Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476788
• Subject: NM_001129996.2
• Aligned Length: 1474
• Identities: 1256
• Gaps: 53

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCA----------------------------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGT  46
            ||||.| .|||||                            ||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATC-GATTCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA  73

Query   47  TCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAAC  120
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct   74  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC  147

Query  121  TTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCC------ACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTT  188
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||      |..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCATTCCATGGAGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTT  221

Query  189  TTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGAAATTCAGGCGGCA------------------AGACTATTG  244
            ||||.||||||.||||.|||.||||||||||||.||||..||.||||                  |||||.||.
Sbjct  222  TTGGGTGATGGGGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGAATTTGGGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTC  295

Query  245  CGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCT  318
            |.|||||||||.||||||||||.|...|.|||.|||||||.||||||||||.||||||||||||||||..||||
Sbjct  296  CAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCT  369

Query  319  CAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATC  392
            |||||..|||.|||||.|||.|||||.||.||||||||||.|||...||||||||||.||.|.|||.|||||||
Sbjct  370  CAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATC  443

Query  393  TATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCACAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTG  466
            ||.|.||||.|||.||.|.|||||||..|||..||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.||||||
Sbjct  444  TACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTG  517

Query  467  ATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGAGAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  540
            |||.||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  591

Query  541  TCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTCACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATT  614
            |||||.||||.||||||.|||||.||.|||.||.|||.||||..||.|||||||||..||.|||||||||||||
Sbjct  592  TCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATT  665

Query  615  CAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTG  688
            .||||||||||||.||||||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  666  TAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTG  739

Query  689  GGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGT  762
            ||||||||||||||||||||.|...||||.|||||||.|||||||||||||...|||||||||||||||.||||
Sbjct  740  GGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGT  813

Query  763  GAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCC  836
            |||||||||||||.|||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCC  887

Query  837  GTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAG  910
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  ATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAG  961

Query  911  CAGAGAAACTGTACAAATCTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATA  984
            ||||||||||||||||||||||..|||.|||||.|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  962  CAGAGAAACTGTACAAATCTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATG  1035

Query  985  ATTCACACAGGACAGAAACCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGAT  1058
            |||||.|..|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 1036  ATTCATATGGGACAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGT  1109

Query 1059  CCATCAGCGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAG  1132
            ||||||.|||.||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CCATCAACGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAG  1183

Query 1133  GTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGC  1206
            |||||.||||.|||||.||...|||.||.|||||||||.|||||||.|||.|..|.||.||||||||||||||.
Sbjct 1184  GTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGA  1257

Query 1207  CGGGCTTCAAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAA  1280
            |..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||.||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1258  CATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAA  1331

Query 1281  GAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGG  1354
            ||||||||||..||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1332  GAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGG  1405

Query 1355  ACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1406  ACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1473