Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477261
- Subject:
- NM_001081377.2
- Aligned Length:
- 3711
- Identities:
- 3432
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGACCTGAGGGATTTTTACCTGTTGGCTGCTCTGATTGCCTGTTTAAGGCTGGATTCCGCAATAGCTCAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACCTGAGGGATTTTTACCTGTTGGCTGCTCTGATTGCCTGTTTAAGGCTGGATTCCGCAATAGCTCAAGA 74
Query 75 ACTTATTTACACTATTAGAGAGGAATTGCCTGAAAATGTGCCCATAGGAAACATACCAAAGGATCTGAACATTT 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 75 ACTTATTTACACTATTAGAGAGGAATTGCCTGAAAATGTGCCCATAGGAAATATACCAAAGGATCTGAATATTT 148
Query 149 CTCACATCAATGCTGCCACAGGGACCAGCGCCAGCCTTGTCTACAGACTGGTTTCTAAAGCTGGGGATGCCCCT 222
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCACATCAATGCTGCCACGGGGACCAGTGCCAGCCTTGTCTACAGACTGGTTTCAAAAGCTGGGGATGCCCCT 222
Query 223 TTGGTGAAAGTATCCAGCAGCACTGGGGAAATTTTCACAACCTCCAACAGAATAGACAGAGAAAAACTCTGTGC 296
.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 CTGGTGAAAGTATCGAGTAGCACTGGGGAGATTTTCACAACCTCCAACAGAATAGACAGAGAGAAACTCTGTGC 296
Query 297 TGGCGCCTCATATGCTGAGGAGAATGAGTGTTTCTTTGAACTTGAGGTGGTGATCCTCCCCAATGATTTCTTCA 370
|||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 297 TGGGGCTTCATACGCTGAGGAGAACGAGTGCTTCTTTGAACTTGAAGTAGTGATCCTCCCCAATGACTTTTTCA 370
Query 371 GGCTGATCAAAATAAAAATAATTGTCAAGGATACCAATGATAATGCCCCCATGTTTCCATCTCCTGTCATCAAT 444
|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 GGCTGATCAAAATCAAGATCATTGTCAAGGATACCAATGATAATGCCCCCATGTTTCCGTCTCCTGTCATCAAT 444
Query 445 ATTTCCATTCCAGAAAACACTTTGATCAACAGCCGCTTTCCAATTCCATCAGCAACAGATCCTGACACAGGCTT 518
||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 445 ATTTCCATCCCAGAGAACACTTTGATCAACAGCCGCTTTCCAATCCCATCAGCCACAGACCCTGACACGGGCTT 518
Query 519 CAATGGTGTACAGCATTATGAATTGTTAAATGGGCAGAGTGTTTTTGGACTGGATATCGTGGAAACTCCAGAGG 592
||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 CAATGGGGTACAGCATTATGAATTACTAAATGGACAGAGTGTTTTTGGACTGGATATCGTGGAAACTCCGGAGG 592
Query 593 GAGAGAAGTGGCCACAACTGATTGTTCAGCAAAACTTGGATAGAGAACAGAAAGATACCTATGTGATGAAAATC 666
||||.||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGAAAAGTGGCCGCAATTGATTGTTCAGCAGAACTTGGATAGAGAACAAAAAGATACCTATGTGATGAAAATC 666
Query 667 AAAGTAGAGGATGGAGGCACTCCACAGAAATCCAGTACGGCCATACTGCAGGTCACAGTAAGTGATGTAAATGA 740
|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 AAAGTGGAGGATGGGGGCACGCCACAGAAATCGAGCACAGCTATTCTCCAGGTCACAGTAAGTGATGTCAATGA 740
Query 741 CAACAGGCCAGTGTTTAAAGAGGGTCAAGTGGAGGTGCATATTCCAGAGAATGCTCCCGTAGGTACCTCTGTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 741 CAACAGGCCAGTGTTTAAAGAGGGTCAAGTAGAAGTGCATATTCCAGAGAATGCTCCTGTGGGGACCTCTGTCA 814
Query 815 TTCAGCTCCATGCCACTGATGCAGATATAGGCAGTAATGCTGAAATCCGGTACATTTTTGGTGCCCAGGTCGCC 888
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCAGCTCCATGCCACTGATGCAGACATAGGCAGTAATGCTGAAATCCGGTATATTTTTGGTGCCCAGGTCGCC 888
Query 889 CCTGCAACCAAAAGACTCTTTGCTTTAAATAATACTACTGGGCTGATTACAGTTCAGAGGTCCTTAGATAGAGA 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 CCTGCAACCAAAAGACTCTTTGCTTTAAATAATACAACTGGGCTGATAACAGTTCAGAGGTCTTTAGATAGGGA 962
Query 963 GGAGACAGCCATTCACAAAGTGACAGTGCTGGCTAGTGACGGCAGCTCCACTCCTGCTCGAGCAACGGTTACCA 1036
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||.||||
Sbjct 963 AGAGACAGCCATTCACAAAGTGACAGTGCTGGCTAGTGACGGCAGCTCCACTCCTGCCAGAGCCACCGTGACCA 1036
Query 1037 TCAATGTCACCGATGTAAATGATAACCCTCCTAATATAGACCTCAGGTACATTATAAGTCCCATCAATGGCACC 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 TCAATGTCACCGATGTAAATGATAACCCTCCAAACATAGACCTCAGGTACATTATAAGTCCCATCAATGGCACA 1110
Query 1111 GTGTATTTATCTGAGAAAGATCCTGTCAATACAAAGATTGCCCTAATTACAGTTTCAGATAAGGACACAGATGT 1184
||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGTATCTCTCTGAGAAAGACCCTGTCAATACAAAGATTGCCCTCATTACAGTTTCAGATAAGGACACAGATGT 1184
Query 1185 GAATGGCAAAGTGATCTGTTTTATTGAAAGAGAGGTCCCATTTCATTTGAAGGCGGTATATGACAACCAATATT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.
Sbjct 1185 GAATGGCAAAGTGATCTGTTTTATTGAAAGAGAGGTCCCATTTCATTTGAAGGCAGTGTATGACAACCAGTATC 1258
Query 1259 TGTTAGAGACCTCTTCTTTGTTGGACTATGAGGGCACCAAAGAATTCAGCTTTAAAATTGTTGCCTCTGATTCT 1332
||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1259 TGCTAGAGACCTCTTCTCTGCTGGACTATGAGGGCACCAAAGAATTCAGCTTTAAAATCGTTGCCTCTGATTCG 1332
Query 1333 GGGAAGCCCAGTTTAAATCAGACTGCCCTGGTAAGGGTTAAGCTTGAGGATGAAAATGACAACCCACCAATTTT 1406
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGGAAGCCCAGTTTGAATCAGACTGCCCTGGTAAGGGTTAAGCTCGAGGATGAAAATGACAACCCACCAATTTT 1406
Query 1407 CAACCAGCCTGTAATTGAGCTGTCAGTTTCTGAAAACAACCGACGTGGGTTATACTTAACAACTATTAGTGCCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407 CAACCAGCCTGTAATTGAGCTGTCAGTTTCTGAAAACAACCGACGTGGGTTATACTTAACAACTATTAGTGCTA 1480
Query 1481 CAGATGAAGACAGTGGGAAAAATGCAGACATTGTTTATCAGCTTGGACCTAATGCCTCCTTCTTTGATCTGGAC 1554
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGATGAAGACAGTGGAAAAAATGCAGACATTGTTTATCAGCTTGGACCGAATGCCTCCTTCTTTGATCTGGAC 1554
Query 1555 CGAAAAACAGGAGTTTTGACAGCCTCCAGAGTATTTGACAGAGAAGAACAAGAACGATTCATTTTTACAGTAAC 1628
.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGAAAGACAGGAGTTTTGACAGCCTCCAGAGTCTTTAACAGGGAGGAACAAGAGCGGTTCATTTTTACAGTAAC 1628
Query 1629 TGCCAGGGATAATGGGACCCCTCCCCTCCAAAGCCAAGCGGCTGTGATTGTTACTGTTCTGGATGAGAATGACA 1702
|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCCAGGGACAATGGGACCCCTCCCCTCCAGAGCCAAGCAGCAGTGATAGTTACTGTTCTGGATGAGAATGACA 1702
Query 1703 ATAGCCCCAAGTTTACTCATAATCATTTTCAATTTTTTGTGTCTGAGAATCTGCCAAAGTATAGTACTGTGGGG 1776
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATAGCCCCAAGTTTACTCATAATCACTTTCAGTTTTTTGTGTCTGAGAATCTGCCAAAGTATAGTACTGTGGGG 1776
Query 1777 GTAATCACAGTGACAGATGCAGATGCTGGAGAGAATAAAGCTGTGACTCTTTCCATTCTAAATGACAATGATAA 1850
|||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1777 GTAATCACAGTGACAGACGAAGACGCTGGAGAGAATAAAGCTGTGACTCTTTCCATTCTAAATGACAATGAAAA 1850
Query 1851 TTTTGTGTTGGATCCCTATTCTGGAGTCATAAAGTCAAATGTCTCATTTGATAGAGAGCAGCAGAGTTCCTACA 1924
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTTTGTGTTGGATCCCTATTCAGGAGTCATAAAGTCCAATGTCTCCTTTGATAGAGAGCAGCAGAGTTCCTACA 1924
Query 1925 CTTTTGATGTCAAAGCCACTGATGGAGGACAACCACCTCGTTCCTCTACTGCAAAAGTAACTATCAACGTCATG 1998
|.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1925 CGTTTGACGTCAAAGCCACCGACGGGGGACAGCCACCACGGTCCTCTACTGCAAAAGTAACTATCAATGTCATG 1998
Query 1999 GATGTCAATGACAACAGCCCAGTTGTCATTTCTCCACCGTCTAATACTTCCTTTAAGTTGGTGCCCCTCTCAGC 2072
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GATGTCAATGACAATAGTCCAGTTGTCATTTCTCCACCATCCAACACCTCCTTTAAGTTGGTGCCCCTCTCAGC 2072
Query 2073 CATTCCTGGCTCCGTGGTAGCAGAAGTTTTTGCAGTGGATGTTGACACTGGAATGAACGCTGAACTAAAGTATA 2146
|||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 2073 CATTCCTGGTTCTGTGGTTGCTGAAGTGTTTGCGGTGGATATTGACACCGGAATGAATGCAGAACTCAAGTATA 2146
Query 2147 CTATAGTGAGTGGAAACAATAAAGGCTTATTCCGGATTGATCCAGTAACAGGTAACATTACTCTGGAAGAAAAA 2220
|.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||..|.|||||.||.
Sbjct 2147 CCATAGTGAGCGGGAACAACAAGGGATTATTTCGGATTGATCCAGTAACAGGCAATATCACCTTAGAAGAGAAG 2220
Query 2221 CCAGCACCTACTGATGTGGGATTGCATCGTTTGGTGGTCAACATAAGTGACCTGGGGTACCCTAAGTCTTTGCA 2294
||||||||||||||||||||..||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2221 CCAGCACCTACTGATGTGGGCCTGCACCGTCTTGTGGTCAACATAAGTGACCTGGGGTACCCTAAGGCTTTGCA 2294
Query 2295 CACGCTTGTGCTTGTATTCCTTTATGTTAACGACACTGCTGGAAATGCCTCCTATATCTATGACTTGATCCGCA 2368
|||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2295 CACTCTCGTGCTGGTATTTCTTTATGTGAACGACACTGCTGGAAACACCTCATATATATATGACTTGATCCGTA 2368
Query 2369 GGACTATGGAGACCCCGTTGGACAGGAACATAGGGGATAGTAGCCAACCCTATCAAAATGAGGACTATCTAACC 2442
||||||||||||||||..|||||.||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 2369 GGACTATGGAGACCCCACTGGACCGGAACATAGGAGATAGTGGTCAACCTTATCAGAACGAGGACTATCTCACC 2442
Query 2443 ATCATGATTGCCATCATCGCCGGTGCCATGGTGGTCATTGTTGTGATCTTCGTCACCGTTCTGGTGCGCTGTCG 2516
|||||||||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2443 ATCATGATTGCCATCGTTGCTGGGGCCATGGTGGTCATTGTTGTGATCTTTGTCACGGTGCTGGTGCGCTGTCG 2516
Query 2517 CCATGCATCAAGGTTCAAAGCAGCTCAGAGGAGCAAGCAAGGTGCCGAATGGATGTCCCCAAACCAGGAGAACA 2590
||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2517 CCATGCGTCCAGGTTCAAGGCCGCTCAGAGGAGCAAACAAGGGGCTGAATGGATGTCCCCAAACCAGGAGAATA 2590
Query 2591 AGCAAAACAAGAAAAAGAAAAGAAAGAAAAGGAAGTCTCCCAAAAGCTCTCTTTTGAACTTTGTTACTATCGAA 2664
|.|||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2591 AACAAAATAAGAAAAAGAAACGGAAGAAAAGAAAGTCGCCCAAGAGTTCTCTTTTGAACTTTGTTACTATTGAA 2664
Query 2665 GAGTCCAAACCCGATGATGCAGTTCATGAACCTATCAATGGGACAATAAGCCTGCCGGCTGAACTGGAGGAGCA 2738
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 2665 GAGTCCAAACCCGATGATGCCGTTCATGAACCCATCAATGGGACCATAAGCCTGCCTGCCGAGCTGGAGGAACA 2738
Query 2739 AAGTATAGGAAGATTTGACTGGGGCCCGGCACCTCCAACAACATTCAAGCCTAACAGTCCTGACCTGGCCAAGC 2812
..|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2739 GGGTATAGGAAGATTTGACTGGGGCCCAGCCCCTCCAACCACCTTCAAGCCTAACAGCCCTGACCTGGCCAAGC 2812
Query 2813 ACTACAAATCTGCTTCTCCACAGCCTGCTTTTCATCTCAAACCAGACACTCCAGTTTCCGTGAAAAAGCACCAC 2886
|||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2813 ACTACAAGTCGGCCTCTCCTCAGCCCGCTTTTCATCTCAAACCTGACACTCCAGTTTCTGTGAAAAAGCACCAC 2886
Query 2887 GTGATTCAGGAACTCCCTTTGGACAACACCTTTGTTGGGGGTTGTGACACCCTTTCTAAACGCTCTTCCACTAG 2960
||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2887 GTCATTCAAGAGCTCCCGTTGGACAACACCTTTGTTGGGGGCTGCGACACCCTTTCCAAACGCTCCTCCACTAG 2960
Query 2961 TTCAGATCACTTCAGTGCCTCAGAGTGCAGTTCCCAAGGAGGCTTCAAGACAAAGGGCCCCTTACACACCAGAC 3034
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TTCAGATCACTTCAGTGCCTCAGAGTGCAGCTCCCAAGGAGGCTTCAAGACAAAGGGCCCCTTACACACCAGAC 3034
Query 3035 AGTGTAACTCACACAGCAAAAGTGACAATATTCCTGTCACTCCTCAGAAATGTCCCAGCTCCACGGGTTTCCAC 3108
|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.||||.||..||||||||
Sbjct 3035 AGTGTAACTCATACAGCAAAAATGACAATATTCCTGTCACACATCAGAAATGTCCCGGCTCTACCAGTTTCCAC 3108
Query 3109 ATTCAGGAGAATGAAGAAAGCCATTACGAGTCGCAGCGCCGTGTTACGTTTCATCTCCCTGATGGCTCCCAGGA 3182
||||..||||||||||||||.||||..|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 3109 ATTCGAGAGAATGAAGAAAGTCATTCTGAGTCTCAGCGCCGTGTTACCTTTCACCTTCCGGATGGCTCCCAGGA 3182
Query 3183 AAGCTGCAGTGACAGTGGTCTAGGAGACCATGAGCCGGTGGGTAGTGGAACCCTGATCTCACACCCTCTTCCTC 3256
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AAGCTGCAGTGACAGTGGTCTGGGAGACCACGAGCCGGTGGGTAGTGGAACCCTGATCTCACACCCTCTTCCTC 3256
Query 3257 TGGTTCAGCCACAGGACGAATTCTATGACCAGGCCTCTCCGGACAAGAGGACTGAAGCAGATGGCAACTCTGAT 3330
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 3257 TGGTTCAGCCACAGGACGAATTCTACGACCAGGCCTCTCCGGACAAGAGGACCGAAGCAGATGGCAACTCGGAT 3330
Query 3331 CCCAACTCTGATGGGCCTTTGGGTCCCCGAGGATTAGCTGAAGCTACAGAGATGTGCACTCAAGAGTGCTTGGT 3404
|||||.||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 3331 CCCAATTCTGATGGACCTCTGGGTCCCCGAGGTTTAGCTGAAGCTACAGAGATGTGCACTCAAGAGTGTCTGGT 3404
Query 3405 TTTGGGTCACTCTGATAATTGCTGGATGCCTCCTGGCTTGGGTCCATATCAACACCCCAAATCTCCTCTCTCAA 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 3405 TTTGGGTCACTCTGATAATTGCTGGATGCCTCCTGGCTTGGGTCCATACCAACACCCTAAATCTCCTCTGTCAA 3478
Query 3479 CCTTTGCACCCCAGAAAGAATGGGTGAAGAAGGACAAGCTTGTGAATGGGCACACCCTGACCAGAGCCTGGAAA 3552
|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 3479 CCTTTGCACCCCAGAAAGAATGGATCAAGAAAGACAAGCTTGTGAATGGGCACACCCTGACAAGAGCGTGGAAA 3552
Query 3553 GAAGACAGCAACAGGAACCAGTTCAATGACCGTAAGCAGTATGGCTCCAATGAAGGCCATTTCAACAATGGCAG 3626
|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3553 GAAGACACCAACAGGAACCAATTCAATGACCGTAAGCAGTATGGCTCCAATGAAGGCCATTTCAACAATGGCGG 3626
Query 3627 CCACATGACAGACATTCCTCTGGCAAATCTGAAGTCTTATAAGCAAGCAGGAGGTGCTACTGAGAGTCCTAAGG 3700
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.|.||||||||||||||
Sbjct 3627 CCACATGGCGGACATTCCTCTGGCAAATCTGAAGTCCTATAAGCAAGCAGGAGGCACGATTGAGAGTCCTAAGG 3700
Query 3701 AGCACCAACTC 3711
||||||||||.
Sbjct 3701 AGCACCAACTT 3711