Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478143
- Subject:
- NM_172617.3
- Aligned Length:
- 1713
- Identities:
- 1520
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG 74
|||||.|||.||||||||||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAAGCCTGGGGCTGCAAACGGTGAGGCTCAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAGGCTGTCAAAGG 74
Query 75 AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC 148
.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct 75 GGAGAAGCTGCTTGAAGGGCAAGTGATCCAGCTGGAGGACGGGACCACTGCGTACATTCACCAGGTGACGATAC 148
Query 149 AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC 222
|||||||..||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 149 AGAAAGAGTCTTTCTCCTTTGAAGATGGTCAGCCCGTGCAGCTGGAAGACGGCAGCATGGCCTACATACACCAC 222
Query 223 ACACCCAGAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCA 296
|||||||.|||.||||.||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 ACACCCAAAGAGGGCTGTGACCCCAGCGCCCTGGAAGCTGTCCAGCTGGAAGACGGTTCCACTGCCTACATCCA 296
Query 297 CCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAG 370
.|||||||||.|||||||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCACCCTGTGCCTGTGCCGTCGGACAGCGCCATCCTGGCTGTGCAGACGGAGGCGGGCTTGGAGGACCTGGCAG 370
Query 371 CAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGAC 444
|.||.||.||.||.||||||.|..|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 371 CGGAAGACGAGGAAGGCTTCGGCACGGACACAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTGCACGAT 444
Query 445 AG-CCAGATTCCC-CGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGT 516
|| ||.|.||||| | |||||.|||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCCTGCTTCCCAC--AATGGCAAAGGGCAGCAGGTTGGAGACCGAGCTTTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGT 516
Query 517 GGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATG 590
||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 517 GGTCGTCTCTACACCACTGCCCATCACTTAAAGGTCCACGAACGAGCTCACACAGGGGACCGCCCATACAGGTG 590
Query 591 TGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTG 664
||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 591 TGACTTTCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCAACAGGCTATGGGCTAAAAAGTCATGTTCGTACTCACACGGGTG 664
Query 665 AGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTC 738
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 665 AGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAAGCCTTCAAGACCTCAGGGGACCTGCAGAAACACGTG 738
Query 739 CGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACAT 812
||.||||||||.|||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 739 CGGACCCACACAGGTGAGCGCCCATTCCGGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCAAATAT 812
Query 813 CCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCT 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 813 CCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGCGGCCCTACACCTGCCCCGAGCCCCACTGTGGTCGTGGCT 886
Query 887 TCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCA 960
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 TCACCAGCGCCACCAACTACAAGAATCATGTGCGCATCCATACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCA 960
Query 961 GGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTA 1034
||||||||.||.|||||.||.||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 961 GGCTGCGGAAAGCGCTTTACGGAGTACTCGAGCCTGTACAAACACCACGTGGTGCACACACATTGCAAGCCCTA 1034
Query 1035 CACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCG 1108
|||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1035 CACGTGCAGTAGCTGTGGCAAGACCTACCGGCAAACCTCCACCCTGGCCATGCACAAGCGCAGCGCACACGGGG 1108
Query 1109 AGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAG 1182
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1109 AGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTGTATGAGCAGCAGCAGCTGGAGGCCGCCTCTGCTGCTGAG 1182
Query 1183 GAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAG-AGATGACATCCCAG 1255
||.||.||.||||||||||.|.|||..||.||||||||||||||.|||||||||||||| || ||.|||||||.
Sbjct 1183 GAAAGCCCCCCACCCAAACCAACCCACATTGCTTACCTTTCGGAAGTGAAGGAAGAGAGCAG-TGCCATCCCAA 1255
Query 1256 CCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAG 1329
||||.||.||.||||||||.||.||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1256 CCCAAGTAGCCATGGTGACGGAGGAGGATGGGCCCCCTCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGACGGTACCCAGCAG 1329
Query 1330 GTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCAC 1403
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1330 GTCAGCCTGTCCCCAGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTGTGGTGACACAGCACGGCAGCACCAC 1403
Query 1404 CCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATG 1477
|||||||||||||.|||.|.|||..||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1404 CCTCACCATCCCCGGTCATCATGAAGAACTAGCCACATCTGGCACACACACGGTCACCATGGTCAGCGCTGATG 1477
Query 1478 GCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTT 1551
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1478 GCACGCAGACTCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCCTTGGTGACTGAGGACTCAAGCGTGGCGTCTCTT 1551
Query 1552 CGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGAC 1625
|.|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1552 CATCACCAACAGGTGGCGCTGTTGGCCACAGCCAACGGAACACACATCGCAGTGCAGCTGGAGGACCAGCAGAC 1625
Query 1626 CTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGG 1699
|.|.|||||||||||.|..||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||| |
Sbjct 1626 CCTGGAGGAGGCCATAAGCGTAGCCACTGCTGCTATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAAACCACA------G 1693
Query 1700 AGAGTGGCTGC 1710
||||.||||||
Sbjct 1694 AGAGCGGCTGC 1704