Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476703
• Subject: XM_011239172.2
• Aligned Length: 3568
• Identities: 2727
• Gaps: 527

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCGCCGGCGGCAACGCCAGGAAGAGCACCGGGAGGCCATCCTACTACTACCGGCTGCTGCGGCGGCCCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCTGCAGCGACAGAGGAGCCGCTCCCGCAGCCGGACCCGGCCAGCCAGGGAGTCGCCCCAAGAAAGGCCGGGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCCGGCGGAGCCTTCCCGGCAGCATGTCAGAGAAAAACCCCAGCATGGAGCCCTCGGCTTCAACCCCGTTCCGG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCACGGGCTTCCTCAGCCGCCGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAACTGGACCGCAA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CCACAGCTTCCGCCACATCCTGCCGGGGTTCCGGAGCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATC  370

Query    1  --ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGAC  72
              |||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  371  TGATGCCAAGGCTGAAGGAGTCTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGAC  444

Query   73  CTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGT  146
            ||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCAGCATGGAGGAGGAGGTGATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGT  518

Query  147  GACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCC  220
            |||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..
Sbjct  519  GACAACATCATCAGGAAGCAAGTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGA  592

Query  221  GGCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCC  294
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  GGCGAGCAGTGCACCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCC  666

Query  295  AAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGG  368
            |||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|
Sbjct  667  AAGGATCTGCCGGCCAAGAAGAAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAG  740

Query  369  CAAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCA  442
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  CAAGCTCAAGACGGACAATGTCTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCA  814

Query  443  CTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTA  516
            ||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  CTGTGCACCTGTATCGGGAGACTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTG  888

Query  517  CCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGG  590
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  889  CCTGCCGCCTCTGTGGCTGGGCGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGG  962

Query  591  CAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACA  664
            |||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CAAAGGCCCTGGGCCCATGATCCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACA  1036

Query  665  AAGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAG  738
            |.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAGTTTGCGGAGCACATCACTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAG  1110

Query  739  ACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGA  812
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111  ACCAAGGAGGAGATGGCGTCGGCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGA  1184

Query  813  CCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCA  886
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCA  1258

Query  887  AGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCG  960
            |||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  AGGCCATCGAGGAATACCTCAAACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCT  1332

Query  961  CTGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGG  1034
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CTGTATGAGTCAGATGAAAATTGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGG  1406

Query 1035  CAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGA  1108
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 1407  CAACCTCAAGATGTGCTGTGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTA  1480

Query 1109  AAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGC  1182
            |.||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAGGTGTTCGCCTCATGGCGGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGC  1554

Query 1183  GCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCC  1256
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1555  GCCTCCCTCTTCCTTCGCTTCCTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCC  1628

Query 1257  TGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTG  1330
            |||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  TGACGACCGCACGGCTCGCACCCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTG  1702

Query 1331  GCAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTG  1404
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCAGCAAGGAAGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTG  1776

Query 1405  CTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCT  1478
            .|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1777  TTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCT  1850

Query 1479  CTCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCC  1552
            |||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1851  CTCTAGCCTGCACTCCCTGCTCTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTC  1924

Query 1553  TGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGAC  1626
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1925  TGCCTCGTATCCTGAGGGATGTCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGAC  1998

Query 1627  CTGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCT  1700
            |||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1999  CTGGCCTCCACCCCGGGCTCCGGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCT  2072

Query 1701  TTCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGT  1774
            .||.|                                                                  |||
Sbjct 2073  CTCTG------------------------------------------------------------------GGT  2080

Query 1775  CCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCC  1848
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 2081  CCTCCGGGGTCCAGCCTTCACCTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCC  2154

Query 1849  AACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGC  1922
            ||.||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.
Sbjct 2155  AATGGCAGCAAGAGCCTGTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGT  2228

Query 1923  GGGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAA  1996
            ||||||.||||.|||.||..|.||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.
Sbjct 2229  GGGCCCAGACGCCCTACCTGCTGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAG  2302

Query 1997  CCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGA  2069
            |||||||||.|||||||||..|||||||.||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2303  CCCCAGTGAGCCTGGCAGGATTGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGA  2375

Query 2070  GGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCC  2143
            |||.||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2376  GGGTGCACCAGGACGGCCCCAGTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCC  2449

Query 2144  TGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGC  2217
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2450  TGCCACTGTCACCCCGTGGCCTTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGT  2523

Query 2218  GAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGA  2291
            ||.|||.||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||
Sbjct 2524  GAAGAGCTGGCAGCCGCTGCCAAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGA  2597

Query 2292  GCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCC  2365
            .|||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.|
Sbjct 2598  ACTGGCACGGAGGCAGATGTCACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTC  2671

Query 2366  CCCAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCC  2439
            |||||.|||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.
Sbjct 2672  CCCAGCGGAGGATTGACCAGCCGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCT  2745

Query 2440  AACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGG  2513
            |.|||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..||
Sbjct 2746  ACCCTGCTGAGCACCCTACAGTACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGG  2819

Query 2514  CCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGC  2587
            |||..|.|||||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..|||
Sbjct 2820  CCCTGGCACCCGGCTGCGGCAACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGC  2893

Query 2588  ACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCG  2661
            |||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2894  ACAAGCAGGGCCCTTCACCCGTCAGTCCCAATGCCCTGGACCGCACGGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCG  2967

Query 2662  CAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAG  2735
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2968  CAGTTGTTAGAAGACGAGGGTCTGGGCCCAGATCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGAGGAACTCAG  3041

Query 2736  CCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGA  2809
            |||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042  CCAAGCAGAAAAGGATCTGGCAGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGA  3115

Query 2810  CCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAG  2883
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 3116  CCCTATTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAG  3189

Query 2884  GAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGA  2957
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3190  GAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGA  3263

Query 2958  GGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGG  3031
            .|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 3264  AGAAGAACTGAAGAAGGATCATGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGG  3337

Query 3032  AGAAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-  3103
            |.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| 
Sbjct 3338  AAAAGCGCATTGCCTCGCTGGATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTAC  3411

Query 3104  TGCAT---------------------------------------------------------------------  3108
            .||||                                                                     
Sbjct 3412  AGCATGCAAGCCCGTAACGGCGTCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAG  3485

Query 3109  ----------------  3108
                            
Sbjct 3486  AAACAGCAGCAATTGT  3501