Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476788
- Subject:
- NM_001260488.1
- Aligned Length:
- 1647
- Identities:
- 1261
- Gaps:
- 225
Alignment
Query 1 ATGACCA-------CA----------------TTCA----------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGC 41
||||..| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAAAGAGAAGCAAAGTACTTGTATTCTGTTCAAAGATTATGGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGC 74
Query 42 TGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTG 115
||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|
Sbjct 75 TGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGG 148
Query 116 AGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAA 183
|||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||| |||.|||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAA 222
Query 184 AAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGAAATTCAGGCGGCAAGA------------------C 239
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||| |
Sbjct 223 AAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTC 296
Query 240 TATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCC 313
|.||.|.|||||||||.||||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||.
Sbjct 297 TGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCA 370
Query 314 AGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGA 387
.||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 GGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGA 444
Query 388 CTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCACAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCAT 461
|||.|.|.||||||||||||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 445 CTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCAT 518
Query 462 CTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGAGAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTT 535
||||||||.||||||||||||..||||||.||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 519 CTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTT 592
Query 536 ACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTCACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAG 609
|||||||||||||||.|.||||.||||||||.|||.||.||||||||||||.||.||||||..||.||||.|||
Sbjct 593 ACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAG 666
Query 610 GAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCA 683
|||||.|||||.||||||..|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCA 740
Query 684 ATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATA 757
||||||||||||.|||||..|||||.|...||||.|.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 ATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACA 814
Query 758 TTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAG 831
||||||||..||||||||.||||||||||||.||||.|||||||.||.|||||.|||.|||.||||||||||||
Sbjct 815 TTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAG 888
Query 832 AAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGCCTTAGGTCAAG------------------------ 881
||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||...||||||||||
Sbjct 889 AAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCA 962
Query 882 ------------------------------------------------------------TCTTAATAGGCATT 895
.|||||||||||||
Sbjct 963 CACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATT 1036
Query 896 GCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTG 969
|||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||.||||||||||||||||.|.||.|||.||||||||.
Sbjct 1037 GCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTT 1110
Query 970 CATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTC 1043
.|||||||||||.|..|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTC 1184
Query 1044 CTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGAAAAA------------------------------- 1086
|||||..|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGAT 1258
Query 1087 -----------------------------------------------------CCATACAGATGTGAGGAGTGT 1107
|||||.|.|||||||||||||
Sbjct 1259 TTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGT 1332
Query 1108 GGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTG 1181
|||||||||||..|||.|||||....||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTG 1406
Query 1182 TAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAAC 1255
|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1407 TAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAAC 1480
Query 1256 CCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAAT 1329
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|.|.|.||||||||||.|...|||||.|.|.|
Sbjct 1481 CATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGT 1554
Query 1330 GGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATC 1403
||.||||||.||||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1555 GGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATC 1628
Query 1404 ATTATTTTTAAATGATATG 1422
|||||||.|||||||.|..
Sbjct 1629 ATTATTTCTAAATGACACA 1647