Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477092
• Subject: NM_019927.2
• Aligned Length: 1671
• Identities: 1596
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGACTCGGACGAGGGCTACAACTACGAGTTCGACGAGGACGAGGAGTGCAGTGAGGAGGACAGCGGCGCCGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTCGGACGAGGGCTACAACTACGAGTTCGACGAGGACGAGGAGTGCAGCGAGGAGGACAGCGGCGCCGA  74

Query   75  GGAGGAGGAGGACGAAGACGACGACGAGCCGGACGATGATACCCTGGATCTGGGCGAGGTGGAGCTGGTGGAGC  148
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGGAGGACGACGACGAGGACGAGCCGGACGATGATAACCTGGATCTGGGCGAGGTGGAGCTGGTGGAGC  148

Query  149  CCGGGCTGGGCGTCGGCGGGGAGCGGGACGGACTGCTGTGCGGGGAGACGGGCGGTGGCGGCGGCAGCGCTCTG  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGGGCTGGGCGTCGGCGGGGAGCGAGACGGACTGCTGTGCGGGGAGACTGGCGGTGGCGGCGGCAGCGCTCTG  222

Query  223  GGGCCCGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTGGCGGGCCGGGGCATGAGCAGGAGGAGGATTA  296
            ||.||      .||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTCC------GGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGCGGCGGCCCGGGACACGAGCAGGAGGAGGATTA  290

Query  297  CCGCTACGAGGTGCTCACGGCCGAGCAGATTCTACAACACATGGTGGAATGTATCCGGGAGGTCAACGAGGTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  CCGCTACGAGGTGCTCACGGCCGAACAGATCCTGCAGCACATGGTGGAATGTATCCGGGAGGTCAACGAGGTCA  364

Query  371  TCCAGAATCCAGCAACTATCACAAGAATACTCCTTAGCCACTTCAATTGGGATAAAGAGAAGCTAATGGAAAGG  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  TCCAGAATCCAGCAACTATCACGAGAATACTCCTTAGCCACTTCAATTGGGATAAAGAGAAGCTAATGGAAAGG  438

Query  445  TACTTTGATGGAAACCTGGAGAAGCTCTTTGCTGAGTGTCATGTAATTAATCCAAGTAAAAAGTCTCGAACACG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  439  TACTTTGATGGAAACCTGGAGAAGCTCTTTGCTGAGTGTCATGTAATTAATCCAAGTAAAAAGTCTCGAACTCG  512

Query  519  CCAGATGAATACAAGGTCATCAGCACAGGATATGCCTTGTCAGATCTGCTACTTGAACTACCCTAACTCGTATT  592
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  CCAGATGAATACAAGGTCATCGGCACAGGATATGCCGTGTCAGATCTGCTACTTGAACTACCCTAACTCGTATT  586

Query  593  TCACTGGCCTTGAATGTGGACATAAGTTTTGTATGCAGTGCTGGAGTGAATATTTAACTACCAAAATAATGGAA  666
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  587  TTACTGGCCTTGAATGTGGACATAAGTTTTGTATGCAGTGCTGGAGTGAATATTTAACTACAAAAATAATGGAG  660

Query  667  GAAGGCATGGGTCAGACTATTTCGTGTCCTGCTCATGGTTGTGATATCTTAGTGGATGACAACACAGTTATGCG  740
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GAAGGCATGGGGCAGACTATTTCGTGTCCTGCGCATGGTTGTGATATCTTAGTGGATGACAACACAGTTATGCG  734

Query  741  CCTGATCACAGATTCAAAAGTTAAATTAAAGTATCAGCATTTAATAACAAATAGCTTTGTAGAGTGCAATCGAC  814
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  735  CCTGATCACAGATTCCAAAGTTAAGTTAAAATATCAACATTTAATAACAAATAGCTTTGTAGAGTGCAACCGAC  808

Query  815  TGTTAAAGTGGTGTCCTGCCCCAGATTGCCACCATGTTGTTAAAGTCCAATATCCTGATGCTAAACCTGTTCGC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  809  TGTTAAAGTGGTGTCCTGCCCCAGATTGCCACCATGTTGTTAAAGTCCAGTATCCTGATGCAAAACCAGTTCGC  882

Query  889  TGCAAATGTGGGCGCCAATTTTGCTTTAACTGTGGAGAAAATTGGCATGATCCTGTTAAATGTAAGTGGTTAAA  962
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  883  TGCAAATGTGGCCGCCAGTTTTGCTTTAACTGTGGTGAAAATTGGCATGATCCAGTTAAATGTAAGTGGTTGAA  956

Query  963  GAAATGGATTAAAAAGTGTGATGATGACAGTGAAACCTCCAATTGGATTGCAGCCAACACAAAGGAATGTCCCA  1036
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  957  GAAGTGGATTAAAAAGTGTGATGATGACAGTGAAACTTCTAATTGGATTGCAGCTAACACAAAGGAATGTCCCA  1030

Query 1037  AATGCCATGTCACAATTGAGAAGGATGGTGGTTGTAATCACATGGTCTGTCGTAACCAGAATTGTAAAGCAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1031  AATGCCATGTCACAATTGAGAAGGATGGCGGTTGTAATCACATGGTCTGTCGTAACCAGAACTGTAAAGCAGAA  1104

Query 1111  TTTTGCTGGGTGTGTCTTGGCCCATGGGAACCACATGGATCTGCCTGGTACAACTGTAACCGCTATAATGAGGA  1184
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  TTTTGCTGGGTGTGTCTTGGCCCTTGGGAACCGCATGGATCTGCCTGGTACAACTGTAACCGCTATAATGAGGA  1178

Query 1185  TGATGCAAAGGCAGCAAGAGATGCACAGGAGCGATCTAGGGCAGCCCTGCAGAGGTACCTGTTCTACTGTAATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1179  TGATGCAAAGGCAGCAAGAGATGCCCAAGAGCGATCTAGGGCGGCCCTGCAGAGATACCTGTTCTACTGTAATC  1252

Query 1259  GCTATATGAACCACATGCAGAGCCTGCGCTTTGAGCACAAACTATATGCTCAGGTGAAACAGAAAATGGAGGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1253  GCTATATGAACCACATGCAGAGTCTACGCTTCGAGCATAAGCTGTATGCTCAGGTGAAACAGAAGATGGAGGAG  1326

Query 1333  ATGCAGCAGCACAACATGTCCTGGATTGAGGTGCAGTTCCTGAAGAAGGCAGTTGATGTCCTCTGCCAGTGTCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  ATGCAGCAGCACAACATGTCCTGGATCGAGGTGCAGTTCCTGAAGAAAGCAGTTGATGTCCTCTGCCAGTGTCG  1400

Query 1407  TGCCACACTCATGTACACTTATGTCTTCGCTTTCTACCTCAAAAAGAATAACCAGTCCATTATCTTTGAGAATA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  TGCCACACTCATGTACACTTATGTCTTCGCTTTCTACCTCAAAAAGAATAACCAGTCCATTATCTTTGAGAATA  1474

Query 1481  ACCAAGCAGATCTAGAGAATGCCACAGAGGTGCTCTCGGGCTACCTTGAACGAGATATTTCCCAAGATTCTCTG  1554
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  ATCAAGCAGATCTAGAAAATGCCACAGAGGTGCTTTCGGGCTACCTTGAACGAGATATTTCCCAAGATTCTCTG  1548

Query 1555  CAGGATATAAAGCAGAAAGTACAAGACAAGTACAGATACTGTGAGAGTCGACGAAGGGTTTTGTTACAGCATGT  1628
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549  CAAGATATAAAGCAGAAAGTCCAAGATAAGTACAGATACTGTGAGAGTCGACGAAGGGTTTTGTTACAGCATGT  1622

Query 1629  GCATGAAGGCTATGAAAAAGATCTGTGGGAGTACATTGAGGAC  1671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623  GCATGAAGGCTATGAAAAAGATCTGTGGGAGTACATTGAGGAC  1665