Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478143
• Subject: XM_017011251.2
• Aligned Length: 1790
• Identities: 1506
• Gaps: 262

Alignment

Query    1  ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG  74

Query   75  AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC  148

Query  149  AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC  222

Query  223  ACACCCAG-----------------------AGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA  273
            ||||||||                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACACCCAGAGGGCTAACCGCGTGTTCCCTGCAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA  296

Query  274  GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA  370

Query  348  GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT  444

Query  422  ATGCCAGCA-------------AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG  482
            |||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCCAGCAAGACTTTTCCCCCAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG  518

Query  483  AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG  592

Query  557  AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT  666

Query  631  GGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGC  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGC  740

Query  705  CTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG  814

Query  779  AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC  888

Query  853  TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA  962

Query  927  CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA  1036

Query 1001  AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC  1110

Query 1075  ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGA  1148
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGA  1184

Query 1149  GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT  1258

Query 1223  CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG  1332

Query 1297  GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGC  1370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 1333  GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAG-----------------------------------------  1365

Query 1371  CATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTG  1444
                                                                                      
Sbjct 1366  --------------------------------------------------------------------------  1365

Query 1445  GCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCT  1518
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366  --------------------------------------------------GTCACAATCATTACCTCTGGGGCT  1389

Query 1519  GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC  1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390  GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC  1463

Query 1593  GCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAAC------AGCAG---ACCTTAGAGG---AGGC----CATCAATGTG-GC  1649
            |||||||||||||||   ||| .|||      .||||   ||||  |.||   |.||    |||||.|.|| |.
Sbjct 1464  GCACATTGCAGTGCA---GGA-TAACTCCGATGGCAGTCCACCT--GTGGTCCAAGCCCTTCATCATTTTGTGT  1531

Query 1650  CACTG----------CGGCCATGCAGCAAGG-GGCTG-------TGACCCTGGAGACAACAGT----GTCGGAG  1701
            |.|||          .||..|||    |||| |||||       |||.|      ||.||.||    .||.|..
Sbjct 1532  CTCTGTTTCTTCATCTGGAAATG----AAGGAGGCTGACGTAGATGATC------ACCACGGTTCTCTTCAGCC  1595

Query 1702  AGTGGCTGC-----  1710
            ||| .||.|     
Sbjct 1596  AGT-CCTTCCTCCG  1608