Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478143
• Subject: XM_017317409.1
• Aligned Length: 1713
• Identities: 1520
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG  74
            |||||.|||.||||||||||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAGCCTGGGGCTGCAAACGGTGAGGCTCAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAGGCTGTCAAAGG  74

Query   75  AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC  148
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct   75  GGAGAAGCTGCTTGAAGGGCAAGTGATCCAGCTGGAGGACGGGACCACTGCGTACATTCACCAGGTGACGATAC  148

Query  149  AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC  222
            |||||||..||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|
Sbjct  149  AGAAAGAGTCTTTCTCCTTTGAAGATGGTCAGCCCGTGCAGCTGGAAGACGGCAGCATGGCCTACATACACCAC  222

Query  223  ACACCCAGAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCA  296
            |||||||.|||.||||.||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  ACACCCAAAGAGGGCTGTGACCCCAGCGCCCTGGAAGCTGTCCAGCTGGAAGACGGTTCCACTGCCTACATCCA  296

Query  297  CCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAG  370
            .|||||||||.|||||||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCACCCTGTGCCTGTGCCGTCGGACAGCGCCATCCTGGCTGTGCAGACGGAGGCGGGCTTGGAGGACCTGGCAG  370

Query  371  CAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGAC  444
            |.||.||.||.||.||||||.|..|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  CGGAAGACGAGGAAGGCTTCGGCACGGACACAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTGCACGAT  444

Query  445  AG-CCAGATTCCC-CGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGT  516
            || ||.|.||||| |  |||||.|||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCCTGCTTCCCAC--AATGGCAAAGGGCAGCAGGTTGGAGACCGAGCTTTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGT  516

Query  517  GGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATG  590
            ||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  517  GGTCGTCTCTACACCACTGCCCATCACTTAAAGGTCCACGAACGAGCTCACACAGGGGACCGCCCATACAGGTG  590

Query  591  TGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTG  664
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  591  TGACTTTCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCAACAGGCTATGGGCTAAAAAGTCATGTTCGTACTCACACGGGTG  664

Query  665  AGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTC  738
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  665  AGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAAGCCTTCAAGACCTCAGGGGACCTGCAGAAACACGTG  738

Query  739  CGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACAT  812
            ||.||||||||.|||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  739  CGGACCCACACAGGTGAGCGCCCATTCCGGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCAAATAT  812

Query  813  CCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCT  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  813  CCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGCGGCCCTACACCTGCCCCGAGCCCCACTGTGGTCGTGGCT  886

Query  887  TCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCA  960
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  TCACCAGCGCCACCAACTACAAGAATCATGTGCGCATCCATACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCA  960

Query  961  GGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTA  1034
            ||||||||.||.|||||.||.||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  961  GGCTGCGGAAAGCGCTTTACGGAGTACTCGAGCCTGTACAAACACCACGTGGTGCACACACATTGCAAGCCCTA  1034

Query 1035  CACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCG  1108
            |||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1035  CACGTGCAGTAGCTGTGGCAAGACCTACCGGCAAACCTCCACCCTGGCCATGCACAAGCGCAGCGCACACGGGG  1108

Query 1109  AGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAG  1182
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1109  AGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTGTATGAGCAGCAGCAGCTGGAGGCCGCCTCTGCTGCTGAG  1182

Query 1183  GAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAG-AGATGACATCCCAG  1255
            ||.||.||.||||||||||.|.|||..||.||||||||||||||.|||||||||||||| || ||.|||||||.
Sbjct 1183  GAAAGCCCCCCACCCAAACCAACCCACATTGCTTACCTTTCGGAAGTGAAGGAAGAGAGCAG-TGCCATCCCAA  1255

Query 1256  CCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAG  1329
            ||||.||.||.||||||||.||.||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1256  CCCAAGTAGCCATGGTGACGGAGGAGGATGGGCCCCCTCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGACGGTACCCAGCAG  1329

Query 1330  GTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCAC  1403
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1330  GTCAGCCTGTCCCCAGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTGTGGTGACACAGCACGGCAGCACCAC  1403

Query 1404  CCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATG  1477
            |||||||||||||.|||.|.|||..||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1404  CCTCACCATCCCCGGTCATCATGAAGAACTAGCCACATCTGGCACACACACGGTCACCATGGTCAGCGCTGATG  1477

Query 1478  GCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTT  1551
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1478  GCACGCAGACTCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCCTTGGTGACTGAGGACTCAAGCGTGGCGTCTCTT  1551

Query 1552  CGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGAC  1625
            |.|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1552  CATCACCAACAGGTGGCGCTGTTGGCCACAGCCAACGGAACACACATCGCAGTGCAGCTGGAGGACCAGCAGAC  1625

Query 1626  CTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGG  1699
            |.|.|||||||||||.|..||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||      |
Sbjct 1626  CCTGGAGGAGGCCATAAGCGTAGCCACTGCTGCTATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAAACCACA------G  1693

Query 1700  AGAGTGGCTGC  1710
            ||||.||||||
Sbjct 1694  AGAGCGGCTGC  1704