Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478143
• Subject: XM_011514856.3
• Aligned Length: 1770
• Identities: 1469
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC  222
                                    ||     ||.||   |||||  |||.|||         ||     |||||
Sbjct    1  ------------------------AT-----GCTTG---AGCTG--AGAGGGC---------TA-----ACCGC  26

Query  223  --ACACCCAG-AGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACAT  293
              ...|||.| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   27  GTGTTCCCTGCAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACAT  100

Query  294  TCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  TCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGG  174

Query  368  CAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCA-----------  430
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  175  CAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGACTTTTCCC  248

Query  431  --AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTG  502
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  CCAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTG  322

Query  503  GCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGAC  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  GCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGAC  396

Query  577  CGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCG  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  CGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCG  470

Query  651  TACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACC  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  TACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACC  544

Query  725  TGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTC  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  TGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTC  618

Query  799  ACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCA  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  ACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCA  692

Query  873  CTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACG  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  CTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACG  766

Query  947  TTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACA  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  TTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACA  840

Query 1021  CACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCG  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  CACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCG  914

Query 1095  CAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCG  1168
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  CAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCG  988

Query 1169  CCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGA  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  CCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGA  1062

Query 1243  GATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGA  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  GATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGA  1136

Query 1317  TGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGC  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  TGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGC  1210

Query 1391  ACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATG  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  ACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATG  1284

Query 1465  GTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAG  1538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  GTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAG  1358

Query 1539  TGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGG  1612
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
Sbjct 1359  TGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCA---GG  1429

Query 1613  AGGAAC------AGCAG---ACCTTAGAGG---AGGC----CATCAATGTG-GCCACTG----------CGGCC  1659
            | .|||      .||||   ||||  |.||   |.||    |||||.|.|| |.|.|||          .||..
Sbjct 1430  A-TAACTCCGATGGCAGTCCACCT--GTGGTCCAAGCCCTTCATCATTTTGTGTCTCTGTTTCTTCATCTGGAA  1500

Query 1660  ATGCAGCAAGG-GGCTG-------TGACCCTGGAGACAACAGT----GTCGGAGAGTGGCTGC-----  1710
            |||    |||| |||||       |||.|      ||.||.||    .||.|..||| .||.|     
Sbjct 1501  ATG----AAGGAGGCTGACGTAGATGATC------ACCACGGTTCTCTTCAGCCAGT-CCTTCCTCCG  1557