Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477949
• Subject: XM_005256026.2
• Aligned Length: 2262
• Identities: 1820
• Gaps: 441

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGCAATGGGAGCTGGACGAGGAAGGCATTCGCCGCCTGGGGGCGCTGACGCTGGAGCAGCCGGAACT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGAGCAATGGGAGCTGGACGAGGAAGGCATTCGCCGCCTGGGGGCGCTGACGCTGGAGCAGCCGGAACT  74

Query   75  GGTGGAGTCTCTTTCATTGCAGGGATCTTATGCTGGCAAAATCCATTCCATTAGTGATGCCTTCAGAAATTTTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGGAGTCTCTTTCATTGCAGGGATCTTATGCTGGCAAAATCCATTCCATTGGTGATGCCTTCAGAAATTTTA  148

Query  149  AAAATCTCCGATCCTTAGATTTATCAAGGAATTTGATCACTAGCCTTAAGGGAATCCAGTATTTATGTTCACTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAATCTCCGATCCTTAGATTTATCAAGGAATTTGATCACTAGCCTTAAGGGAATCCAGTATTTATGTTCACTC  222

Query  223  CAAGACCTGAATTTATATTATAACAACATTCCTTCATTAGTGGAAGTGTCCCGTCTACAACCGTTACCCTTCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGACCTGAATTTATATTATAACAACATTCCTTCATTAGTGGAAGTGTCCCGTCTACAACCGTTACCCTTCCT  296

Query  297  CAAAGAACTGGATTTGAGACTTAATCCTGTTGTAAGGAAAGATACAGATTATAGGCTCTTTGCTGTATATACAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAAGAACTGGATTTGAGACTTAATCCTGTTGTAAGGAAAGATACAGATTATAGGCTCTTTGCTGTATATACAC  370

Query  371  TACAAACTCTGGAGAAATTAGATGACCGAACTGTACGTGAAGGTGAGAGAAAAGCTGCCAAGCTGCATTTTAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACAAACTCTGGAGAAATTAGATGACCGAACTGTACGTGAAGGTGAGAGAAAAGCTGCCAAGCTGCATTTTAGT  444

Query  445  CAGTTGGGCAACAGTGAAAATTTTCTTTTAGAGGTGGAAAAAAGCTCTAGGGAGAAGACAATGAAAAACTGTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTTGGGCAACAGTGAAAATTTTCTTTTAGAGGTGGAAAAAAGCTCTAGGGAGAAGACAATGAAAAACTGTGT  518

Query  519  AACAGGTGAGAGCTCTGCATCAAAAGTCAGTGCTAATGTTGACAGCAGGATTGAAATGGACTCAAACAAAGGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACAGGTGAGAGCTCTGCATCAAAAGTCAGTGCTAATGTTGACAGCAGGATTGAAATGGACTCAAACAAAGGAC  592

Query  593  TTTTTATTCCCTTCCCCAACCGGGAAATAAAGGATTCCCTAAGTACTTCTGCAACTCAGGGCAATGGTACACGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTTATTCCCTTCCCCAACCGGGAAATAAAGGATTCCCTAAGTACTTCTGCAACTCAGGGCAATGGTACACGT  666

Query  667  GATCAGAAATTAGACACCTTCCCACTGGGGACACAGACACAGGAAGTAGCAAGAAGGGAGATGCCAAGTGACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCAGAAATTAGACACCTTCCCACTGGGGACACAGACACAGGAAGTAGCAAGAAGGGAGATGCCAAGTGACAA  740

Query  741  TCACCAGGAAGATGAGTTCAGACACTACTCGCCTCGTCAGTCCACAGTCCGATCCCCAGAGAAGATGACTAGAG  814
            |||||||||||||                                                             
Sbjct  741  TCACCAGGAAGAT-------------------------------------------------------------  753

Query  815  AAGGGTACCAAGTATCTTTTTTGGACAATAAGTCTTCAGGTTCTTCTCCAGAAAAGGAATTGATACCAAAACCT  888
                                                                                      
Sbjct  754  --------------------------------------------------------------------------  753

Query  889  GATACTTTTCATCTTACCCATGATGCCTCATTGAGTAAATGCCTGGATGTGGGTGATTCTAGCCAGATCCATCC  962
                                                                                      
Sbjct  754  --------------------------------------------------------------------------  753

Query  963  CTATCAGTTACCTTCAGATGTTGGTCTGGAAAATTATGACAGTTGTTATTCTCAAACTCTATCCCTGCATGGAA  1036
                                                                                      
Sbjct  754  --------------------------------------------------------------------------  753

Query 1037  GTCTTGGTAAAAGGCCTCAGAGAAGCAAGAACTATCAAGAGTATAGCATAAAGCCTTCAAATGACATAAAGACC  1110
                                                                                      
Sbjct  754  --------------------------------------------------------------------------  753

Query 1111  ACCGCTTCACATTCCTGTGGAGACTTATTAACTTCTCTGTCAAACCCTGACTCCAGCACTGGAAGGCTTTTGAA  1184
                                                                                      
Sbjct  754  --------------------------------------------------------------------------  753

Query 1185  GCTTAGTTCAGATCTGTATGCCACAACCCATTTCAACAGTGACCCTGCTGTACTTGTCAATGTAGAGCAACAAT  1258
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  ----------GATCTGTATGCCACAACCCATTTCAACAGTGACCCTGCTGTACTTGTCAATGTAGAGCAACAAT  817

Query 1259  TATCTACCAGCCTGGATGATTTAACACCAGCACATGGTTCTGTCCCAAACAACGCTGTCCTGGGAAACAGGACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  818  TATCTACCAGCCTGGATGATTTAACACCAGCACATGGTTCTGTCCCAAACAACGCTGTCCTGGGAAACAGGACA  891

Query 1333  ACTCCTCTGCGGACACTGCTGTTGTCTCCTGGGACTTCAGAACACAGAAAGATTTTTACCAAGAGGTCACTAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  892  ACTCCTCTGCGGACACTGCTGTTGTCTCCTGGGACTTCAGAACACAGAAAGATTTTTACCAAGAGGTCACTAAG  965

Query 1407  CCCATCGAAGAGAGGATTCAAATGGAAGGACAATATCCTTGCCAACCTGAATCTAAAGCATGGTTTCCAAGATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  966  CCCATCGAAGAGAGGATTCAAATGGAAGGACAATATCCTTGCCAACCTGAATCTAAAGCATGGTTTCCAAGATG  1039

Query 1481  CTACAGGCAGCGAGCCTCTCTCTAGTGACCTGGGTAGTTTGCACGGTTTGGCTGGAAACCACAGTCCCCCCATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040  CTACAGGCAGCGAGCCTCTCTCTAGTGACCTGGGTAGTTTGCACGGTTTGGCTGGAAACCACAGTCCCCCCATC  1113

Query 1555  TCTGCCAGAACCCCCCATGTGGCCACTGTCCTCAGACAGCTCCTGGAGCTTGTGGATAAGCACTGGAATGGCTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114  TCTGCCAGAACCCCCCATGTGGCCACTGTCCTCAGACAGCTCCTGGAGCTTGTGGATAAGCACTGGAATGGCTC  1187

Query 1629  CGGCTCCCTCCTCCTCAACAAGAAGTTTCTCGGTCCTGCCCGAGATTTGCTTCTGTCTTTGGTAGTCCCGGCTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188  CGGCTCCCTCCTCCTCAACAAGAAGTTTCTCGGTCCTGCCCGAGATTTGCTTCTGTCTTTGGTAGTCCCGGCTC  1261

Query 1703  CTTCTCAGCCGAGGTGTTGCTCACATCCTGAAGACACGATGAAAGCATTCTGCAGGAGGGAGCTTGAACTGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262  CTTCTCAGCCGAGGTGTTGCTCACATCCTGAAGACACGATGAAAGCATTCTGCAGGAGGGAGCTTGAACTGAAG  1335

Query 1777  GAGGCTGCGCAGCTGGTCCCTAATGACATGGAAAGTTTGAAGCAAAAACTGGTCAGAGTGCTGGAGGAAAACCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336  GAGGCTGCGCAGCTGGTCCCTAATGACATGGAAAGTTTGAAGCAAAAACTGGTCAGAGTGCTGGAGGAAAACCT  1409

Query 1851  CATTTTGTCAGAAAAAATTCAACAGTTGGAGGAAGGTGCTGCCATCTCAATTGTGAGTGGGCAACAGTCACATA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410  CATTTTGTCAGAAAAAATTCAACAGTTGGAGGAAGGTGCTGCCATCTCAATTGTGAGTGGGCAACAGTCACATA  1483

Query 1925  CTTATGATGATCTTCTGCACAAAAACCAACAGCTGACCATGCAGGTGGCTTGCCTGAACCAGGAGCTTGCCCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484  CTTATGATGATCTTCTGCACAAAAACCAACAGCTGACCATGCAGGTGGCTTGCCTGAACCAGGAGCTTGCCCAG  1557

Query 1999  CTGAAAAAGCTGGAGAAGACAGTTGCCATTCTCCATGAAAGTCAGAGATCCCTGGTGGTAACTAATGAGTATCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558  CTGAAAAAGCTGGAGAAGACAGTTGCCATTCTCCATGAAAGTCAGAGATCCCTGGTGGTAACTAATGAGTATCT  1631

Query 2073  GCTGCAGCAGCTGAATAAGGAGCCAAAAGGTTATTCCGGGAAAGCGCTCCTGCCTCCTGAGAAGGGTCATCATC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632  GCTGCAGCAGCTGAATAAGGAGCCAAAAGGTTATTCCGGGAAAGCGCTCCTGCCTCCTGAGAAGGGTCATCATC  1705

Query 2147  TGGGGAGATCATCGCCCTTTGGGAAAAGCACGTTGTCTTCCTCCTCACCAGTGGCACATGAGACTGGTCAGTAT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706  TGGGGAGATCATCGCCCTTTGGGAAAAGCACGTTGTCTTCCTCCTCACCAGTGGCACATGAGACTGGTCAGTAT  1779

Query 2221  CTAATACAGAGCGTCTTGGATGCTGCCCCAGAGCCTGGCTTA  2262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780  CTAATACAGAGCGTCTTGGATGCTGCCCCAGAGCCTGGCTTA  1821