Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477822
- Subject:
- XM_017002069.2
- Aligned Length:
- 2281
- Identities:
- 1739
- Gaps:
- 530
Alignment
Query 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC 74
Query 75 TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG 148
Query 149 GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA 222
Query 223 TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT 296
Query 297 AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA 370
Query 371 TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG 444
Query 445 ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTG 518
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTG--------------------------------------------------- 467
Query 519 TAACTATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGTGAATGAACTCATTCTTAAACAGAAGC 592
Sbjct 468 -------------------------------------------------------------------------- 467
Query 593 AAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCAGTGAGTAGCACCAATGGCCACAGGTGGCAGATATTT 666
Sbjct 468 -------------------------------------------------------------------------- 467
Query 667 CAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTCAATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCA 740
Sbjct 468 -------------------------------------------------------------------------- 467
Query 741 GAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468 ----------------------GAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 519
Query 815 GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG 888
|||||||||||||||
Sbjct 520 GAAGAAATAAGAGAG----------------------------------------------------------- 534
Query 889 GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC 962
Sbjct 535 -------------------------------------------------------------------------- 534
Query 963 ACACAGTAGTATTATTGATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 ----AGTAGTATTATTGATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAAC 604
Query 1037 AGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 AGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGT 678
Query 1111 TACTTTTCTACAAGGATGTCTCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 TACTTTTCTACAAGGATGTCTCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATG 752
Query 1185 CTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 753 CTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATG 826
Query 1259 GTTCCAGTATAGTCTCTAGTATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 827 GTTCCAGTATAGTCTCTAGTATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAG 900
Query 1333 ATTAAAGTCTATGAATATGACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATTAAAGTCTATGAATATGACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTG 974
Query 1407 CAATTCGAAAATCAGCTGTATCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 CAATTCGAAAATCAGCTGTATCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCA 1048
Query 1481 CTGTTATTTTATGGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049 CTGTTATTTTATGGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGT 1122
Query 1555 GTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 GTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTAC 1196
Query 1629 CAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 CAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCA 1270
Query 1703 GATACCATTTGGCTTTCGGCTGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 GATACCATTTGGCTTTCGGCTGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATC 1344
Query 1777 ATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 ATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTC 1418
Query 1851 AACAGACAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419 AACAGACAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATG 1492
Query 1925 AAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 AAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTG 1566
Query 1999 TACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1567 TACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCG 1640
Query 2073 AAAAGAAGATGATACAAATGAATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGGAGTCC---AATG 2143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| ||| |||
Sbjct 1641 AAAAGAAGATGATACAAATGAATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGTA-TCCTAGAAT- 1712
Query 2144 TGC-TG-----------------ATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGTGC--------------TAG 2185
||| || ||..||| |.||| |.||||...||.|| |||
Sbjct 1713 TGCATGGGAGAAGCAAAGATCCCATCTCTG-TCACA-------TCCAATCTTGGAGCCACCGGTGGAAATTTAG 1778
Query 2186 AATTGGTA----------------------------------------------------- 2193
||.||..|
Sbjct 1779 AAGTGCCAAAGTGTTTCCAACAGTCGCTGCCGCAAACCTATTCTTTCTTTACAGGAGTGAT 1839