Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478007
• Subject: XM_011513833.2
• Aligned Length: 2073
• Identities: 1855
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ATGGCGCCCTTTCCTGAAGAAGTGGACGTCTTCACCGCCCCACACTGGCGGATGAAGCAGCTGGTGGGGCTCTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCCCTTTCCTGAAGAAGTGGACGTCTTCACCGCCCCACACTGGCGGATGAAGCAGCTGGTGGGGCTCTA  74

Query   75  CTGCGACAAGCTTTCTAAAACCAATTTTTCCAACAACAACGATTTCCGTGCTCTTCTGCAGTCTTTGTATGCTA  148
            |||||||                                                                   
Sbjct   75  CTGCGAC-------------------------------------------------------------------  81

Query  149  CTTTCACGGAGTTCAAAATGCATGAGCAGATTGAAAATGAATACATTATTGGTTTGCTTCAACAACGCAGCCAG  222
                                                                                      
Sbjct   82  --------------------------------------------------------------------------  81

Query  223  ACCATTTATAATGTACATTCTGACAATAAACTCTCCGAGATGCTTAGCCTCTTTGAAAAGGGACTGAAGAATGT  296
                                                                                      
Sbjct   82  --------------------------------------------------------------------------  81

Query  297  TAAGAATGAATATGAGCAGTTAAATTATGCAAAACAACTGAAAGAGAGATTGGAGGCTTTTACAAGAGATTTTC  370
             ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   82  -AAGAATGAATATGAACAGTTAAATTATGCAAAACAACTGAAAGAGAGATTGGAGGCTTTTACAAGAGATTTTC  154

Query  371  TTCCTCACATGAAAGAGGAAGAGGAGGTTTTTCAGCCCATGTTAATGGAATATTTTACCTATGAAGAGCTTAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  155  TTCCTCACATGAAAGAGGAAGAGGAGGTTTTTCAGCCCATGTTAATGGAATATTTTACCTATGAAGAGCTTAAG  228

Query  445  GATATTAAAAAGAAAGTGATTGCACAACACTGCTCTCAGAAGGATACTGCAGAACTCCTTAGAGGTCTTAGCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  229  GATATTAAAAAGAAAGTGATTGCACAACACTGCTCTCAGAAGGATACTGCAGAACTCCTTAGAGGTCTTAGCCT  302

Query  519  ATGGAATCATGCTGAAGAGCGACAGAAGTTTTTTAAATATTCCGTGGATGAAAAGTCAGATAAAGAAGCAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  303  ATGGAATCATGCTGAAGAGCGACAGAAGTTTTTTAAATATTCCGTGGATGAAAAGTCAGATAAAGAAGCAGAAG  376

Query  593  TGTCAGAACACTCCACAGGTATAACCCATCTTCCTCCTGAGGTAATGCTGTCAATTTTCAGCTATCTTAATCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  377  TGTCAGAACACTCCACAGGTATAACCCATCTTCCTCCTGAGGTAATGCTGTCAATTTTCAGCTATCTTAATCCT  450

Query  667  CAAGAGTTATGTCGATGCAGTCAAGTAAGCATGAAATGGTCTCAGCTGACAAAAACGAGATCGCTTTGGAAACA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  451  CAAGAGTTATGTCGATGCAGTCAAGTAAGCATGAAATGGTCTCAGCTGACAAAAACGGGATCGCTTTGGAAACA  524

Query  741  TCTTTACCCTGTTCATTGGGCCAGAGGTGACTGGTATAGTGGTCCCGCAACTGAACTTGATACTGAACCTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  TCTTTACCCTGTTCATTGGGCCAGAGGTGACTGGTATAGTGGTCCCGCAACTGAACTTGATACTGAACCTGATG  598

Query  815  ATGAATGGGTGAAAAATAGGAAAGATGAAAGTCGTGCTTTTCATGAGTGGGATGAAGATGCTGACATTGATGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599  ATGAATGGGTGAAAAATAGGAAAGATGAAAGTCGTGCTTTTCATGAGTGGGATGAAGATGCTGACATTGATGAA  672

Query  889  TCTGAAGAGTCTGCGGAGGAATCAATTGCTATCAGCATTGCACAAATGGAAAAACGTTTACTCCATGGCTTAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  673  TCTGAAGAGTCTGCGGAGGAATCAATTGCTATCAGCATTGCACAAATGGAAAAACGTTTACTCCATGGCTTAAT  746

Query  963  TCATAACGTTCTACCATATGTTGGTACTTCTGTAAAAACCTTAGTATTAGCATACAGCTCTGCAGTTTCCAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  747  TCATAACGTTCTACCATATGTTGGTACTTCTGTAAAAACCTTAGTATTAGCATACAGCTCTGCAGTTTCCAGCA  820

Query 1037  AAATGGTTAGGCAGATTTTAGAGCTTTGTCCTAACCTGGAGCATCTGGATCTTACCCAGACTGACATTTCAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  821  AAATGGTTAGGCAGATTTTAGAGCTTTGTCCTAACCTGGAGCATCTGGATCTTACCCAGACTGACATTTCAGAT  894

Query 1111  TCTGCATTTGACAGTTGGTCTTGGCTTGGTTGCTGCCAGAGTCTTCGGCATCTTGATCTGTCTGGTTGTGAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895  TCTGCATTTGACAGTTGGTCTTGGCTTGGTTGCTGCCAGAGTCTTCGGCATCTTGATCTGTCTGGTTGTGAGAA  968

Query 1185  AATCACAGATGTGGCCCTAGAGAAGATTTCCAGAGCTCTTGGAATTCTGACATCTCATCAAAGTGGCTTTTTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  969  AATCACAGATGTGGCCCTAGAGAAGATTTCCAGAGCTCTTGGAATTCTGACATCTCATCAAAGTGGCTTTTTGA  1042

Query 1259  AAACATCTACAAGCAAAATTACTTCAACTGCGTGGAAAAATAAAGACATTACCATGCAGTCCACCAAGCAGTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043  AAACATCTACAAGCAAAATTACTTCAACTGCGTGGAAAAATAAAGACATTACCATGCAGTCCACCAAGCAGTAT  1116

Query 1333  GCCTGTTTGCACGATTTAACTAACAAGGGCATTGGAGAAGAAATAGATAATGAACACCCCTGGACTAAGCCTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117  GCCTGTTTGCACGATTTAACTAACAAGGGCATTGGAGAAGAAATAGATAATGAACACCCCTGGACTAAGCCTGT  1190

Query 1407  TTCTTCTGAGAATTTCACTTCTCCTTATGTGTGGATGTTAGATGCTGAAGATTTGGCTGATATTGAAGATACTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191  TTCTTCTGAGAATTTCACTTCTCCTTATGTGTGGATGTTAGATGCTGAAGATTTGGCTGATATTGAAGATACTG  1264

Query 1481  TGGAATGGAGACATAGAAATGTTGAAAGTCTTTGTGTAATGGAAACAGCATCCAACTTTAGTTGTTCCACCTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265  TGGAATGGAGACATAGAAATGTTGAAAGTCTTTGTGTAATGGAAACAGCATCCAACTTTAGTTGTTCCACCTCT  1338

Query 1555  GGTTGTTTTAGTAAGGACATTGTTGGACTAAGGACTAGTGTCTGTTGGCAGCAGCATTGTGCTTCTCCAGCCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339  GGTTGTTTTAGTAAGGACATTGTTGGACTAAGGACTAGTGTCTGTTGGCAGCAGCATTGTGCTTCTCCAGCCTT  1412

Query 1629  TGCGTATTGTGGTCACTCATTTTGTTGTACAGGAACAGCTTTAAGAACTATGTCATCACTCCCAGAATCTTCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413  TGCGTATTGTGGTCACTCATTTTGTTGTACAGGAACAGCTTTAAGAACTATGTCATCACTCCCAGAATCTTCTG  1486

Query 1703  CAATGTGTAGAAAAGCAGCAAGGACTAGATTGCCTAGGGGAAAAGACTTAATTTACTTTGGGAGTGAAAAATCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487  CAATGTGTAGAAAAGCAGCAAGGACTAGATTGCCTAGGGGAAAAGACTTAATTTACTTTGGGAGTGAAAAATCT  1560

Query 1777  GATCAAGAGACTGGACGTGTACTTCTGTTTCTCAGTTTATCTGGATGTTATCAGATCACAGACCATGGTCTCAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561  GATCAAGAGACTGGACGTGTACTTCTGTTTCTCAGTTTATCTGGATGTTATCAGATCACAGACCATGGTCTCAG  1634

Query 1851  GGTTTTGACTCTGGGAGGAGGGCTGCCTTATTTGGAGCACCTTAATCTCTCTGGTTGTCTTACTATAACTGGTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635  GGTTTTGACTCTGGGAGGAGGGCTGCCTTATTTGGAGCACCTTAATCTCTCTGGTTGTCTTACTATAACTGGTG  1708

Query 1925  CAGGCCTGCAGGATTTGGTTTCAGCATGTCCTTCTCTGAATGATGAATACTTTTACTACTGTGACAACATTAAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709  CAGGCCTGCAGGATTTGGTTTCAGCATGTCCTTCTCTGAATGATGAATACTTTTACTACTGTGACAACATTAAC  1782

Query 1999  GGTCCTCATGCTGATACCGCCAGTGGATGCCAGAATTTGCAGTGTGGTTTTCGAGCCTGCTGCCGCTCTGGCGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783  GGTCCTCATGCTGATACCGCCAGTGGATGCCAGAATTTGCAGTGTGGTTTTCGAGCCTGCTGCCGCTCTGGCGA  1856

Query 2073  A  2073
            |
Sbjct 1857  A  1857