Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476703
- Subject:
- XM_011239174.1
- Aligned Length:
- 3196
- Identities:
- 2582
- Gaps:
- 308
Alignment
Query 1 ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCT 74
|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGCCAAGGCTGAAGGAGTCTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCT 74
Query 75 CAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGA 148
||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGCATGGAGGAGGAGGTGATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGA 148
Query 149 CGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGG 222
|.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||
Sbjct 149 CAACATCATCAGGAAGCAAGTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGG 222
Query 223 CGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAA 296
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 CGAGCAGTGCACCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAA 296
Query 297 GGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCA 370
|||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||
Sbjct 297 GGATCTGCCGGCCAAGAAGAAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCA 370
Query 371 AGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACT 444
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 AGCTCAAGACGGACAATGTCTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACT 444
Query 445 GTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACC 518
||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GTGCACCTGTATCGGGAGACTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCC 518
Query 519 TGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCA 592
|||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 519 TGCCGCCTCTGTGGCTGGGCGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCA 592
Query 593 AGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAA 666
|.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 AAGGCCCTGGGCCCATGATCCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAG 666
Query 667 GAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGAC 740
|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGTTTGCGGAGCACATCACTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGAC 740
Query 741 CAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACC 814
|||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 741 CAAGGAGGAGATGGCGTCGGCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACC 814
Query 815 TGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAG 888
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAG 888
Query 889 GCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCT 962
|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 GCCATCGAGGAATACCTCAAACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCT 962
Query 963 GTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCA 1036
|||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 GTATGAGTCAGATGAAAATTGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCA 1036
Query 1037 ACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAA 1110
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.
Sbjct 1037 ACCTCAAGATGTGCTGTGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAG 1110
Query 1111 GAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGC 1184
||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGGTGTTCGCCTCATGGCGGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGC 1184
Query 1185 CTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTG 1258
||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185 CTCCCTCTTCCTTCGCTTCCTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTG 1258
Query 1259 ATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGC 1332
|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 ACGACCGCACGGCTCGCACCCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGC 1332
Query 1333 AGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCT 1406
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1333 AGCAAGGAAGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTT 1406
Query 1407 GGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCT 1480
||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 GGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCT 1480
Query 1481 CCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTG 1554
|.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1481 CTAGCCTGCACTCCCTGCTCTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTG 1554
Query 1555 CCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCT 1628
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1555 CCTCGTATCCTGAGGGATGTCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCT 1628
Query 1629 GGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTT 1702
|||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1629 GGCCTCCACCCCGGGCTCCGGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCT 1702
Query 1703 CCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCC 1776
|.| |||||
Sbjct 1703 CTG------------------------------------------------------------------GGTCC 1710
Query 1777 TCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAA 1850
||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1711 TCCGGGGTCCAGCCTTCACCTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAA 1784
Query 1851 CGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGG 1924
.||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||
Sbjct 1785 TGGCAGCAAGAGCCTGTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGG 1858
Query 1925 GCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACC 1998
||||.||||.|||.||..|.||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.||
Sbjct 1859 GCCCAGACGCCCTACCTGCTGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCC 1932
Query 1999 CCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGG 2071
|||||||.|||||||||..|||||||.||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 CCAGTGAGCCTGGCAGGATTGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGG 2005
Query 2072 GCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTG 2145
|.||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2006 GTGCACCAGGACGGCCCCAGTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTG 2079
Query 2146 CCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGA 2219
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2080 CCACTGTCACCCCGTGGCCTTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGA 2153
Query 2220 GGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGC 2293
.|||.||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.|
Sbjct 2154 AGAGCTGGCAGCCGCTGCCAAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAAC 2227
Query 2294 TGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCC 2367
||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 2228 TGGCACGGAGGCAGATGTCACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCC 2301
Query 2368 CAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAA 2441
|||.|||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.
Sbjct 2302 CAGCGGAGGATTGACCAGCCGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTAC 2375
Query 2442 CCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCC 2515
|||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..||||
Sbjct 2376 CCTGCTGAGCACCCTACAGTACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCC 2449
Query 2516 CCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCAC 2589
|..|.|||||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..|||||
Sbjct 2450 CTGGCACCCGGCTGCGGCAACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCAC 2523
Query 2590 AAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCA 2663
||||
Sbjct 2524 AAGC---------------------------------------------------------------------- 2527
Query 2664 GTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCC 2737
Sbjct 2528 -------------------------------------------------------------------------- 2527
Query 2738 AAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACC 2811
||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2528 ---------AGGATCTGGCAGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACC 2592
Query 2812 CTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGA 2885
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 2593 CTATTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGA 2666
Query 2886 GCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGG 2959
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2667 GCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAG 2740
Query 2960 AAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAG 3033
||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2741 AAGAACTGAAGAAGGATCATGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAA 2814
Query 3034 AAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TG 3105
|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| .|
Sbjct 2815 AAGCGCATTGCCTCGCTGGATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTACAG 2888
Query 3106 CAT----------------------------------------------------------------------- 3108
|||
Sbjct 2889 CATGCAAGCCCGTAACGGCGTCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAA 2962
Query 3109 -------------- 3108
Sbjct 2963 ACAGCAGCAATTGT 2976