Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478143
- Subject:
- XR_001743619.2
- Aligned Length:
- 2847
- Identities:
- 1708
- Gaps:
- 1137
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TGGGCGCTCAGCCTCGCTGGCCATGCGTCACCCCGGCCTTGGTGGGGGCGGGGCTCCGAAGAGCTCGGTTCAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCCGGCCGCCTGGGCTCCAGGAGCCCCGGAACCAGGATAAGTTGGATGGCTGCCGCGGCGAAGCGGGGGGCGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGTGGACCGTGCCCGGTATTTTCTATACGGGTTCCGGGGCCCGGTAGAGGCGCGCCAAGAGGAAAGGAAAGTGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGCGGCCCTGGAACCTGGATATCGCGCGAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTGTGGCTCTT 296
Query 1 ----------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA 370
Query 23 CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG 444
Query 97 GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA 518
Query 171 GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAG-------------- 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGGGCTAACCGCGT 592
Query 231 ---------AGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTC 295
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTTCCCTGCAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTC 666
Query 296 ACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCA 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCA 740
Query 370 GCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCA------------- 430
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGACTTTTCCCCC 814
Query 431 AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGC 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGC 888
Query 505 TACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCG 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCG 962
Query 579 TCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTA 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTA 1036
Query 653 CCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTG 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTG 1110
Query 727 CAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCAC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCAC 1184
Query 801 CACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACT 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACT 1258
Query 875 GTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTT 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTT 1332
Query 949 TGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACA 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACA 1406
Query 1023 CTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCA 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCA 1480
Query 1097 GTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCC 1170
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCC 1554
Query 1171 TCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGA 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGA 1628
Query 1245 TGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATG 1702
Query 1319 GTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCAC 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCAC 1776
Query 1393 GGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGT 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGT 1850
Query 1467 CAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCC-------------GTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCT 1527
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTATGACCAGGCGGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCT 1924
Query 1528 GAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGC 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGC 1998
Query 1602 AGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTG 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTG 2072
Query 1676 TGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC--------------------------------------- 1710
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGCTGAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGGA 2146
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2147 AGTGCCATCTGCATGGCCACTCTTGCCCCCAAGGGCCCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAGG 2220
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2221 TCTCTGGGGTGAGAAGACAGCAAGAAAACTGCCTAACTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCAG 2294
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2295 GCAGCTGGAATCAGGGGAGTGCATCATCCTCGGGAGCTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCTC 2368
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2369 AAAATCAGCTGGGCGCCCACTCTCCTCCTAAAGAACACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTAG 2442
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2443 AGATTGGGGCTGCTATGGGGACTGGCCCTGTAGGGTTGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGAG 2516
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2517 CAGGCCCTGTCCTGCCCTCCCAGCAATAACCACCTCCCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACCA 2590
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2591 GGGACTTCCTGACACCACAGTCAATTAATTCCTCAGGGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACCA 2664
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2665 CTCCTCAGCTGCCCCCCAACCTCTCTATGGCAGAGAGGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATTG 2738
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2739 GGTTTGATTTGTTTTGTTTTTTTTAATTCCATTTTGATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATGG 2812
Query 1711 ----------------------------------- 1710
Sbjct 2813 ATGAATGAGTATTTAATAAAAGTTCCAAATTTCCA 2847