Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476887
• Subject: NM_001145158.2
• Aligned Length: 2052
• Identities: 1926
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTC  74

Query   75  TGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCCG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct   75  TGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAAC-----------------------------------------  107

Query  149  TTGAGCCTGTGGAAGAATATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAGT  222
                                                                                      
Sbjct  108  --------------------------------------------------------------------------  107

Query  223  GGATTTGATCAAGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGA  296
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  108  -----------AGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGA  170

Query  297  AATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  171  AATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATA  244

Query  371  GAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245  GAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGAT  318

Query  445  TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAAC  392

Query  519  TATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  TATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCGC  466

Query  593  CCATTGAAGATGCCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTGCTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCACACGATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  467  CCATTGAAGATGCCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTGCTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCACACGATT  540

Query  667  CAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAATAGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  CAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAATAGATGT  614

Query  741  GAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTGATGCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  GAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTGATGCTG  688

Query  815  GGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAAGTATGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  GGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAAGTATGAA  762

Query  889  CAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAGAAAGGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  CAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAGAAAGGGA  836

Query  963  AAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATGGATGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837  AAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATGGATGCTC  910

Query 1037  CAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGTTGTAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911  CAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGTTGTAGAT  984

Query 1111  GCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGGTCCGTTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  985  GCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGGTCCGTTC  1058

Query 1185  TCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGGTTTCAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059  TCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGGTTTCAAG  1132

Query 1259  AGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTATTCCTACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133  AGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTATTCCTACA  1206

Query 1333  AGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAGGACTATG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207  AGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAGGACTATG  1280

Query 1407  TTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGTGTGTCCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281  TTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGTGTGTCCG  1354

Query 1481  ATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAACTGGTGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355  ATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAACTGGTGAC  1428

Query 1555  CGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTGTCGACTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429  CGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTGTCGACTG  1502

Query 1629  GGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGCTGCATAT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503  GGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGCTGCATAT  1576

Query 1703  TTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATATTGAAATT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577  TTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATATTGAAATT  1650

Query 1777  CCTATCACTAAAGGATTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAACGATTGAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651  CCTATCACTAAAGGATTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAACGATTGAT  1724

Query 1851  TAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAGAATGCAT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725  TAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAGAATGCAT  1798

Query 1925  TGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAGGTTCATG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799  TGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAGGTTCATG  1872

Query 1999  CTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA  2052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873  CTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA  1926