Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478143
- Subject:
- XM_011514855.2
- Aligned Length:
- 1767
- Identities:
- 1499
- Gaps:
- 246
Alignment
Query 1 ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------ATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC 50
Query 223 ACACCCAGAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 ACACCCAGAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCA 124
Query 297 CCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 CCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAG 198
Query 371 CAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCA-------------A 431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 199 CAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGACTTTTCCCCCA 272
Query 432 GGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCT 505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 GGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCT 346
Query 506 ACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGT 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347 ACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGT 420
Query 580 CCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTAC 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTAC 494
Query 654 CCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGC 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 CCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGC 568
Query 728 AGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACC 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 AGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACC 642
Query 802 ACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTG 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 ACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTG 716
Query 876 TGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTTT 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 TGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTTT 790
Query 950 GCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACAC 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 GCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACAC 864
Query 1024 TGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAG 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 TGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAG 938
Query 1098 TGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCT 1171
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 939 TGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCT 1012
Query 1172 CTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGAT 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 CTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGAT 1086
Query 1246 GACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGG 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087 GACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGG 1160
Query 1320 TGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACG 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 TGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACG 1234
Query 1394 GCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTC 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235 GCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTC 1308
Query 1468 AGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGT 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 AGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGT 1382
Query 1542 AGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGG 1615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| .
Sbjct 1383 AGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCA---GGA-T 1452
Query 1616 AAC------AGCAG---ACCTTAGAGG---AGGC----CATCAATGTG-GCCACTG----------CGGCCATG 1662
||| .|||| |||| |.|| |.|| |||||.|.|| |.|.||| .||..|||
Sbjct 1453 AACTCCGATGGCAGTCCACCT--GTGGTCCAAGCCCTTCATCATTTTGTGTCTCTGTTTCTTCATCTGGAAATG 1524
Query 1663 CAGCAAGG-GGCTG-------TGACCCTGGAGACAACAGT----GTCGGAGAGTGGCTGC----- 1710
|||| ||||| |||.| ||.||.|| .||.|..||| .||.|
Sbjct 1525 ----AAGGAGGCTGACGTAGATGATC------ACCACGGTTCTCTTCAGCCAGT-CCTTCCTCCG 1578