Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476703
• Subject: XM_024447418.1
• Aligned Length: 3375
• Identities: 3107
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCCTCGGCCGCCACGCCGTTCCGGGTCACGGGCTTCCTCAGCCGCCGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACCAAGAGCCAGCCCAAGCTGGACCGCAACCACAGCTTCCGCCACATCCTGCCGGGGTTCCGGAGCGCCGCCG  148

Query    1  --------------------------------ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTC  42
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTC  222

Query   43  AGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAG  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAG  296

Query  117  CATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAG  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAG  370

Query  191  CTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAG  444

Query  265  CACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCT  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCT  518

Query  339  GGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGT  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGT  592

Query  413  TCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAG  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAG  666

Query  487  CGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTA  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTA  740

Query  561  CCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAA  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAA  814

Query  635  CCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGT  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGT  888

Query  709  GCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAG  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAG  962

Query  783  CACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACC  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACC  1036

Query  857  TCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTG  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTG  1110

Query  931  CAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTG  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTG  1184

Query 1005  CTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCA  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCA  1258

Query 1079  ACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGC  1152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGC  1332

Query 1153  CGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCC  1226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCC  1406

Query 1227  CTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCA  1300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCA  1480

Query 1301  CCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAG  1374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAG  1554

Query 1375  CATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTT  1448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTT  1628

Query 1449  CGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGG  1522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGG  1702

Query 1523  AGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCA  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCA  1776

Query 1597  GGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGG  1670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGG  1850

Query 1671  GCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCG  1744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCG  1924

Query 1745  AAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCG  1818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCG  1998

Query 1819  GAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCG  1892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCG  2072

Query 1893  CACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTC  1966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTC  2146

Query 1967  AGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGC  2040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGC  2220

Query 2041  CAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCA  2114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCA  2294

Query 2115  GAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCC  2188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCC  2368

Query 2189  ACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCC  2262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCC  2442

Query 2263  GCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCC  2336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCC  2516

Query 2337  CACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCAC  2410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCAC  2590

Query 2411  CTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACC  2484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACC  2664

Query 2485  CTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGA  2558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGA  2738

Query 2559  CAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCA  2632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCA  2812

Query 2633  CAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGG  2706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGG  2886

Query 2707  GATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAAT  2780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAAT  2960

Query 2781  CTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGG  2854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGG  3034

Query 2855  AGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAG  2928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAG  3108

Query 2929  GGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGA  3002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGA  3182

Query 3003  CTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGA  3076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGA  3256

Query 3077  GTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT----------------------------------------  3108
            |||||||||||||||||||||||| ||| .||||                                        
Sbjct 3257  GTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAAGCCCGTAACGGCATCTCCCCCACCAACCCCACCAAA  3330

Query 3109  ---------------------------------------------  3108
                                                         
Sbjct 3331  TTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAGCAATTGT  3375