Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477266
• Subject: NM_004522.3
• Aligned Length: 2878
• Identities: 2164
• Gaps: 710

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGATCCAGCCGAATGCAGCATCAAAGTGATGTGCCGGTTCCGGCCCCTCAACGAAGCGGAGATCCTCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGGGGACAAATTCATCCCCAAATTTAAAGGCGATGAGACCGTGGTGATCGGGCAAGGGAAGCCATATGTCTTCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACAGAGTGCTACCTCCCAACACGACCCAAGAGCAGGTTTACAATGCATGTGCGAAGCAAATTGTCAAAGATGTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CTTGAAGGTTATAACGGGACGATTTTTGCGTATGGGCAGACTTCATCAGGAAAAACCCACACCATGGAGGGGAA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GCTGCATGACCCCCAGCTCATGGGGATCATCCCACGAATTGCCCATGATATCTTTGACCATATCTACTCCATGG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  ATGAGAACCTGGAGTTTCACATAAAGGTTTCCTATTTTGAGATCTACTTGGACAAAATAAGGGACTTACTTGAT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  GTATCCAAGACCAACTTGGCTGTTCATGAAGATAAAAACAGAGTCCCGTATGTAAAGGGGTGCACTGAGCGGTT  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  TGTGTCGAGCCCTGAGGAAGTCATGGATGTAATAGATGAAGGCAAAGCAAACCGACACGTGGCTGTGACAAACA  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  TGAATGAACACAGCTCTAGAAGTCACAGTATCTTCCTGATAAATATTAAACAAGAGAATGTAGAGACTGAAAAA  666

Query    1  ------------------------------ATGGCCACTT-------ACATCCACGTCAGCAAAACTGGTGCCG  37
                                          .||||    |       |.|   |.|||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAACTCAGTGGGAAACTTTATTTGGTTGATTTGGC----TGGGAGCGAAA---AGGTCAGCAAAACTGGTGCCG  733

Query   38  AGGGAGCTGTTCTTGACGAAGCTAAAAATATCAATAAGTCTTTGTCTGCTCTTGGAAATGTGATCTCTGCTTTG  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  AGGGAGCTGTTCTTGACGAAGCTAAAAATATCAATAAGTCTTTGTCTGCTCTTGGAAATGTGATCTCTGCTTTG  807

Query  112  GCAGAAGGGACAAAAACACATGTGCCATACCGGGACAGCAAGATGACTCGGATTCTTCAGGACTCTTTGGGTGG  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  GCAGAAGGGACAAAAACACATGTGCCATACCGGGACAGCAAGATGACTCGGATTCTTCAGGACTCTTTGGGTGG  881

Query  186  GAACTGCAGAACCACCATCGTCATTTGCTGTTCTCCTTCTGTCTTCAATGAGGCTGAGACCAAGTCCACACTGA  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  GAACTGCAGAACCACCATCGTCATTTGCTGTTCTCCTTCTGTCTTCAATGAGGCTGAGACCAAGTCCACACTGA  955

Query  260  TGTTCGGACAGAGAGCTAAGACCATCAAGAATACAGTCTCTGTGAACCTAGAACTGACAGCAGAAGAATGGAAG  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  TGTTCGGACAGAGAGCTAAGACCATCAAGAATACAGTCTCTGTGAACCTAGAACTGACAGCAGAAGAATGGAAG  1029

Query  334  AAGAAATATGAAAAAGAGAAAGAGAAAAACAAGACTTTGAAGAATGTTATCCAGCATCTGGAGATGGAGCTAAA  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  AAGAAATATGAAAAAGAGAAAGAGAAAAACAAGACTTTGAAGAATGTTATCCAGCATCTGGAGATGGAGCTAAA  1103

Query  408  CAGGTGGAGGAATGGAGAAGCTGTGCCTGAGGATGAACAGATCAGTGCCAAGGACCAGAAGAACCTGGAGCCTT  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  CAGGTGGAGGAATGGAGAAGCTGTGCCTGAGGATGAACAGATCAGTGCCAAGGACCAGAAGAACCTGGAGCCTT  1177

Query  482  GTGATAACACCCCCATCATAGACAATATTGCTCCTGTTGTTGCTGGCATCTCTACAGAGGAGAAAGAGAAGTAC  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  GTGATAACACCCCCATCATAGACAATATTGCTCCTGTTGTTGCTGGCATCTCTACAGAGGAGAAAGAGAAGTAC  1251

Query  556  GATGAGGAGATCTCCAGTCTCTACAGACAACTGGATGACAAGGATGATGAAATTAACCAGCAGAGCCAGCTGGC  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  GATGAGGAGATCTCCAGTCTCTACAGACAACTGGATGACAAGGATGATGAAATTAACCAGCAGAGCCAGCTGGC  1325

Query  630  TGAAAAGCTGAAGCAACAGATGTTGGATCAGGATGAGCTTTTAGCTTCCACAAGAAGAGACTATGAGAAGATAC  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  TGAAAAGCTGAAGCAACAGATGTTGGATCAGGATGAGCTTTTAGCTTCCACAAGAAGAGACTATGAGAAGATAC  1399

Query  704  AGGAGGAGCTGACACGTCTCCAGATTGAAAATGAGGCAGCCAAGGATGAGGTGAAAGAAGTTCTCCAGGCCCTG  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  AGGAGGAGCTGACACGTCTCCAGATTGAAAATGAGGCAGCCAAGGATGAGGTGAAAGAAGTTCTCCAGGCCCTG  1473

Query  778  GAGGAGCTGGCTGTCAATTATGACCAGAAATCACAGGAAGTGGAGGATAAGACCCGGGCCAATGAGCAGCTGAC  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  GAGGAGCTGGCTGTCAATTATGACCAGAAATCACAGGAAGTGGAGGATAAGACCCGGGCCAATGAGCAGCTGAC  1547

Query  852  AGACGAGCTGGCCCAGAAAACGACTACATTGACAACCACACAGAGAGAGCTGAGCCAGCTACAAGAGCTTAGCA  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548  AGACGAGCTGGCCCAGAAAACGACTACATTGACAACCACACAGAGAGAGCTGAGCCAGCTACAAGAGCTTAGCA  1621

Query  926  ACCACCAGAAGAAAAGGGCAACTGAGATCCTGAATTTGCTGTTGAAAGATCTGGGGGAGATAGGTGGAATTATT  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  ACCACCAGAAGAAAAGGGCAACTGAGATCCTGAATTTGCTGTTGAAAGATCTGGGGGAGATAGGTGGAATTATT  1695

Query 1000  GGCACCAATGATGTGAAAACTTTGGCAGATGTGAATGGAGTCATTGAGGAGGAGTTTACCATGGCCCGCCTGTA  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696  GGCACCAATGATGTGAAAACTTTGGCAGATGTGAATGGAGTCATTGAGGAGGAGTTTACCATGGCCCGCCTGTA  1769

Query 1074  CATCAGCAAGATGAAGTCAGAGGTCAAGTCCCTGGTGAACCGCAGCAAACAGCTCGAGAGCGCCCAGATGGACT  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770  CATCAGCAAGATGAAGTCAGAGGTCAAGTCCCTGGTGAACCGCAGCAAACAGCTCGAGAGCGCCCAGATGGACT  1843

Query 1148  CCAACAGGAAGATGAATGCCAGCGAGCGGGAGCTGGCAGCCTGCCAGCTGCTCATCTCCCAGCACGAAGCCAAG  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1844  CCAACAGGAAGATGAATGCCAGCGAGCGGGAGCTGGCAGCCTGCCAGCTGCTCATCTCCCAGCACGAAGCCAAG  1917

Query 1222  ATCAAGTCTCTGACAGACTACATGCAGAACATGGAACAGAAGAGGAGGCAGCTAGAAGAGTCCCAGGACTCGCT  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918  ATCAAGTCTCTGACAGACTACATGCAGAACATGGAACAGAAGAGGAGGCAGCTAGAAGAGTCCCAGGACTCGCT  1991

Query 1296  CAGCGAAGAGCTGGCAAAGCTCCGATCCCAGGAAAAAATGCACGAAGTCAGCTTCCAGGATAAGGAGAAGGAAC  1369
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992  CAGCGAAGAGCTGGCAAAGCTCCGAGCCCAGGAAAAAATGCACGAAGTCAGCTTCCAGGATAAGGAGAAGGAAC  2065

Query 1370  ATCTGACGCGGTTGCAGGATGCTGAAGAAATGAAGAAGGCGCTGGAGCAGCAGATGGAGAGCCACCGGGAAGCT  1443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066  ATCTGACGCGGTTGCAGGATGCTGAAGAAATGAAGAAGGCGCTGGAGCAGCAGATGGAGAGCCACCGGGAAGCT  2139

Query 1444  CACCAGAAGCAGCTGTCCAGACTCCGAGACGAAATTGAGGAGAAGCAGAAAATCATTGATGAGATTCGGGATTT  1517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140  CACCAGAAGCAGCTGTCCAGACTCCGAGACGAAATTGAGGAGAAGCAGAAAATCATTGATGAGATTCGGGATTT  2213

Query 1518  GAATCAGAAACTGCAACTGGAACAGGAGAAGCTTAGTTCTGATTATAACAAGCTGAAAATAGAGGACCAAGAGA  1591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214  GAATCAGAAACTGCAACTGGAACAGGAGAAGCTTAGTTCTGATTATAACAAGCTGAAAATAGAGGACCAAGAGA  2287

Query 1592  GAGAAATGAAGCTGGAAAAGCTCTTATTGCTCAACGATAAAAGGGAACAAGCCAGAGAAGACCTCAAAGGGCTG  1665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288  GAGAAATGAAGCTGGAAAAGCTCTTATTGCTCAACGATAAAAGGGAACAAGCCAGAGAAGACCTCAAAGGGCTG  2361

Query 1666  GAGGAGACAGTGTCTAGAGAATTGCAGACACTGCACAACCTTCGGAAACTCTTTGTCCAGGATCTGACCACCCG  1739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2362  GAGGAGACAGTGTCTAGAGAATTGCAGACACTGCACAACCTTCGGAAACTCTTTGTCCAGGATCTGACCACCCG  2435

Query 1740  AGTTAAAAAAAGTGTGGAGTTGGACAACGATGATGGAGGGGGCAGTGCTGCCCAGAAGCAGAAAATTTCCTTCT  1813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436  AGTTAAAAAAAGTGTGGAGTTGGACAACGATGATGGAGGGGGCAGTGCTGCCCAGAAGCAGAAAATTTCCTTCT  2509

Query 1814  TGGAGAATAACCTGGAGCAGCTCACCAAAGTTCACAAGCAGCTGGTCCGGGACAACGCAGACCTGCGCTGTGAA  1887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510  TGGAGAATAACCTGGAGCAGCTCACCAAAGTTCACAAGCAGCTGGTCCGGGACAACGCAGACCTGCGCTGTGAA  2583

Query 1888  CTGCCCAAGCTGGAGAAGCGGCTGCGTGCCACGGCGGAGCGCGTCAAGGCTCTGGAGAGCGCGCTGAAGGAGGC  1961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2584  CTGCCCAAGCTGGAGAAGCGGCTGCGTGCCACGGCGGAGCGCGTCAAGGCTCTGGAGAGCGCGCTGAAGGAGGC  2657

Query 1962  CAAGGAGAACGCCATGCGGGACCGTAAGCGCTACCAGCAGGAGGTGGATCGTATCAAGGAGGCCGTGCGGGCCA  2035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658  CAAGGAGAACGCCATGCGGGACCGTAAGCGCTACCAGCAGGAGGTGGATCGTATCAAGGAGGCCGTGCGGGCCA  2731

Query 2036  AGAACATGGCCAGAAGGGCCCATTCAGCCCAGATCGCCAAGCCCATCCGCCCCGGACACTACCCGGCCTCATCT  2109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732  AGAACATGGCCAGAAGGGCCCATTCAGCCCAGATCGCCAAGCCCATCCGCCCCGGACACTACCCGGCCTCATCT  2805

Query 2110  CCAACGGCCGTCCATGCCATTCGAGGGGGAGGAGGCAGCTCTTCAAATTCCACTCACTACCAGAAA  2175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806  CCAACGGCCGTCCATGCCATTCGAGGGGGAGGAGGCAGCTCTTCAAATTCCACTCACTACCAGAAA  2871