Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478114
- Subject:
- NM_001100166.2
- Aligned Length:
- 1902
- Identities:
- 1662
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 ATGGACAACGCCGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGCAAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACAACGCCGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGCAAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAAC 74
Query 75 ACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTAAAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTAAAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGA 148
Query 149 AGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAAAGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAAAGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAG 222
Query 223 CTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGATGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGATGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAA 296
Query 297 CGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGGAAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGGAAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCT 370
Query 371 CTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAAGATAAGAAAGAGAACACTGAAAACCACTCTGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAAGATAAGAAA------------------------ 420
Query 445 ACACCGGCAGCTCCTGCTCTACCTCCTTCTGCTCCTCCTAAGCCTAGACCCAAACCTAAACCCAAAAAATCACC 518
Sbjct 421 -------------------------------------------------------------------------- 420
Query 519 TGTGCCTCCGAAAGGGGCCACTGCTGGGGCCAGCCACAAAGGTGATGAAGTGCCTCCCATTAAAAAAAATATCA 592
Sbjct 421 -------------------------------------------------------------------------- 420
Query 593 AGGCTCCTGGTAAGCAGGCCCCCGTCCCTCCACCCAAGCCAGCAAGCCGAAACACGACCCGAGAGGCTGCTGGC 666
||||||
Sbjct 421 --------------------------------------------------------------------GCTGGC 426
Query 667 TCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGCTTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 TCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGCTTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCC 500
Query 741 CAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAGTGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 CAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAGTGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACA 574
Query 815 AGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACTTCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 575 AGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACTTCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCA 648
Query 889 GAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCCTGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 GAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCCTGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAA 722
Query 963 GTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTCCTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 GTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTCCTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGT 796
Query 1037 GCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTTGGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 GCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTTGGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCA 870
Query 1111 AGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCACTCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 AGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCACTCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAG 944
Query 1185 AGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGAAGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 945 AGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGAAGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGA 1018
Query 1259 TGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAAGGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAAGGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGAC 1092
Query 1333 TCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGACGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 TCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGACGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTT 1166
Query 1407 GGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAACTTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 GGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAACTTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGG 1240
Query 1481 ACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAGGAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 ACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAGGAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTC 1314
Query 1555 AGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCAAAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 AGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCAAAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGA 1388
Query 1629 GGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCAGAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 GGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCAGAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGC 1462
Query 1703 TACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAAGTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 TACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAAGTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCA 1536
Query 1777 GACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGCAATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 GACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGCAATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCAC 1610
Query 1851 AGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGTTTCATCGTCCA 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 AGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGTTTCATCGTCCA 1662