Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476887
• Subject: XR_380070.1
• Aligned Length: 2801
• Identities: 1667
• Gaps: 864

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACGTCGCGCATGCGCGGACGCTCGGCGCAGAGGCCTGGCGGAAGACAAGATGGCGCGGCAGAGGTGTTCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCGCGGTCTGCGCCTCGTCGGTTTCTGAGCCGAGTTTTTCTGGAAGGGACGGCGGCAGGCGCCGTCTGTGCGC  148

Query    1  -ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGT  73
             |||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  149  GATGGCCCGGCATCGGAACGTCCGGGGATATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTGTATGGGCAGT  222

Query   74  CTGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCC  147
            ||||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||        
Sbjct  223  CTGTGGAGGATGACTACTGTATCTCACCATCAACAGCCGCTCAGTTCATTTACTCACGCCGTGACA--------  288

Query  148  GTTGAGCCTGTGGAAGAATATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAG  221
                |.||||..||||||||||..|||||||||||||.|||.|||||.||||||.|||..||.||.||..|.||
Sbjct  289  ----ACCCTGAAGAAGAATATGGCTATGAAGATCTGAGAGAGTCTTCTAATTCTCTTTTGAATCACCAATTAAG  358

Query  222  TGGATTTGATCAAGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATG  295
            ||.|.||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  359  TGAAATTGACCAAGCTCGCCTGTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTGGGGGACGCTGTGCCTGATG  432

Query  296  AAATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGAT  369
            |.|||.|.|.|||.|||.|||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  433  ACATACTGACTGAGGCAATTCTGAAACACAAATTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCCGTGGTTCTGGAACAAGAT  506

Query  370  AGAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGA  443
            .|.||||||..||.||||||.||||.||||..|.||||.|.|.|||||.||....|||||||||||.|||| .|
Sbjct  507  GGTGTGCAGCCTTGGAAGGAGAAGAGTGAGCGAGCAGTGTGTGCAGGACAGCCTTCAAAAGGAAAATCAGT-TA  579

Query  444  T-TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAA  516
            | ||.|.|.||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  580  TATCTCGGTCATCCCAGAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCCGGGAAGAAGCAG  653

Query  517  ACTATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACC  590
            ||.||||||||||||||||||||..||.|||||||.||||||||.|..|||.|.|.|.|.|||||.|||||.||
Sbjct  654  ACCATGGGATTTGAAGTGCCTGGCTTAACTTCTGAGGAAAATGGACTCAGTGTGCGCGCTCCTCACAAAGGGCC  727

Query  591  GCCCATTGAAGATG---CCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTG---CTTCTAAATCTGCTAATCCACCCC  658
            .||...|||.||||   .|.|.||||||.|..|..|||.||||||.|   ||.|.||||||||....|||||.|
Sbjct  728  TCCTGGTGATGATGTGAGCGTAGCTTCTCCTAACATTCCTGAGACCGGCACTCCAAAATCTGCCCTCCCACCTC  801

Query  659  ACACGATTCAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAA  732
            ...|..|||||.||||||||||||.|.|.||.||.||..||||.||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  802  CTTCCCTTCAAACATCAGAAGAGCTGGGCTCCACTCCGACACCAGTGAGAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAG  875

Query  733  ATAGATGTGAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGT  806
            |||||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  ATAGACGTGAAAGCGGAATTGGAAAAGCGGCAGGGCGGGAAGCAGCTCCTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGT  949

Query  807  TGATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATA  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  950  TGATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATGTAAACAAAAGAACTATGCATA  1023

Query  881  AGTATGAACAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAA  954
            |||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1024  AGTATGAGCAAGAATCTAAAAAGGCTGGCAAGGCTTCATTTGCATATGCGTGGGTCTTGGATGAAACTGGAGAA  1097

Query  955  GAAAGGGAAAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAAT  1028
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1098  GAAAGGGAAAGGGGAGTAACAATGGACGTCGGAATGACGAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACCTTAAT  1171

Query 1029  GGATGCTCCAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAG  1102
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..|.|
Sbjct 1172  GGATGCTCCAGGCCATAAGGATTTCATTCCAAACATGATCACAGGAGCAGCCCAGGCCGATGTCGCTGTCCTGG  1245

Query 1103  TTGTAGATGCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTG  1176
            |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1246  TCGTTGATGCCAGCAGAGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACGGGAGGACAGACCCGAGAGCATGGCCTTTTG  1319

Query 1177  GTCCGTTCTCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAG  1250
            |||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1320  GTCCGATCTCTTGGAGTGACACAGCTTGCTGTGGCTGTCAATAAGATGGATCAGGTAAATTGGCAACAAGAAAG  1393

Query 1251  GTTTCAAGAGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTA  1324
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1394  ATTTCAAGAGATTACTGGAAAACTCGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGCTTTTA  1467

Query 1325  TTCCTACAAGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAA  1398
            |.||.||.||.|||||.||||||||.|||.|||.|.||||.||.|||||.|||||.|||||.|..|||||.|||
Sbjct 1468  TCCCGACGAGCGGTCTGAGTGGTGAGAATTTAACCGCAAGGTCACAGTCCAGTGACCTCACGACGTGGTACAAA  1541

Query 1399  GGACTATGTTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATG  1472
            ||..|.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542  GGGATGTGCTTATTGGAGCAGATTGATTCCTTCAAGCCCCCTCAGCGCTCGATTGACAAACCTTTTAGATTATG  1615

Query 1473  TGTGTCCGATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAA  1546
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1616  TGTGTCTGATGTCTTCAAAGATCAAGGATCTGGCTTTTGTGTGACTGGTAAAATTGAAGCTGGTTATATCCAGA  1689

Query 1547  CTGGTGACCGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCT  1620
            |||||||||||||..|.||.|||||.||.||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1690  CTGGTGACCGACTGTTAGCCATGCCACCCAATGAAACCTGTACTGCTAAAGGAATCACTCTGCACGATGAGCCT  1763

Query 1621  GTCGACTGGGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGG  1694
            |||||.|||||.||||||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1764  GTCGATTGGGCAGCAGCAGGCGATCACGTAAATCTTACCTTGGTTGGGATGGACATCATCAAAATCAATGTCGG  1837

Query 1695  CTGCATATTTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATA  1768
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1838  CTGCATATTTTGTGGCCCCAAAGAACCCATTAAGGCTTGCACCCGCTTCAGAGCCCGAATCCTCGTCTTCAATA  1911

Query 1769  TTGAAATTCCTATCACTAAAGGATTTCCTG-TGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAA  1841
            |||||.||||.|||||||||||.||||||| |||                                        
Sbjct 1912  TTGAAGTTCCGATCACTAAAGGGTTTCCTGTTGC----------------------------------------  1945

Query 1842  ACGATTGATTAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCC  1915
                                                                          ||||.||.||||
Sbjct 1946  --------------------------------------------------------------TGACCAAGGGCC  1957

Query 1916  AGAATGCATTGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGG  1989
            ||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1958  AGAACGCCTTGGTAGAGCTGCAGACACAAAGACCAGTGGCTCTTGAGCTCTACAAAGACTTCAAGGAGCTGGGG  2031

Query 1990  AGGTTCATGCTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA-----------  2052
            .||||.|||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.           
Sbjct 2032  CGGTTTATGCTGCGTTATGGTGGCTCCACAGTAGCTGCCGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAGTGACGGTCCGG  2105

Query 2053  --------------------------------------------------------------------------  2052
                                                                                      
Sbjct 2106  TCCTCATCTCACCATGCTTCCAGAGGAGCGAGTCAGCCCCTGGGGCACTCAGTGGTGCAGCTAAGGAAACAGCA  2179

Query 2053  --------------------------------------------------------------------------  2052
                                                                                      
Sbjct 2180  TGCAGTCATGATTGTTAGATGAGAGACACTAAAGTACAGTTAGCTGCCAACAAGTATTAAGGATTACTCTGCAA  2253

Query 2053  --------------------------------------------------------------------------  2052
                                                                                      
Sbjct 2254  AACTTCCCAGTTGCCAGCTGCCAGAGGCCAGCACTGAACTGCCATTTCTTCCCTTTCGGGGTGGCAGTAAATAT  2327

Query 2053  --------------------------------------------------------------------------  2052
                                                                                      
Sbjct 2328  GTTTGTTGTGCTGAGACTTGTGGGAGGTATCACAAGACACTTAACTCAGTGGACTCGACTTCCAGCCAAACCAA  2401

Query 2053  --------------------------------------------------------------------------  2052
                                                                                      
Sbjct 2402  ATCCAAACGCTGTTCTGTTTCCATTCTCCTGCTGTGTGTGTTCTAAGGAAGCCTTGAACCTTAGTGGGGCTTGG  2475

Query 2053  --------------------------------------------------------------------------  2052
                                                                                      
Sbjct 2476  AGAGTCCGTCTTTGACCTGGTGCTTTTTTTAGTTAACACTAAGAAAAGATTTACTGAAGGTAACAGTGAAGCTG  2549

Query 2053  --------------------------------------------------------------------------  2052
                                                                                      
Sbjct 2550  TTTTGTGCTGAAAATAAAACCGTCCATCAAGCCTGCCTTCTGGAGTGTAATGCGAAGTGACAGAAATCTGTTCT  2623

Query 2053  ---------------------------------------------------------------  2052
                                                                           
Sbjct 2624  TAAGTAACAAAGATGCTACTTAAGTTGAGAAGCCAGCTAATAAAATGCCTTAGTTTGAATGTA  2686