Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477261
• Subject: XM_017020621.2
• Aligned Length: 3711
• Identities: 3046
• Gaps: 654

Alignment

Query    1  ATGGACCTGAGGGATTTTTACCTGTTGGCTGCTCTGATTGCCTGTTTAAGGCTGGATTCCGCAATAGCTCAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCTGAGGGATTTTTACCTGTTGGCTGCTCTGATTGCCTGTTTAAGGCTGGATTCCGCAATAGCTCAAGA  74

Query   75  ACTTATTTACACTATTAGAGAGGAATTGCCTGAAAATGTGCCCATAGGAAACATACCAAAGGATCTGAACATTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTTATTTACACTATTAGAGAGGAATTGCCTGAAAATGTGCCCATAGGAAACATACCAAAGGATCTGAACATTT  148

Query  149  CTCACATCAATGCTGCCACAGGGACCAGCGCCAGCCTTGTCTACAGACTGGTTTCTAAAGCTGGGGATGCCCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCACATCAATGCTGCCACAGGGACCAGCGCCAGCCTTGTCTACAGACTGGTTTCTAAAGCTGGGGATGCCCCT  222

Query  223  TTGGTGAAAGTATCCAGCAGCACTGGGGAAATTTTCACAACCTCCAACAGAATAGACAGAGAAAAACTCTGTGC  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGTGAAAGTTTCCAGCAGCACTGGGGAAATTTTCACAACCTCCAACAGAATAGACAGAGAAAAACTCTGTGC  296

Query  297  TGGCGCCTCATATGCTGAGGAGAATGAGTGTTTCTTTGAACTTGAGGTGGTGATCCTCCCCAATGATTTCTTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCGCCTCATATGCTGAGGAGAATGAGTGTTTCTTTGAACTTGAGGTGGTGATCCTCCCCAATGATTTCTTCA  370

Query  371  GGCTGATCAAAATAAAAATAATTGTCAAGGATACCAATGATAATGCCCCCATGTTTCCATCTCCTGTCATCAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTGATCAAAATAAAAATAATTGTCAAGGATACCAATGATAATGCCCCCATGTTTCCATCTCCTGTCATCAAT  444

Query  445  ATTTCCATTCCAGAAAACACTTTGATCAACAGCCGCTTTCCAATTCCATCAGCAACAGATCCTGACACAGGCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTTCCATTCCAGAAAACACTTTGATCAACAGCCGCTTTCCAATTCCATCAGCAACAGATCCTGACACAGGCTT  518

Query  519  CAATGGTGTACAGCATTATGAATTGTTAAATGGGCAGAGTGTTTTTGGACTGGATATCGTGGAAACTCCAGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAATGGTGTACAGCATTATGAATTGTTAAATGGGCAGAGTGTTTTTGGACTGGATATCGTGGAAACTCCAGAGG  592

Query  593  GAGAGAAGTGGCCACAACTGATTGTTCAGCAAAACTTGGATAGAGAACAGAAAGATACCTATGTGATGAAAATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGAGAAGTGGCCACAACTGATTGTTCAGCAAAACTTGGATAGAGAACAGAAAGATACCTATGTGATGAAAATC  666

Query  667  AAAGTAGAGGATGGAGGCACTCCACAGAAATCCAGTACGGCCATACTGCAGGTCACAGTAAGTGATGTAAATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTAGAGGATGGAGGCACTCCACAGAAATCCAGTACGGCCATACTGCAGGTCACAGTAAGTGATGTAAATGA  740

Query  741  CAACAGGCCAGTGTTTAAAGAGGGTCAAGTGGAGGTGCATATTCCAGAGAATGCTCCCGTAGGTACCTCTGTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACAGGCCAGTGTTTAAAGAGGGTCAAGTGGAGGTGCATATTCCAGAGAATGCTCCCGTAGGTACCTCTGTAA  814

Query  815  TTCAGCTCCATGCCACTGATGCAGATATAGGCAGTAATGCTGAAATCCGGTACATTTTTGGTGCCCAGGTCGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAGCTCCATGCCACTGATGCAGATATAGGCAGTAATGCTGAAATCCGGTACATTTTTGGTGCCCAGGTCGCC  888

Query  889  CCTGCAACCAAAAGACTCTTTGCTTTAAATAATACTACTGGGCTGATTACAGTTCAGAGGTCCTTAGATAGAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGCAACCAAAAGACTCTTTGCTTTAAATAATACTACTGGGCTGATTACAGTTCAGAGGTCCTTAGATAGAGA  962

Query  963  GGAGACAGCCATTCACAAAGTGACAGTGCTGGCTAGTGACGGCAGCTCCACTCCTGCTCGAGCAACGGTTACCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGACAGCCATTCACAAAGTGACAGTGCTGGCTAGTGACGGCAGCTCCACTCCTGCTCGAGCAACGGTTACCA  1036

Query 1037  TCAATGTCACCGATGTAAATGATAACCCTCCTAATATAGACCTCAGGTACATTATAAGTCCCATCAATGGCACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAATGTCACCGATGTAAATGATAACCCTCCTAATATAGACCTCAGGTACATTATAAGTCCCATCAATGGCACC  1110

Query 1111  GTGTATTTATCTGAGAAAGATCCTGTCAATACAAAGATTGCCCTAATTACAGTTTCAGATAAGGACACAGATGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGTATTTATCTGAGAAAGATCCTGTCAATACAAAGATTGCCCTAATTACAGTTTCAGATAAGGACACAGATGT  1184

Query 1185  GAATGGCAAAGTGATCTGTTTTATTGAAAGAGAGGTCCCATTTCATTTGAAGGCGGTATATGACAACCAATATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAATGGCAAAGTGATCTGTTTTATTGAAAGAGAGGTCCCATTTCATTTGAAGGCGGTATATGACAACCAATATT  1258

Query 1259  TGTTAGAGACCTCTTCTTTGTTGGACTATGAGGGCACCAAAGAATTCAGCTTTAAAATTGTTGCCTCTGATTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTTAGAGACCTCTTCTTTGTTGGACTATGAGGGCACCAAAGAATTCAGCTTTAAAATTGTTGCCTCTGATTCT  1332

Query 1333  GGGAAGCCCAGTTTAAATCAGACTGCCCTGGTAAGGGTTAAGCTTGAGGATGAAAATGACAACCCACCAATTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGAAGCCCAGTTTAAATCAGACTGCCCTGGTAAGGGTTAAGCTTGAGGATGAAAATGACAACCCACCAATTTT  1406

Query 1407  CAACCAGCCTGTAATTGAGCTGTCAGTTTCTGAAAACAACCGACGTGGGTTATACTTAACAACTATTAGTGCCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAACCAGCCTGTAATTGAGCTGTCAGTTTCTGAAAACAACCGACGTGGGTTATACTTAACAACTATTAGTGCCA  1480

Query 1481  CAGATGAAGACAGTGGGAAAAATGCAGACATTGTTTATCAGCTTGGACCTAATGCCTCCTTCTTTGATCTGGAC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGATGAAGACAGTGGGAAAAATGCAGACATTGTTTATCAGCTTGGACCGAATGCCTCCTTCTTTGATCTGGAC  1554

Query 1555  CGAAAAACAGGAGTTTTGACAGCCTCCAGAGTATTTGACAGAGAAGAACAAGAACGATTCATTTTTACAGTAAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGAAAAACAGGAGTTTTGACAGCCTCCAGAGTATTTGACAGAGAAGAACAAGAACGATTCATTTTTACAGTAAC  1628

Query 1629  TGCCAGGGATAATGGGACCCCTCCCCTCCAAAGCCAAGCGGCTGTGATTGTTACTGTTCTGGATGAGAATGACA  1702
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGCCAGGGACAATGGGACCCCTCCCCTCCAAAGCCAAGCGGCTGTGATTGTTACTGTTCTGGATGAGAATGACA  1702

Query 1703  ATAGCCCCAAGTTTACTCATAATCATTTTCAATTTTTTGTGTCTGAGAATCTGCCAAAGTATAGTACTGTGGGG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATAGCCCCAAGTTTACTCATAATCATTTTCAATTTTTTGTGTCTGAGAATCTGCCAAAGTATAGTACTGTGGGG  1776

Query 1777  GTAATCACAGTGACAGATGCAGATGCTGGAGAGAATAAAGCTGTGACTCTTTCCATTCTAAATGACAATGATAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTAATCACAGTGACAGATGCAGATGCTGGAGAGAATAAAGCTGTGACTCTTTCCATTCTAAATGACAATGATAA  1850

Query 1851  TTTTGTGTTGGATCCCTATTCTGGAGTCATAAAGTCAAATGTCTCATTTGATAGAGAGCAGCAGAGTTCCTACA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTTTGTGTTGGATCCCTATTCTGGAGTCATAAAGTCAAATGTCTCATTTGATAGAGAGCAGCAGAGTTCCTACA  1924

Query 1925  CTTTTGATGTCAAAGCCACTGATGGAGGACAACCACCTCGTTCCTCTACTGCAAAAGTAACTATCAACGTCATG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTTTTGATGTCAAAGCCACTGATGGAGGACAACCACCTCGTTCCTCTACTGCAAAAGTAACTATCAACGTCATG  1998

Query 1999  GATGTCAATGACAACAGCCCAGTTGTCATTTCTCCACCGTCTAATACTTCCTTTAAGTTGGTGCCCCTCTCAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GATGTCAATGACAACAGCCCAGTTGTCATTTCTCCACCGTCTAATACTTCCTTTAAGTTGGTGCCCCTCTCAGC  2072

Query 2073  CATTCCTGGCTCCGTGGTAGCAGAAGTTTTTGCAGTGGATGTTGACACTGGAATGAACGCTGAACTAAAGTATA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CATTCCTGGCTCCGTGGTAGCAGAAGTTTTTGCAGTGGATGTTGACACTGGAATGAACGCTGAACTAAAGTATA  2146

Query 2147  CTATAGTGAGTGGAAACAATAAAGGCTTATTCCGGATTGATCCAGTAACAGGTAACATTACTCTGGAAGAAAAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTATAGTGAGTGGAAACAATAAAGGCTTATTCCGGATTGATCCAGTAACAGGTAACATTACTCTGGAAGAAAAA  2220

Query 2221  CCAGCACCTACTGATGTGGGATTGCATCGTTTGGTGGTCAACATAAGTGACCTGGGGTACCCTAAGTCTTTGCA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCAGCACCTACTGATGTGGGATTGCATCGTTTGGTGGTCAACATAAGTGACCTGGGGTACCCTAAGTCTTTGCA  2294

Query 2295  CACGCTTGTGCTTGTATTCCTTTATGTTAACGACACTGCTGGAAATGCCTCCTATATCTATGACTTGATCCGCA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CACGCTTGTGCTTGTATTCCTTTATGTTAACGACACTGCTGGAAATGCCTCCTATATCTATGACTTGATCCGCA  2368

Query 2369  GGACTATGGAGACCCCGTTGGACAGGAACATAGGGGATAGTAGCCAACCCTATCAAAATGAGGACTATCTAACC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGACTATGGAGACCCCGTTGGACAGGAACATAGGGGATAGTAGCCAACCCTATCAAAATGAGGACTATCTAACC  2442

Query 2443  ATCATGATTGCCATCATCGCCGGTGCCATGGTGGTCATTGTTGTGATCTTCGTCACCGTTCTGGTGCGCTGTCG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATCATGATTGCCATCATCGCCGGTGCCATGGTGGTCATTGTTGTGATCTTCGTCACCGTTCTGGTGCGCTGTCG  2516

Query 2517  CCATGCATCAAGGTTCAAAGCAGCTCAGAGGAGCAAGCAAGGTGCCGAATGGATGTCCCCAAACCAGGAGAACA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCATGCATCAAGGTTCAAAGCAGCTCAGAGGAGCAAGCAAGGTGCCGAATGGATGTCCCCAAACCAGGAGAACA  2590

Query 2591  AGCAAAACAAGAAAAAGAAAAGAAAGAAAAGGAAGTCTCCCAAAAGCTCTCTTTTGAACTTTGTTACTATCGAA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGCAAAACAAGAAAAAGAAAAGAAAGAAAAGGAAGTCTCCCAAAAGCTCTCTTTTGAACTTTGTTACTATCGAA  2664

Query 2665  GAGTCCAAACCCGATGATGCAGTTCATGAACCTATCAATGGGACAATAAGCCTGCCGGCTGAACTGGAGGAGCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAGTCCAAACCCGATGATGCAGTTCATGAACCTATCAATGGGACAATAAGCCTGCCGGCTGAACTGGAGGAGCA  2738

Query 2739  AAGTATAGGAAGATTTGACTGGGGCCCGGCACCTCCAACAACATTCAAGCCTAACAGTCCTGACCTGGCCAAGC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AAGTATAGGAAGATTTGACTGGGGCCCGGCACCTCCAACAACATTCAAGCCTAACAGTCCTGACCTGGCCAAGC  2812

Query 2813  ACTACAAATCTGCTTCTCCACAGCCTGCTTTTCATCTCAAACCAGACACTCCAGTTTCCGTGAAAAAGCACCAC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ACTACAAATCTGCTTCTCCACAGCCTGCTTTTCATCTCAAACCAGACACTCCAGTTTCCGTGAAAAAGCACCAC  2886

Query 2887  GTGATTCAGGAACTCCCTTTGGACAACACCTTTGTTGGGGGTTGTGACACCCTTTCTAAACGCTCTTCCACTAG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GTGATTCAGGAACTCCCTTTGGACAACACCTTTGTTGGGGGTTGTGACACCCTTTCTAAACGCTCTTCCACTAG  2960

Query 2961  TTCAGATCACTTCAGTGCCTCAGAGTGCAGTTCCCAAGGAGGCTTCAAGACAAAGGGCCCCTTACACACCAGAC  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TTCAGATCACTTCAGTGCCTCAGAGTGCAGTTCCCAAGGAGGCTTCAAGACAAAGGGCCCCTTACACACCAGAC  3034

Query 3035  AGTGTAACTCACACAGCAAAAGTGACAATATTCCTGTCACTCCTCAGAAATGTCCCAGCTCCACGGGTTTCCAC  3108
            |||.|...|||.|..|||||||.                                                   
Sbjct 3035  AGTTTCCTTCAAATGGCAAAAGA---------------------------------------------------  3057

Query 3109  ATTCAGGAGAATGAAGAAAGCCATTACGAGTCGCAGCGCCGTGTTACGTTTCATCTCCCTGATGGCTCCCAGGA  3182
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3183  AAGCTGCAGTGACAGTGGTCTAGGAGACCATGAGCCGGTGGGTAGTGGAACCCTGATCTCACACCCTCTTCCTC  3256
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3257  TGGTTCAGCCACAGGACGAATTCTATGACCAGGCCTCTCCGGACAAGAGGACTGAAGCAGATGGCAACTCTGAT  3330
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3331  CCCAACTCTGATGGGCCTTTGGGTCCCCGAGGATTAGCTGAAGCTACAGAGATGTGCACTCAAGAGTGCTTGGT  3404
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3405  TTTGGGTCACTCTGATAATTGCTGGATGCCTCCTGGCTTGGGTCCATATCAACACCCCAAATCTCCTCTCTCAA  3478
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3479  CCTTTGCACCCCAGAAAGAATGGGTGAAGAAGGACAAGCTTGTGAATGGGCACACCCTGACCAGAGCCTGGAAA  3552
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3553  GAAGACAGCAACAGGAACCAGTTCAATGACCGTAAGCAGTATGGCTCCAATGAAGGCCATTTCAACAATGGCAG  3626
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3627  CCACATGACAGACATTCCTCTGGCAAATCTGAAGTCTTATAAGCAAGCAGGAGGTGCTACTGAGAGTCCTAAGG  3700
                                                                                      
Sbjct 3058  --------------------------------------------------------------------------  3057

Query 3701  AGCACCAACTC  3711
                       
Sbjct 3058  -----------  3057