Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476887
- Subject:
- XR_002956256.1
- Aligned Length:
- 2652
- Identities:
- 1825
- Gaps:
- 827
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGCGCAGAGGCCTGCGGGAAGCCAAGATGGCGCATAGGGGTTCTCCAGGCTGCAGTTGGCGCCTTATCAGTATC 74
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGGCCCGGCATCGGAA 17
|||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAGCGGAGTGTTTTGGAAGGAGTTAAGGGGCTGTGGCAAACGCCCTCTCCGCCGTCATGGCCCGGCATCGGAA 148
Query 18 TGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTCTGTAGAGGATGATTATT 91
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTCTGTAGAGGATGATTATT 222
Query 92 GTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCCGTTGAGCCTGTGGAAGAA 165
||||||||||||||||
Sbjct 223 GTATTTCGCCGTCAAC---------------------------------------------------------- 238
Query 166 TATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAGTGGATTTGATCAAGCTCG 239
||||||
Sbjct 239 --------------------------------------------------------------------AGCTCG 244
Query 240 TCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGAAATATTAATTGAAGCAG 313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 TCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGAAATATTAATTGAAGCAG 318
Query 314 TTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATAGAGTGCAGAGTTTGAAG 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 TTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATAGAGTGCAGAGTTTGAAG 392
Query 388 GACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGATTCCCAGACATCGCGAAG 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 GACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGATTCCCAGACATCGCGAAG 466
Query 462 TGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAACTATGGGATTTGAAGTGC 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467 TGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAACTATGGGATTTGAAGTGC 540
Query 536 CTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCGCCCATTGAAGATGCCATT 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCGCCCATTGAAGATGCCATT 614
Query 610 GCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTGCTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCACACGATTCAAGCATCAGAAGAGCA 683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 GCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTGCTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCACACGATTCAAGCATCAGAAGAGCA 688
Query 684 GAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAATAGATGTGAAGGCGGAACTGGAGA 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 689 GAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAATAGATGTGAAGGCGGAACTGGAGA 762
Query 758 AGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTGATGCTGGGAAAAGTACTCTGATG 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 AGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTGATGCTGGGAAAAGTACTCTGATG 836
Query 832 GGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAAGTATGAACAGGAGTCTAAAAAGGC 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 GGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAAGTATGAACAGGAGTCTAAAAAGGC 910
Query 906 TGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAGAAAGGGAAAGGGGAGTAACCATGG 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 TGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAGAAAGGGAAAGGGGAGTAACCATGG 984
Query 980 ATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATGGATGCTCCAGGCCATAAGGACTTC 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 ATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATGGATGCTCCAGGCCATAAGGACTTC 1058
Query 1054 ATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGTTGTAGATGCCAGCAGGGGAGAGTT 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059 ATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGTTGTAGATGCCAGCAGGGGAGAGTT 1132
Query 1128 TGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGGTCCGTTCTCTGGGAGTGACGCAGC 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 TGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGGTCCGTTCTCTGGGAGTGACGCAGC 1206
Query 1202 TTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGGTTTCAAGAGATTACTGGAAAACTT 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 TTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGGTTTCAAGAGATTACTGGAAAACTT 1280
Query 1276 GGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTATTCCTACAAGTGGTCTCAGTGGTGA 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 GGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTATTCCTACAAGTGGTCTCAGTGGTGA 1354
Query 1350 AAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAGGACTATGTTTATTAGAACAAATTG 1423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 AAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAGGACTATGTTTATTAGAACAAATTG 1428
Query 1424 ATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGTGTGTCCGATGTTTTCAAAGATCAA 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 ATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGTGTGTCCGATGTTTTCAAAGATCAA 1502
Query 1498 GGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAACTGGTGACCGACTACTGGCAATGCC 1571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503 GGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAACTGGTGACCGACTACTGGCAATGCC 1576
Query 1572 TCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTGTCGACTGGGCGGCAGCAGGCGATC 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 TCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTGTCGACTGGGCGGCAGCAGGCGATC 1650
Query 1646 ATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGCTGCATATTTTGTGGCCCCAAAGTA 1719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 ATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGCTGCATATTTTGTGGCCCCAAAGTA 1724
Query 1720 CCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATATTGAAATTCCTATCACTAAAGGATT 1793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 CCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATATTGAAATTCCTATCACTAAAGGATT 1798
Query 1794 TCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAACGATTGATTAGTGTCTTAAACAAAA 1867
||||
Sbjct 1799 TCCT---------------------------------------------------------------------- 1802
Query 1868 GCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAGAATGCATTGGTAGAGCTACAGACA 1941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 -------------------------------GTTTTTGACTAAAGGCCAGAATGCATTGGTAGAGCTACAGACA 1845
Query 1942 CAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAGGTTCATGCTACGTTACGGTGGTTC 2015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 CAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAGGTTCATGCTACGTTACGGTGGTTC 1919
Query 2016 TACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA------------------------------------- 2052
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 TACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAATGATGGGTCAGAATTTCTACCACGTTTCTGGATACAG 1993
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 1994 TGAAATAGCTAACCTCTGTTTCAAGAATGCAGTTATTAAGTCAAAGGAACAATGTGCAATTGATATGTTTTTAG 2067
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2068 ATGAGAGAGAAAAATTAAAGCTAAAATTAGCTGCAAAGAAGTATTAATAATCACCTCTGCAAAAATTCTAAGTT 2141
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2142 GCCAACTGGCAAAGAAAGTCTAATGTTAAAAACAACTTTGCCTTTGAAACGTTAATAAATGGATTTACTTTGCT 2215
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2216 AAGATTTATGGCAAGTGTCAAAAATAGTATCTGAAGATACTGAATCATCATGAAATGAACTCTACTTCTGGCCA 2289
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2290 AAGCACAATGTATTTGCAGTTTTCTCTTTTGATTCAATTATACTGCACATGTTTTAAGGAAAAGTAACTTAATT 2363
Query 2053 -------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2364 GGGTTTTTCAGGCAGTTGATATTTGACCTAAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGTTAATG 2425