Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477984
• Subject: NM_026278.3
• Aligned Length: 1045
• Identities: 861
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGAAGTTGACCAGTGAAAAGTTGCCCAAGAACCCCTTTTATGCCTCTGTATCTCAGTATGCTGCTAAAAACCA  74
            ||||||.|||.|||.||.|||||||||||.|||||.||      ||||.|.||||||||||||||.|||.|.||
Sbjct    1  ATGAAGCTGAGCAGCGAGAAGTTGCCCAAAAACCCTTT------CTCTCTGTCTCAGTATGCTGCCAAACAACA  68

Query   75  AAAATTCTTCCAGTGGAAAAAGGAAAAGAC---TGATTACACCCATGCTAATTTGGTGGATAAGGCATTGCAGC  145
            .|||||||||||||||||.|||||||||.|   |.|||||..|||.||||||||||||||||..|||||||||.
Sbjct   69  GAAATTCTTCCAGTGGAAGAAGGAAAAGCCCGATTATTACCTCCACGCTAATTTGGTGGATACAGCATTGCAGT  142

Query  146  TCTTGAAGGAAAGAATACTGAA-AGGAGACACTCTGGCATATTTCCTACGAGGTCAACTATATTTTGAAGAGGG  218
            ||.||||.||||||||| .||| |||.||..||.||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  143  TCCTGAAAGAAAGAATA-AGAAGAGGGGATGCTATGGCATATTTTCTAAGAGGCCAACTCTATTTTGAAGAGGG  215

Query  219  ATGGTATGAAGAAGCATTAGAACAGTTTGAAGAAATCAAGGAGAAAGACCATCAAGCAACTTACCAGCTAGGAG  292
            .||||||||||||||.||.|.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct  216  CTGGTATGAAGAAGCCTTGGCACAGTTTGAGGAAATCCAGGAGAAAGACCATCAAGCAATTTATCAGCTAGGAG  289

Query  293  TGATGTACTATGATGGGCTGGGGACCACTCTAGACGCTGAGAAAGGGGTGGACTATATGAAGAAAATTCTTGAT  366
            |||||||.|||||||||||||||||||.|..|.|.|||||.|||||.|||.|.|||||||.|||.||.||.||.
Sbjct  290  TGATGTATTATGATGGGCTGGGGACCATTGCAAATGCTGAAAAAGGAGTGAATTATATGAGGAAGATCCTCGAC  363

Query  367  TCTCCATGTCCCAAAGCAAGACACTTAAAATTTGCAGCTGCTTACAACCTCGGAAGAGCTTATTATGAAGGAAA  440
            |||.||||.|||.|..|||..|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct  364  TCTTCATGCCCCCAGACAATGCACTTGAAATTCGCTGCTGCTTACAACCTCGGGAGAGCTTATTTTGAAGGAAA  437

Query  441  AGGTGTTAAACGATCAAATGAGGAAGCTGAAAGACTGTGGCTTATCGCAGCAGACAATGGAAATCCCAAAGCTA  514
            .||.||.||.||||||.||||||||||.||.|||||||||||..|.||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  438  GGGGGTGAAGCGATCAGATGAGGAAGCAGAGAGACTGTGGCTGCTTGCTGCCGACAATGGAAACCCAAAAGCTA  511

Query  515  GTGTGAAGGCTCAAAGTATGCTCGGGCTGTATTACTCAACCAAGGAGCCCAAGGAGTTAGAAAAGGCATTTTAC  588
            ||||||||||.||||||||.||.||..|||.|||.||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||||.|
Sbjct  512  GTGTGAAGGCGCAAAGTATTCTAGGATTGTTTTATTCAATGAAAGAGCCCAAAGAGTTGGAAAAGGCATTTTTC  585

Query  589  TGGCATTCCGAAGCATGTGGCAATGGGAATCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGGCTCATGTACTTGTATGGACA  662
            ||||||||.|||||.||||||||.||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  586  TGGCATTCGGAAGCTTGTGGCAACGGAAGTCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGTCTCATGTACTTTTACGGACA  659

Query  663  AGGCATCCGGCAGGATACGGAAGCTGCCCTGCAGTGCTTAAGAGAAGCAGCAGAACGCGGAAACGTCTATGCTC  736
            .||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||.|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct  660  GGGAATCCGCCAAGACACTGATGCCGCCCTGCACTGCTTACGGGAAGCAGCTGAGCGAGGGAATGTCTATGCCC  733

Query  737  AAGGGAATCTCGTGGAGTATTACTATAAGATGAAATTTTTTACAAAGTGTGTTGCATTTTCCAAAAGGATCGCT  810
            |.||||.|||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.||.
Sbjct  734  AGGGGACTCTTGTGGAATACTACTACAAGATGAAGTTTTTTACCAAGTGTGTTTCGTTTTCCAAAAGGATAGCA  807

Query  811  GACTATGATGAGGTTCACGACATCCCCATGATCGCCCAGGTCACAGACTGTCTCCCGGAGTTCATCGGCAGAGG  884
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||..||.|||
Sbjct  808  GACTATGATGAAGTCCACGACATCCCCATGATAGCCCACGTCACGGACTGTCTCCCAGAGTTTATCATCAAAGG  881

Query  885  CATGGCAATGGCATCCTTCTACCACGCAAGGTGTCTTCAGCTTGGCTTGGGCATCACCAGGGATGAAACAACCG  958
            ||||||.|||||..|.||||||||||...|.|||||.|||||.|||||.|||||||..|..||.|||..|.|.|
Sbjct  882  CATGGCCATGGCGGCTTTCTACCACGGGCGCTGTCTCCAGCTGGGCTTAGGCATCATGAAAGACGAAGAATCTG  955

Query  959  CTAAACACTATTATTCTAAAGCTTGTCGTCTGAATCCCGCATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTTATTCGT  1032
            |.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||||..
Sbjct  956  CCAAGCACTACTACTCTAAAGCTTGCCGTCTGAACCCTACATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTCATTCAC  1029

Query 1033  CAAAGAATT  1041
            ||.||||||
Sbjct 1030  CAGAGAATT  1038