Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478506
• Subject: XM_017018710.2
• Aligned Length: 2463
• Identities: 2422
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGTCT---TCCA-------CGGGGC-----------ACCCT-GGCTC-----CTACAAAATATGGGGAGAGAA  47
            |||.||   .|||       |.||||           ||||| ||.||     ||..|.|||      ||||||
Sbjct    1  ATGCCTCTGACCAGTGCCTTCAGGGCTGTGGACAACGACCCTGGGATCATTGTCTGGAGAAT------AGAGAA  68

Query   48  AATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGA  121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  AATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGA  142

Query  122  CCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAA  195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  CCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAA  216

Query  196  AGCTGCGCAGCCATATATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCA  269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  AGCTGCGCAGCCATATATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCA  290

Query  270  GTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTG  343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  GTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTG  364

Query  344  GGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATCAGG  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  GGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATCAGG  438

Query  418  GCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGACAGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCAT  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  GCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGACAGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCAT  512

Query  492  CATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAG  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  CATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAG  586

Query  566  ACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATG  639
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  ACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTAAAATAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATG  660

Query  640  AAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAA  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  AAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAA  734

Query  714  GCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCATATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAA  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  GCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCATATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAA  808

Query  788  GGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTG  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  GGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTG  882

Query  862  TGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGGGCTTCATCAAGATGAA  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGGGCTTCATCAAGATGAA  956

Query  936  GAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCC  1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCC  1030

Query 1010  AGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTC  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  AGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTC  1104

Query 1084  CAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGG  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  CAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGG  1178

Query 1158  CAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCT  1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  CAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCT  1252

Query 1232  TTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATC  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  TTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATC  1326

Query 1306  TGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTT  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  TGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTT  1400

Query 1380  TGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGA  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  TGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGA  1474

Query 1454  AGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAA  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  AGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAA  1548

Query 1528  ATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGA  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549  ATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGA  1622

Query 1602  TGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAA  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623  TGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAA  1696

Query 1676  TGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAG  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697  TGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAG  1770

Query 1750  TTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCA  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771  TTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCA  1844

Query 1824  GTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATG  1897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845  GTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATG  1918

Query 1898  ACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAAT  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919  ACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAAT  1992

Query 1972  GCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGA  2045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993  GCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGA  2066

Query 2046  CACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTA  2119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067  CACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTA  2140

Query 2120  ACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATGAACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATC  2193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141  ACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATGAACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATC  2214

Query 2194  ACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGT  2267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215  ACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGT  2288

Query 2268  TCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAAC  2341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289  TCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAAC  2362

Query 2342  AGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATG  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363  AGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATG  2436

Query 2416  AAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC  2436
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 2437  AAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC  2457