Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477262
• Subject: XM_024451308.1
• Aligned Length: 3339
• Identities: 2885
• Gaps: 426

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCCCGCCTCGCGCGGCGGCGGCGGCGGGGCAAAATAACATGGCAGCCAGACGAATTACACAGGAGACTTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGATGCTGTATTACAAGAAAAAGCCAAACGATATCACATGGATGCCAGTGGTGAGGCTGTAAGCGAAACTCTTC  148

Query    1  --------------------------------------------------ATGTATGATGACGTCCACAGCGAT  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTTTAAAGCTCAAGATCTCTTAAGGGCAGTCCCAAGATCCAGAGCAGAGATGTATGATGACGTCCACAGCGAT  222

Query   25  GGCAGATACTCCCTCAGTGGATCTGTAGCTCACTCTAGAGATGCCGGAAGAGAAGGCCTGAGAAGTGACGTATT  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCAGATACTCCCTCAGTGGATCTGTAGCTCACTCTAGAGATGCCGGAAGAGAAGGCCTGAGAAGTGACGTATT  296

Query   99  TCCAGGGCCTTCCTTCAGATCAAGCAACCCTTCCATCAGTGATGACAGCTACTTTCGCAAAGAATGTGGCCGGG  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAGGGCCTTCCTTCAGATCAAGCAACCCTTCCATCAGTGATGACAGCTACTTTCGCAAAGAATGTGGCCGGG  370

Query  173  ATCTGGAATTTTCTCACTCTGATTCTCGGGACCAGGTCATTGGCCACCGGAAATTGGGGCATTTCCGTTCTCAG  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCTGGAATTTTCTCACTCTGATTCTCGGGACCAGGTCATTGGCCACCGGAAATTGGGGCATTTCCGTTCTCAG  444

Query  247  GACTGGAAATTTGCGCTCCGTGGTTCTTGGGAACAAGACTTTGGCCATCCAGTTTCTCAAGAGTCCTCTTGGTC  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTGGAAATTTGCGCTCCGTGGTTCTTGGGAACAAGACTTTGGCCATCCAGTTTCTCAAGAGTCCTCTTGGTC  518

Query  321  ACAGGAGTATAGTTTTGGTCCCTCTGCAGTTTTGGGGGACTTTGGATCTTCCAGGCTGATTGAGAAAGAGTGTT  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGGAGTATAGTTTTGGTCCCTCTGCAGTTTTGGGGGACTTTGGATCTTCCAGGCTGATTGAGAAAGAGTGTT  592

Query  395  TGGAGAAGGAGAGTCGGGATTATGACGTGGACCATCCTGGGGAGGCTGACTCTGTGCTTAGGGGCAGCAGTCAA  468
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  593  TGGAGAAGGAGAGTCGGGATTATGACGTGGACCATCCTGGGGAGGCTGACTCTGTGCTTAGGGGCGGCAGTCAA  666

Query  469  GTCCAGGCCAGAGGTCGAGCTCTAAACATCGTTGACCAGGAAGGTTCCCTCCTAGGAAAGGGGGAGACTCAGGG  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCCAGGCCAGAGGTCGAGCTCTAAACATCGTTGACCAGGAAGGTTCCCTCCTAGGAAAGGGGGAGACTCAGGG  740

Query  543  CCTGCTCACAGCTAAGGGGGGTGTTGGGAAACTTGTCACATTGAGAAATGTGAGCACAAAAAAAATACCCACCG  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGCTCACAGCTAAGGGGGGTGTTGGGAAACTTGTCACATTGAGAAATGTGAGCACAAAAAAAATACCCACCG  814

Query  617  TGAATCGTATTACTCCCAAAACTCAGGGCACTAACCAAATCCAGAAAAACACTCCAAGTCCTGATGTGACCCTG  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAATCGTATTACTCCCAAAACTCAGGGCACTAACCAAATCCAGAAAAACACTCCAAGTCCTGATGTGACCCTG  888

Query  691  GGGACAAACCCAGGGACAGAAGATATCCAGTTCCCCATTCAGAAGATCCCTCTGGGGCTGGATCTGAAGAATCT  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGACAAACCCAGGGACAGAAGATATCCAGTTCCCCATTCAGAAGATCCCTCTGGGGCTGGATCTGAAGAATCT  962

Query  765  TCGGCTCCCCAGAAGAAAGATGAGCTTTGACATCATAGATAAGTCTGATGTTTTTTCAAGATTTGGGATAGAAA  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGGCTCCCCAGAAGAAAGATGAGCTTTGACATCATAGATAAGTCTGATGTTTTTTCAAGATTTGGGATAGAAA  1036

Query  839  TAATCAAATGGGCAGGATTCCACACCATAAAAGATGATATTAAATTTTCCCAACTTTTCCAGACTCTCTTTGAA  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAATCAAATGGGCAGGATTCCACACCATAAAAGATGATATTAAATTTTCCCAACTTTTCCAGACTCTCTTTGAA  1110

Query  913  CTTGAAACAGAAACCTGTGCTAAAATGCTTGCCTCATTCAAATGTTCCTTAAAACCAGAGCACAGAGATTTTTG  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTGAAACAGAAACCTGTGCTAAAATGCTTGCCTCATTCAAATGTTCCTTAAAACCAGAGCACAGAGATTTTTG  1184

Query  987  CTTTTTTACTATCAAATTTTTAAAGCACTCTGCTTTGAAAACACCCAGAGTTGATAATGAGTTTTTAAACATGC  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTTTTTACTATCAAATTTTTAAAGCACTCTGCTTTGAAAACACCCAGAGTTGATAATGAGTTTTTAAACATGC  1258

Query 1061  TTTTAGACAAAGGTGCTGTGAAGACCAAAAATTGCTTTTTTGAAATCATAAAGCCTTTTGACAAGTACATAATG  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTTAGACAAAGGTGCTGTGAAGACCAAAAATTGCTTTTTTGAAATCATAAAGCCTTTTGACAAGTACATAATG  1332

Query 1135  AGACTTCAAGACCGGCTTCTGAAGAGTGTCACACCTTTGCTTATGGCCTGCAATGCCTACGAGCTAAGTGTCAA  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGACTTCAAGACCGGCTTCTGAAGAGTGTCACACCTTTGCTTATGGCCTGCAATGCCTACGAGCTAAGTGTCAA  1406

Query 1209  GATGAAGACCCTCAGTAACCCCCTGGACTTGGCTCTTGCCCTAGAAACCACCAACTCTCTCTGCCGGAAGTCTT  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATGAAGACCCTCAGTAACCCCCTGGACTTGGCTCTTGCCCTAGAAACCACCAACTCTCTCTGCCGGAAGTCTT  1480

Query 1283  TGGCCCTTTTGGGACAGACATTTTCCTTGGCCTCTTCTTTCCGGCAGGAGAAAATCTTAGAAGCTGTCGGCCTG  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGCCCTTTTGGGACAGACATTTTCCTTGGCCTCTTCTTTCCGGCAGGAGAAAATCTTAGAAGCTGTCGGCCTG  1554

Query 1357  CAAGATATAGCTCCCTCACCTGCTGCGTTTCCAAACTTCGAAGACTCCACTTTGTTTGGGCGAGAGTACATAGA  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAAGATATAGCTCCCTCACCTGCTGCGTTTCCAAACTTCGAAGACTCCACTTTGTTTGGGCGAGAGTACATAGA  1628

Query 1431  CCACCTGAAGGCCTGGCTAGTCAGCAGCGGATGTCCCCTCCAGGTTAAGAAAGCCGAACCAGAGCCGATGCGAG  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCACCTGAAGGCCTGGCTAGTCAGCAGCGGATGTCCCCTCCAGGTTAAGAAAGCCGAACCAGAGCCGATGCGAG  1702

Query 1505  AGGAGGAGAAAATGATTCCTCCTACGAAACCTGAAATTCAGGCCAAGGCTCCAAGTAGTCTGAGTGATGCTGTC  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGAGGAGAAAATGATTCCTCCTACGAAACCTGAAATTCAGGCCAAGGCTCCAAGTAGTCTGAGTGATGCTGTC  1776

Query 1579  CCCCAGCGAGCAGATCACAGGGTAGTGGGCACCATCGACCAGCTTGTGAAACGTGTCATCGAAGGCAGCCTGTC  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCCAGCGAGCAGATCACAGGGTAGTGGGCACCATCGACCAGCTTGTGAAACGTGTCATCGAAGGCAGCCTGTC  1850

Query 1653  TCCCAAAGAGAGAACTCTTCTCAAAGAGGACCCTGCTTACTGGTTTTTGTCTGATGAAAATAGTCTGGAGTATA  1726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCCCAAAGAGAGAACTCTTCTCAAAGAGGACCCTGCTTACTGGTTTTTGTCTGATGAAAATAGTCTGGAGTATA  1924

Query 1727  AATATTACAAGCTGAAGTTGGCAGAAATGCAGCGGATGAGCGAGAACTTGCGAGGAGCCGACCAGAAGCCGACC  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AATATTACAAGCTGAAGTTGGCAGAAATGCAGCGGATGAGCGAGAACTTGCGAGGAGCCGACCAGAAGCCGACC  1998

Query 1801  TCAGCAGACTGTGCAGTGAGGGCCATGCTGTACTCCCGGGCTGTCCGCAACCTCAAGAAGAAACTCCTTCCGTG  1874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCAGCAGACTGTGCAGTGAGGGCCATGCTGTACTCCCGGGCTGTCCGCAACCTCAAGAAGAAACTCCTTCCGTG  2072

Query 1875  GCAGCGGCGGGGGCTCCTCCGTGCTCAAGGGCTCCGGGGCTGGAAGGCGAGGAGAGCGACCACCGGGACCCAGA  1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCAGCGGCGGGGGCTCCTCCGTGCTCAAGGGCTCCGGGGCTGGAAGGCGAGGAGAGCGACCACCGGGACCCAGA  2146

Query 1949  CCCTCCTATCCTCAGGCACCAGGCTGAAACACCACGGCCGGCAGGCTCCAGGCCTCTCACAGGCAAAACCATCC  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCTCCTATCCTCAGGCACCAGGCTGAAACACCACGGCCGGCAGGCTCCAGGCCTCTCACAGGCAAAACCATCC  2220

Query 2023  CTGCCAGACAGAAATGATGCTGCCAAGGACTGCCCGCCAGACCCAGTTGGACCTTCTCCTCAGGACCCCAGCTT  2096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCCAGACAGAAATGATGCTGCCAAGGACTGCCCGCCAGACCCAGTTGGACCTTCTCCTCAGGACCCCAGCTT  2294

Query 2097  AGAAGCCTCAGGCCCATCCCCCAAGCCAGCAGGAGTGGACATCTCTGAAGCACCTCAGACCTCTTCTCCCTGCC  2170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGAAGCCTCAGGCCCATCCCCCAAGCCAGCAGGAGTGGACATCTCTGAAGCACCTCAGACCTCTTCTCCCTGCC  2368

Query 2171  CATCTGCTGACATTGACATGAAGACAATGGAGACTGCAGAGAAACTGGCTAGATTTGTTGCTCAGGTGGGACCA  2244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CATCTGCTGACATTGACATGAAGACAATGGAGACTGCAGAGAAACTGGCTAGATTTGTTGCTCAGGTGGGACCA  2442

Query 2245  GAGATCGAACAATTCAGCATAGAAAACAGCACCGATAACCCTGACCTGTGGTTTCTACATGACCAAAATAGTTC  2318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAGATCGAACAATTCAGCATAGAAAACAGCACCGATAACCCTGACCTGTGGTTTCTACATGACCAAAATAGTTC  2516

Query 2319  TGCTTTCAAATTCTATCGAAAGAAAGTGTTTGAACTATGTCCATCAATTTGTTTCACGTCATCTCCGCACAACC  2392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGCTTTCAAATTCTATCGAAAGAAAGTGTTTGAACTATGTCCATCAATTTGTTTCACGTCATCTCCGCACAACC  2590

Query 2393  TTCACACTGGTGGTGGTGACACCACGGGTTCTCAGGAGAGCCCCGTGGACCTCATGGAAGGGGAAGCAGAGTTT  2466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TTCACACTGGTGGTGGTGACACCACGGGTTCTCAGGAGAGCCCCGTGGACCTCATGGAAGGGGAAGCAGAGTTT  2664

Query 2467  GAAGACGAGCCCCCTCCGCGGGAGGCTGAGCTGGAGAGCCCAG-------------------------------  2509
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 2665  GAAGACGAGCCCCCTCCGCGGGAGGCTGAGCTGGAGAGCCCAGAGGTGATGCCTGAGGAGGAGGACGAGGACGA  2738

Query 2510  --------------------------------------------------------------------------  2509
                                                                                      
Sbjct 2739  TGAGGATGGGGGAGAGGAGGCCCCCGCTCCTGGAGGGGCGGGCAAGTCTGAGGGCAGCACCCCTGCCGACGGCC  2812

Query 2510  ---------------------------------------------------AGGCCTCCTCAGGTACCTGCTTC  2532
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TTCCCGGCGAGGCTGCCGAGGACGACCTGGCTGGAGCACCTGCCTTGTCACAGGCCTCCTCAGGTACCTGCTTC  2886

Query 2533  CCTCGGAAGAGGATCAGCAGCAAGTCATTGAAGGTTGGCATGATTCCAGCTCCCAAGAGAGTGTGTCTCATCCA  2606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CCTCGGAAGAGGATCAGCAGCAAGTCATTGAAGGTTGGCATGATTCCAGCTCCCAAGAGAGTGTGTCTCATCCA  2960

Query 2607  GGAGCCAAAAGTCCATGAACCAGTTCGAATTGCCTATGACAGGCCTCGGGGTCGTCCCATGTCCAAAAAGAAGA  2680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GGAGCCAAAAGTCCATGAACCAGTTCGAATTGCCTATGACAGGCCTCGGGGTCGTCCCATGTCCAAAAAGAAGA  3034

Query 2681  AACCCAAGGACTTGGACTTCGCCCAGCAGAAGCTGACCGATAAGAACCTGGGCTTCCAGATGCTGCAGAAGATG  2754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AACCCAAGGACTTGGACTTCGCCCAGCAGAAGCTGACCGATAAGAACCTGGGCTTCCAGATGCTGCAGAAGATG  3108

Query 2755  GGCTGGAAGGAGGGCCATGGCCTGGGCTCCCTCGGAAAGGGCATCAGGGAGCCGGTCAGCGTGTACGCAGCAGG  2828
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||
Sbjct 3109  GGCTGGAAGGAGGGCCATGGCCTGGGCTCCCTCGGAAAGGGCATCAGGGAGCCGGTCAGCGTG---------GG  3173

Query 2829  --CAGCCTGGGGTGGGAGTGGGTGGGGCCTCAGTCCTTCCACCTGCAGCCTGCCGCTTGGCTCCTTCACAGCCA  2900
              |..|||.||..|||...||||.|||                ||    |||.||   |||.....||||   |
Sbjct 3174  AACCCCCTCGGAAGGGGAAGGGTTGGG----------------TG----CTGACG---GGCAGGAGCACA---A  3221

Query 2901  AGATGGCTTACAGCTGGCAGTTGATTTTTGTTTTTTAAACAGAAGGCAT-CTTCAGATG-------AGAAGC--  2964
            |||.|    |||     ||.|.|||     .|.||...|||||  |.|| .|.||||||       |.||||  
Sbjct 3222  AGAAG----ACA-----CATTCGAT-----GTGTTCCGACAGA--GGATGATGCAGATGTACAGACACAAGCGG  3279

Query 2965  ---------  2964
                     
Sbjct 3280  GCCAACAAA  3288