Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478143
• Subject: XR_001743625.1
• Aligned Length: 2672
• Identities: 1708
• Gaps: 962

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AAGCTGCGCGCGGGCGGGCGGGCTATGGCGCAGGCGGGTTGTGGGGCCGGCGCTGGTGGCGGGGCCCGGTGCAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGCGGTCTGTCGGCGGAGTCGCCCTCGGGGGCTGTCAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTG  148

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGG  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  149  TGGCTCTTGGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGG  222

Query   15  GCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTG  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTG  296

Query   89  AAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTC  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTC  370

Query  163  TCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGG  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGG  444

Query  237  CTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTG  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTG  518

Query  311  TGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAG  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAG  592

Query  385  GGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCG  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCG  666

Query  459  TAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCA  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCA  740

Query  533  CCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGT  814

Query  607  GGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTG  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTG  888

Query  681  CCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTG  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTG  962

Query  755  AACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTG  1036

Query  829  CGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAA  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAA  1110

Query  903  CTATAAGAATCACGTGCGCATCCACA--------------CAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGCCCAGTGTCCCCAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGG  1184

Query  963  CTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACA  1258

Query 1037  CCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  CCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAG  1332

Query 1111  CTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGA  1406

Query 1185  GAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCC  1480

Query 1259  AGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTC  1554

Query 1333  AGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCT  1628

Query 1407  CACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCA  1702

Query 1481  CCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGT  1776

Query 1555  CATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTT  1850

Query 1629  AGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGA  1924

Query 1703  GTGGCTGC------------------------------------------------------------------  1710
            ||||||||                                                                  
Sbjct 1925  GTGGCTGCTGAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGGAAGTGCCATCTGCATGGCCACTCTTGCC  1998

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 1999  CCCAAGGGCCCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAGGTCTCTGGGGTGAGAAGACAGCAAGAAA  2072

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2073  ACTGCCTAACTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCAGGCAGCTGGAATCAGGGGAGTGCATCAT  2146

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2147  CCTCGGGAGCTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCTCAAAATCAGCTGGGCGCCCACTCTCCTC  2220

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2221  CTAAAGAACACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTAGAGATTGGGGCTGCTATGGGGACTGGCC  2294

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2295  CTGTAGGGTTGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGAGCAGGCCCTGTCCTGCCCTCCCAGCAAT  2368

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2369  AACCACCTCCCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACCAGGGACTTCCTGACACCACAGTCAATTA  2442

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2443  ATTCCTCAGGGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACCACTCCTCAGCTGCCCCCCAACCTCTCTA  2516

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2517  TGGCAGAGAGGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATTGGGTTTGATTTGTTTTGTTTTTTTTAAT  2590

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2591  TCCATTTTGATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATGGATGAATGAGTATTTAATAAAAGTTCCA  2664

Query 1711  --------  1710
                    
Sbjct 2665  AATTTCCA  2672