Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478143
• Subject: XM_011514847.3
• Aligned Length: 1790
• Identities: 1671
• Gaps: 97

Alignment

Query    1  ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG  74

Query   75  AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC  148

Query  149  AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC  222

Query  223  ACACCCAG-----------------------AGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA  273
            ||||||||                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACACCCAGAGGGCTAACCGCGTGTTCCCTGCAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA  296

Query  274  GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA  370

Query  348  GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT  444

Query  422  ATGCCAGCA-------------AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG  482
            |||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCCAGCAAGACTTTTCCCCCAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG  518

Query  483  AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG  592

Query  557  AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT  666

Query  631  GGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGC  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGC  740

Query  705  CTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG  814

Query  779  AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC  888

Query  853  TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA  962

Query  927  CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA  1036

Query 1001  AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC  1110

Query 1075  ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGA  1148
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGA  1184

Query 1149  GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT  1258

Query 1223  CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG  1332

Query 1297  GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGC  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGC  1406

Query 1371  CATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTG  1444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTG  1480

Query 1445  GCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCT  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCT  1554

Query 1519  GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC  1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC  1628

Query 1593  GCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAAC------AGCAG---ACCTTAGAGG---AGGC----CATCAATGTG-GC  1649
            |||||||||||||||   ||| .|||      .||||   ||||  |.||   |.||    |||||.|.|| |.
Sbjct 1629  GCACATTGCAGTGCA---GGA-TAACTCCGATGGCAGTCCACCT--GTGGTCCAAGCCCTTCATCATTTTGTGT  1696

Query 1650  CACTG----------CGGCCATGCAGCAAGG-GGCTG-------TGACCCTGGAGACAACAGT----GTCGGAG  1701
            |.|||          .||..|||    |||| |||||       |||.|      ||.||.||    .||.|..
Sbjct 1697  CTCTGTTTCTTCATCTGGAAATG----AAGGAGGCTGACGTAGATGATC------ACCACGGTTCTCTTCAGCC  1760

Query 1702  AGTGGCTGC-----  1710
            ||| .||.|     
Sbjct 1761  AGT-CCTTCCTCCG  1773