Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476799
• Subject: XM_011512738.2
• Aligned Length: 1638
• Identities: 1442
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGGCATGGCCCAAACTGCCCGCACCTTGGCTGCTGCTCTGCACCTGGCTCCCAGCAGGGTGCCTGTCCTTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCATGGCCCAAACTGCCCGCACCTTGGCTGCTGCTCTGCACCTGGCTCCCAGCAGGGTGCCTGTCCTTGCT  74

Query   75  TGTGACGGTCCAGCACACAGAACGCTATGTCACCCTGTTTGCCTCTATCATCCTCAAATGTGACTACACCACCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGACGGTCCAGCACACAGAACGCTATGTCACCCTGTTTGCCTCTATCATCCTCAAATGTGACTACACCACCT  148

Query  149  CTGCCCAGCTCCAGGACGTGGTGGTGACATGGCGCTTCAAGTCCTTCTGCAAGGACCCTATCTTTGACTACTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCCCAGCTCCAGGACGTGGTGGTGACATGGCGCTTCAAGTCCTTCTGCAAGGACCCTATCTTTGACTACTAC  222

Query  223  TCAGCGTCATACCAGGCAGCTTTATCCCTGGGCCAGGACCCATCCAATGACTGCAACGACAACCAGCGGGAAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGCGTCATACCAGGCAGCTTTATCCCTGGGCCAGGACCCATCCAATGACTGCAACGACAACCAGCGGGAAGT  296

Query  297  TCGCATAGTGGCCCAGCGGCGGGGGCAGAATGAGCCCGTGCTGGGGGTAGATTACCGGCAGCGCAAGATCACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGCATAGTGGCCCAGCGGCGGGGGCAGAATGAGCCCGTGCTGGGGGTAGATTACCGGCAGCGCAAGATCACCA  370

Query  371  TCCAGAACCGAGCAGATCTCGTGATAAATGAAGTGATGTGGTGGGACCATGGAGTGTATTACTGCACCATTGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCAGAACCGAGCAGATCTCGTGATAAATGAAGTGATGTGGTGGGACCATGGAGTGTATTACTGCACCATTGAG  444

Query  445  GCTCCAGGGGACACATCAGGAGACCCCGATAAGGAAGTAAAGCTCATCGTCCTACACTGGCTGACAGTGATCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTCCAGGGGACACATCAGGAGACCCCGATAAGGAAGTAAAGCTCATCGTCCTACACTGGCTGACAGTGATCTT  518

Query  519  CATCATCCTGGGAGCCCTCCTCCTCCTGCTGCTGATTGGAGTGTGCTGGTGCCAGTGCTGTCCTCAGTATTGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCATCCTGGGAGCCCTCCTCCTCCTGCTGCTGATTGGAGTGTGCTGGTGCCAGTGCTGTCCTCAGTATTGCT  592

Query  593  GCTGCTATATCCGCTGTCCCTGCTGTCCTGCCCACTGCTGCTGTCCTGAGGA----------------------  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct  593  GCTGCTATATCCGCTGTCCCTGCTGTCCTGCCCACTGCTGCTGTCCTGAGGAAGCCCTGGCCCGCCACCGCTAC  666

Query  645  --------------------------------------------------------------------------  644
                                                                                      
Sbjct  667  ATGAAGCAGGCCCAGGCCCTAGGTCCTCAGATGATGGGAAAACCCCTGTACTGGGGGGCGGACAGGAGCTCCCA  740

Query  645  ------------------------------------AGATTTGTCCCTGCCGTCCAGCCTCCCGCAGATGCCAA  682
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTTTCATCTTATCCAATGCACCCGCTGCTGCAGCGAGATTTGTCCCTGCCGTCCAGCCTCCCGCAGATGCCAA  814

Query  683  TGACCCAGACCACCAATCAGCCTCCCATCGCCAATGGTGTCCTGGAGTATTTGGAGAAAGAACTGCGGAACCTC  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGACCCAGACCACCAATCAGCCTCCCATCGCCAATGGTGTCCTGGAGTATTTGGAGAAAGAACTGCGGAACCTC  888

Query  757  AACCTGGCCCAGCCTCTGCCCCCTGACCTCAAAGGCAGATTTGGCCATCCCTGCAGCATGCTGTCCTCCCTGGG  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCTGGCCCAGCCTCTGCCCCCTGACCTCAAAGGCAGATTTGGCCATCCCTGCAGCATGCTGTCCTCCCTGGG  962

Query  831  CTCTGAGGTCGTGGAACGCAGAATCATCCACCTGCCCCCACTGATCAGAGACCTGTCATCCTCAAGGAGGACCA  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTGAGGTCGTGGAACGCAGAATCATCCACCTGCCCCCACTGATCAGAGACCTGTCATCCTCAAGGAGGACCA  1036

Query  905  GTGACTCCCTGCACCAGCAGTGGCTCACCCCAATTCCCTCCAGGCCCTGGGATCTGAGGGAGGGGAGAAGCCAC  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGACTCCCTGCACCAGCAGTGGCTCACCCCAATTCCCTCCAGGCCCTGGGATCTGAGGGAGGGGAGAAGCCAC  1110

Query  979  CACCATTACCCTGATTTCCACCAGGAGCTCCAGGACCGGGGGCCAAAGTCTTGGGCATTGGAAAGAAGGGAGTT  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACCATTACCCTGATTTCCACCAGGAGCTCCAGGACCGGGGGCCAAAGTCTTGGGCATTGGAAAGAAGGGAGTT  1184

Query 1053  GGACCCATCGTGGAGTGGAAGGCACCGTAGCTCTAGGCTGAATGGGTCACCCATACACTGGTCAGACAGGGACA  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGACCCATCGTGGAGTGGAAGGCACCGTAGCTCTAGGCTGAATGGGTCACCCATACACTGGTCAGACAGGGACA  1258

Query 1127  GCCTAAGCGATGTCCCCTCATCCAGTGAGGCACGCTGGCGGCCGAGCCACCCTCCTTTCAGGAGCCGCTGTCAG  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCTAAGCGATGTCCCCTCATCCAGTGAGGCACGCTGGCGGCCGAGCCACCCTCCTTTCAGGAGCCGCTGTCAG  1332

Query 1201  GAGAGGCCCCGCAGGCCCAGCCCCCGGGAGAGCACTCAGAGGCACGGGAGACGACGCAGGCACCGCAGCTACTC  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAGGCCCCGCAGGCCCAGCCCCCGGGAGAGCACTCAGAGGCACGGGAGACGACGCAGGCACCGCAGCTACTC  1406

Query 1275  TCCTCCCTTGCCCTCCGGCCTCAGTTCCTGGAGCTCTGAAGAGGACAAGGAGAGGCAGCCCCAGAGCTGGCGGG  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCTCCCTTGCCCTCCGGCCTCAGTTCCTGGAGCTCTGAAGAGGACAAGGAGAGGCAGCCCCAGAGCTGGCGGG  1480

Query 1349  CCCACCGCCGCGGCTCGCACTCCCCACACTGGCCCGAGGAGAAGCCGCCTAGCTACCGCTCACTGGATATCACT  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481  CCCACCGCCGCGGCTCGCACTCCCCACACTGGCCCGAGGAGAAGCCGCCTAGCTACCGCTCACTTGATATCACT  1554

Query 1423  CCAGGCAAGAATAGCAGGAAAAAAGGGAGTGTGGAGAGGCGCTCGGAGAAAGACAGCTCTCATAGTGGAAGGAG  1496
            |||                                         ||||||||||||||||||            
Sbjct 1555  CCA-----------------------------------------GGAGAAAGACAGCTCTCA------------  1575

Query 1497  TGTGGTCATT  1506
                      
Sbjct 1576  ----------  1575