Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476887
- Subject:
- NM_019702.2
- Aligned Length:
- 2059
- Identities:
- 1757
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTC 74
|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1 ATGGCCCGGCATCGGAACGTCCGGGGATATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTGTATGGGCAGTC 74
Query 75 TGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCCG 148
|||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 75 TGTGGAGGATGACTACTGTATCTCACCATCAACAGCCGCTCAGTTCATTTACTCACGCCGTGACA--------- 139
Query 149 TTGAGCCTGTGGAAGAATATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAGT 222
|.||||..||||||||||..|||||||||||||.|||.|||||.||||||.|||..||.||.||..|.|||
Sbjct 140 ---ACCCTGAAGAAGAATATGGCTATGAAGATCTGAGAGAGTCTTCTAATTCTCTTTTGAATCACCAATTAAGT 210
Query 223 GGATTTGATCAAGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGA 296
|.|.||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 211 GAAATTGACCAAGCTCGCCTGTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTGGGGGACGCTGTGCCTGATGA 284
Query 297 AATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATA 370
.|||.|.|.|||.|||.|||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||.
Sbjct 285 CATACTGACTGAGGCAATTCTGAAACACAAATTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCCGTGGTTCTGGAACAAGATG 358
Query 371 GAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGAT 444
|.||||||..||.||||||.||||.||||..|.||||.|.|.|||||.||....|||||||||||.|||| .||
Sbjct 359 GTGTGCAGCCTTGGAAGGAGAAGAGTGAGCGAGCAGTGTGTGCAGGACAGCCTTCAAAAGGAAAATCAGT-TAT 431
Query 445 -TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAA 517
||.|.|.||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 432 ATCTCGGTCATCCCAGAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCCGGGAAGAAGCAGA 505
Query 518 CTATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCG 591
|.||||||||||||||||||||..||.|||||||.||||||||.|..|||.|.|.|.|.|||||.|||||.||.
Sbjct 506 CCATGGGATTTGAAGTGCCTGGCTTAACTTCTGAGGAAAATGGACTCAGTGTGCGCGCTCCTCACAAAGGGCCT 579
Query 592 CCCATTGAAGATG---CCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTG---CTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCA 659
||...|||.|||| .|.|.||||||.|..|..|||.||||||.| ||.|.||||||||....|||||.|.
Sbjct 580 CCTGGTGATGATGTGAGCGTAGCTTCTCCTAACATTCCTGAGACCGGCACTCCAAAATCTGCCCTCCCACCTCC 653
Query 660 CACGATTCAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAA 733
..|..|||||.||||||||||||.|.|.||.||.||..||||.||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 654 TTCCCTTCAAACATCAGAAGAGCTGGGCTCCACTCCGACACCAGTGAGAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAGA 727
Query 734 TAGATGTGAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTT 807
||||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 TAGACGTGAAAGCGGAATTGGAAAAGCGGCAGGGCGGGAAGCAGCTCCTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTT 801
Query 808 GATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAA 881
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 GATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATGTAAACAAAAGAACTATGCATAA 875
Query 882 GTATGAACAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAG 955
||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 876 GTATGAGCAAGAATCTAAAAAGGCTGGCAAGGCTTCATTTGCATATGCGTGGGTCTTGGATGAAACTGGAGAAG 949
Query 956 AAAGGGAAAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATG 1029
|||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 950 AAAGGGAAAGGGGAGTAACAATGGACGTCGGAATGACGAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACCTTAATG 1023
Query 1030 GATGCTCCAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGT 1103
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..|.||
Sbjct 1024 GATGCTCCAGGCCATAAGGATTTCATTCCAAACATGATCACAGGAGCAGCCCAGGCCGATGTCGCTGTCCTGGT 1097
Query 1104 TGTAGATGCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGG 1177
.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1098 CGTTGATGCCAGCAGAGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACGGGAGGACAGACCCGAGAGCATGGCCTTTTGG 1171
Query 1178 TCCGTTCTCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGG 1251
||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1172 TCCGATCTCTTGGAGTGACACAGCTTGCTGTGGCTGTCAATAAGATGGATCAGGTAAATTGGCAACAAGAAAGA 1245
Query 1252 TTTCAAGAGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTAT 1325
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1246 TTTCAAGAGATTACTGGAAAACTCGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGCTTTTAT 1319
Query 1326 TCCTACAAGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAG 1399
.||.||.||.|||||.||||||||.|||.|||.|.||||.||.|||||.|||||.|||||.|..|||||.||||
Sbjct 1320 CCCGACGAGCGGTCTGAGTGGTGAGAATTTAACCGCAAGGTCACAGTCCAGTGACCTCACGACGTGGTACAAAG 1393
Query 1400 GACTATGTTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGT 1473
|..|.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 GGATGTGCTTATTGGAGCAGATTGATTCCTTCAAGCCCCCTCAGCGCTCGATTGACAAACCTTTTAGATTATGT 1467
Query 1474 GTGTCCGATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAAC 1547
|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1468 GTGTCTGATGTCTTCAAAGATCAAGGATCTGGCTTTTGTGTGACTGGTAAAATTGAAGCTGGTTATATCCAGAC 1541
Query 1548 TGGTGACCGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTG 1621
||||||||||||..|.||.|||||.||.||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1542 TGGTGACCGACTGTTAGCCATGCCACCCAATGAAACCTGTACTGCTAAAGGAATCACTCTGCACGATGAGCCTG 1615
Query 1622 TCGACTGGGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGC 1695
||||.|||||.||||||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1616 TCGATTGGGCAGCAGCAGGCGATCACGTAAATCTTACCTTGGTTGGGATGGACATCATCAAAATCAATGTCGGC 1689
Query 1696 TGCATATTTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATAT 1769
||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1690 TGCATATTTTGTGGCCCCAAAGAACCCATTAAGGCTTGCACCCGCTTCAGAGCCCGAATCCTCGTCTTCAATAT 1763
Query 1770 TGAAATTCCTATCACTAAAGGATTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAAC 1843
||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1764 TGAAGTTCCGATCACTAAAGGGTTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACCGTCAGTGAGCCTGCTGTTATTAAGC 1837
Query 1844 GATTGATTAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAG 1917
||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..||||.||.||||||
Sbjct 1838 GATTGATTAGTGTCCTAAACAAAAGTACTGGTGAAGTCACAAAGAAGAAGCCCAAGTTGCTGACCAAGGGCCAG 1911
Query 1918 AATGCATTGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAG 1991
||.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct 1912 AACGCCTTGGTAGAGCTGCAGACACAAAGACCAGTGGCTCTTGAGCTCTACAAAGACTTCAAGGAGCTGGGGCG 1985
Query 1992 GTTCATGCTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA 2052
|||.|||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1986 GTTTATGCTGCGTTATGGTGGCTCCACAGTAGCTGCCGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAG 2046