Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476788
- Subject:
- NM_013360.2
- Aligned Length:
- 1424
- Identities:
- 1188
- Gaps:
- 73
Alignment
Query 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT 74
|||.|.|...||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGG----- 143
Query 149 AACCATTCCACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAA--GAGAAG 220
|||.||| |.||||| ||||.|
Sbjct 144 --------------------------AGGCAAG--------------------------ATCCAAACTGAGATG 165
Query 221 GAAATTCAGGCGGCAAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAA 294
| |||||.||.|.|||||||||.||||||||||.|...|.|||.|||||||.|||||||||
Sbjct 166 G--------------AGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAA 225
Query 295 ACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCC 368
|.||||||||||||||||..|||||||||..|||.|||||.|||.|||||.||.||||||||||.|||...|||
Sbjct 226 ATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCC 299
Query 369 CTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCACAGAATGGGAAGTGTAAACAGT 442
|||||||.||.|.|||.|||||||||.|.||||.|||.||.|.|||||||..|||..||..||.||||||||||
Sbjct 300 CTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGT 373
Query 443 CCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGAGAAGTCTCATACATGCAATGAG 516
.|||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct 374 TCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAG 447
Query 517 TGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTCACTTGAGAGAGAAACTCTCTAA 590
|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||.||.|||.||.|||.||||..||.|||
Sbjct 448 TGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAA 521
Query 591 GTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAGAGA 664
||||||..||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 522 GTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGA 595
Query 665 AACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACAC 738
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|...||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 596 AACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACAC 669
Query 739 ACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACGATTTCCAGCTTCAGAAACATCA 812
|...|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 ATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCA 743
Query 813 GATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTA 886
.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 744 CAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTA 817
Query 887 ATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||.|||.||||.||||||.
Sbjct 818 ATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGG 891
Query 961 CTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTT 1034
|||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 CTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTT 965
Query 1035 CAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATACAGATGTGAGGAGTGTG 1108
||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct 966 CAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTG 1039
Query 1109 GGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGT 1182
|||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||...|||.||.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1040 GGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGT 1113
Query 1183 AAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACC 1256
.|..|.||.||||||||||||||.|..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||.||
Sbjct 1114 GATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCC 1187
Query 1257 CTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATG 1330
.||.||||||||.||.||||||||||||||||||..||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct 1188 ATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTG 1261
Query 1331 GAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCA 1404
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 GAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCA 1335
Query 1405 TTATTTTTAAATGATATG 1422
||||||||||||||.||.
Sbjct 1336 TTATTTTTAAATGACATA 1353