGCCTCATGGC  1480

Query 1130  GGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTC  1203
            ||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  GGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTTCGCTTC  1554

Query 1204  CTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCAC  1277
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1555  CTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTGACGACCGCACGGCTCGCAC  1628

Query 1278  CCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGT  1351
            ||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629  CCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGCAGCAAGGAAGAATACATGT  1702

Query 1352  CCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAG  1425
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTTGGAGATCTCCAACCCCGAG  1776

Query 1426  ACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCT  1499
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1777  ACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCTCTAGCCTGCACTCCCTGCT  1850

Query 1500  CTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACG  1573
            ||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1851  CTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTGCCTCGTATCCTGAGGGATG  1924

Query 1574  TCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCT  1647
            |||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1925  TCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCTGGCCTCCACCCCGGGCTCC  1998

Query 1648  GGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCAC  1721
            ||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCTCTGGTCTGATAGATTTCAC  2072

Query 1722  CCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCAC  1795
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073  CCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCTTCAC  2146

Query 1796  CTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCC  1869
            |||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||..||||||||||.|||
Sbjct 2147  CTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAATGGCAGCAAGAGCCTGTCC  2220

Query 1870  ATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCAC  1943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.||||.|||.||..|
Sbjct 2221  ATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGGGCCCAGACGCCCTACCTGC  2294

Query 1944  AGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGC  2017
            .||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||.|||||||||..
Sbjct 2295  TGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCCCCAGTGAGCCTGGCAGGAT  2368

Query 2018  TGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCA  2090
            |||||||.||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 2369  TGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGTGCACCAGGACGGCCCCA  2441

Query 2091  GCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCC  2164
            |.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2442  GTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTGCCACTGTCACCCCGTGGCC  2515

Query 2165  TTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCC  2238
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.||||.||.||||||
Sbjct 2516  TTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGAAGAGCTGGCAGCCGCTGCC  2589

Query 2239  AAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTC  2312
            ||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||.|.||||||||
Sbjct 2590  AAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAACTGGCACGGAGGCAGATGTC  2663

Query 2313  ACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGC  2386
            |||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 2664  ACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCCCAGCGGAGGATTGACCAGC  2737

Query 2387  CTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAG  2460
            |.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.|||||||||||||||.|||
Sbjct 2738  CGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTACCCTGCTGAGCACCCTACAG  2811

Query 2461  TACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCA  2534
            ||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..|||||..|.|||||.|||.||||
Sbjct 2812  TACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCCCTGGCACCCGGCTGCGGCA  2885

Query 2535  GCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTG  2608
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2886  ACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCACAAGCAGGGCCCTTCACCCG  2959

Query 2609  TGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGC  2682
            |.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2960  TCAGTCCCAATGCCCTGGACCGCACGGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGT  3033

Query 2683  CTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGC  2756
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3034  CTGGGCCCAGATCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGAGGAACTCAGCCAAGCAGAAAAGGATCTGGC  3107

Query 2757  GGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGG  2830
            .|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 3108  AGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTATTCAAGTGCCAGGAGG  3181

Query 2831  AGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAG  2904
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182  AGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAG  3255

Query 2905  GAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCA  2978
            ||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 3256  GAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAGAAGAACTGAAGAAGGATCA  3329

Query 2979  CGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGG  3052
            .||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 3330  TGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAAAAGCGCATTGCCTCGCTGG  3403

Query 3053  ATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT----------------  3108
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| .||||                
Sbjct 3404  ATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAAGCCCGTAACGGC  3477

Query 3109  ---------------------------------------------------------------------  3108
                                                                                 
Sbjct 3478  GTCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAGCAATTGT  3546