Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477984
• Subject: XM_011532110.3
• Aligned Length: 1042
• Identities: 940
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ATGAAGTTGACCAGTGAAAAGTTGCCCAAGAACCCCTTTTATGCCTCTGTATCTCAGTATGCTGCTAAAAACCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAAATTCTTCCAGTGGAAAAAGGAAAAGACTG-ATTACACCCATGCTAATTTGGTGGATAAGGCATTGCAGCTC  147
                                     |.|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------ATGA-TGAATTACACCCATGCTAATTTGGTGGATAAGGCATTGCAGCTC  48

Query  148  TTGAAGGAAAGAATACTGAAAGGAGACACTCTGGCATATTTCCTACGAGGTCAACTATATTTTGAAGAGGGATG  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   49  TTGAAGGAAAGAATACTGAAAGGAGACACTCTGGCATATTTCCTACGAGGTCAACTATATTTTGAAGAGGGATG  122

Query  222  GTATGAAGAAGCATTAGAACAGTTTGAAGAAATCAAGGAGAAAGACCATCAAGCAACTTACCAGCTAGGAGTGA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  123  GTATGAAGAAGCATTAGAACAGTTTGAAGAAATCAAGGAGAAAGACCATCAAGCAACTTACCAGCTAGGAGTGA  196

Query  296  TGTACTATGATGGGCTGGGGACCACTCTAGACGCTGAGAAAGGGGTGGACTATATGAAGAAAATTCTTGATTCT  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  197  TGTACTATGATGGGCTGGGGACCACTCTAGACGCTGAGAAAGGGGTGGACTATATGAAGAAAATTCTTGATTCT  270

Query  370  CCATGTCCCAAAGCAAGACACTTAAAATTTGCAGCTGCTTACAACCTCGGAAGAGCTTATTATGAAGGAAAAGG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271  CCATGTCCCAAAGCAAGACACTTAAAATTTGCAGCTGCTTACAACCTCGGAAGAGCTTATTATGAAGGAAAAGG  344

Query  444  TGTTAAACGATCAAATGAGGAAGCTGAAAGACTGTGGCTTATCGCAGCAGACAATGGAAATCCCAAAGCTAGTG  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  TGTTAAACGATCAAATGAGGAAGCTGAAAGACTGTGGCTTATCGCAGCAGACAATGGAAATCCCAAAGCTAGTG  418

Query  518  TGAAGGCTCAAAGTATGCTCGGGCTGTATTACTCAACCAAGGAGCCCAAGGAGTTAGAAAAGGCATTTTACTGG  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  TGAAGGCTCAAAGTATGCTCGGGCTGTATTACTCAACCAAGGAGCCCAAGGAGTTAGAAAAGGCATTTTACTGG  492

Query  592  CATTCCGAAGCATGTGGCAATGGGAATCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGGCTCATGTACTTGTATGGACAAGG  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  CATTCCGAAGCATGTGGCAATGGGAATCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGGCTCATGTACTTGTATGGACAAGG  566

Query  666  CATCCGGCAGGATACGGAAGCTGCCCTGCAGTGCTTAAGAGAAGCAGCAGAACGCGGAAACGTCTATGCTCAAG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  CATCCGGCAGGATACGGAAGCTGCCCTGCAGTGCTTAAGAGAAGCAGCAGAACGCGGAAACGTCTATGCTCAAG  640

Query  740  GGAATCTCGTGGAGTATTACTATAAGATGAAATTTTTTACAAAGTGTGTTGCATTTTCCAAAAGGATCGCTGAC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  GGAATCTCGTGGAGTATTACTATAAGATGAAATTTTTTACAAAGTGTGTTGCATTTTCCAAAAGGATCGCTGAC  714

Query  814  TATGATGAGGTTCACGACATCCCCATGATCGCCCAGGTCACAGACTGTCTCCCGGAGTTCATCGGCAGAGGCAT  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  TATGATGAGGTTCACGACATCCCCATGATCGCCCAGGTCACAGACTGTCTCCCGGAGTTCATCGGCAGAGGCAT  788

Query  888  GGCAATGGCATCCTTCTACCACGCAAGGTGTCTTCAGCTTGGCTTGGGCATCACCAGGGATGAAACAACCGCTA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  GGCAATGGCATCCTTCTACCACGCAAGGTGTCTTCAGCTTGGCTTGGGCATCACCAGGGATGAAACAACCGCTA  862

Query  962  AACACTATTATTCTAAAGCTTGTCGTCTGAATCCCGCATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTTATTCGTCAA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  AACACTATTATTCTAAAGCTTGTCGTCTGAATCCCGCATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTTATTCGTCAA  936

Query 1036  AGAATT  1041
            ||||||
Sbjct  937  AGAATT  942