Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478143
• Subject: XR_001743629.1
• Aligned Length: 2685
• Identities: 1543
• Gaps: 1140

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AAGCTGCGCGCGGGCGGGCGGGCTATGGCGCAGGCGGGTTGTGGGGCCGGCGCTGGTGGCGGGGCCCGGTGCAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGCGGTCTGTCGGCGGAGTCGCCCTCGGGGGCTGTCAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTG  148

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGG  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  149  TGGCTCTTGGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGG  222

Query   15  GCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTG  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTG  296

Query   89  AAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTC  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTC  370

Query  163  TCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGG  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGG  444

Query  237  CTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTG  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTG  518

Query  311  TGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAG  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAG  592

Query  385  GGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCA-------------AGGTTCTTCATGACA  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||
Sbjct  593  GGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGACTTTTCCCCCAGGTTCTTCATGACA  666

Query  446  GCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGG  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGG  740

Query  520  CGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGA  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGA  814

Query  594  CTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGA  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGA  888

Query  668  AACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGT  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGT  962

Query  742  ACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCG  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCG  1036

Query  816  CAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCA  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCA  1110

Query  890  CCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACA--------------CAGGGGAGAAGCCATACGTTT  949
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGCCCAGTGTCCCCAGGGGAGAAGCCATACGTTT  1184

Query  950  GCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACAC  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACAC  1258

Query 1024  TGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAG  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAG  1332

Query 1098  TGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCT  1171
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCT  1406

Query 1172  CTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGAT  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGAT  1480

Query 1246  GACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGG  1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGG  1554

Query 1320  TGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACG  1393
            ||||||||||                                                                
Sbjct 1555  TGCCCAGCAG----------------------------------------------------------------  1564

Query 1394  GCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTC  1467
                                                                                      
Sbjct 1565  --------------------------------------------------------------------------  1564

Query 1468  AGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGT  1541
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565  ---------------------------GTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGT  1611

Query 1542  AGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGG  1615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612  AGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGG  1685

Query 1616  AACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACA  1689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686  AACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACA  1759

Query 1690  ACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC-----------------------------------------------------  1710
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 1760  ACAGTGTCGGAGAGTGGCTGCTGAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGGAAGTGCCATCTGCAT  1833

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 1834  GGCCACTCTTGCCCCCAAGGGCCCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAGGTCTCTGGGGTGAGA  1907

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 1908  AGACAGCAAGAAAACTGCCTAACTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCAGGCAGCTGGAATCAG  1981

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 1982  GGGAGTGCATCATCCTCGGGAGCTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCTCAAAATCAGCTGGGC  2055

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2056  GCCCACTCTCCTCCTAAAGAACACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTAGAGATTGGGGCTGCT  2129

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2130  ATGGGGACTGGCCCTGTAGGGTTGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGAGCAGGCCCTGTCCTG  2203

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2204  CCCTCCCAGCAATAACCACCTCCCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACCAGGGACTTCCTGACA  2277

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2278  CCACAGTCAATTAATTCCTCAGGGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACCACTCCTCAGCTGCCC  2351

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2352  CCCAACCTCTCTATGGCAGAGAGGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATTGGGTTTGATTTGTTT  2425

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2426  TGTTTTTTTTAATTCCATTTTGATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATGGATGAATGAGTATTT  2499

Query 1711  ---------------------  1710
                                 
Sbjct 2500  AATAAAAGTTCCAAATTTCCA  2520