Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478714
• Subject: NM_001346089.1
• Aligned Length: 1882
• Identities: 1530
• Gaps: 131

Alignment

Query    1  ATGATATTCCTCACGGCACTGCCTCTGTTCTGGATTATGATTTCAGCCTCCCGAGGGGGTCACTGGGGTGCCTG  74
            ||||||||||||.|..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATATTCCTCGCCACCCTGCCGCTGTTTTGGATAATGATTTCAGCTTCTCGAGGGGGCCACTGGGGTGCCTG  74

Query   75  GATGCCCTCGTCCATCTCGGCCTTCGAAGGCACGTGCGTCTCCATCCCCTGCCGCTTTGACTTCCCGGATGAGC  148
            ||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct   75  GATGCCCTCGACCATCTCAGCCTTCGAGGGCACGTGTGTCTCCATTCCCTGCCGTTTCGACTTCCCCGATGAGC  148

Query  149  TGCGGCCCGCTGTGGTGCATGGTGTCTGGTACTTCAATAGCCCCTACCCCAAGAACTACCCCCCGGTGGTCTTC  222
            |..|.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCAGACCGGCTGTGGTACATGGCGTCTGGTATTTCAATAGTCCCTACCCCAAGAACTACCCACCGGTGGTCTTC  222

Query  223  AAGTCGCGCACCCAAGTAGTCCACGAGAGCTTCCAGGGCCGCAGCCGCCTCCTGGGGGACCTGGGCCTGCGAAA  296
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  223  AAGTCCCGCACACAAGTGGTCCATGAGAGTTTCCAGGGCCGCAGCCGCCTATTGGGAGACCTGGGCCTACGAAA  296

Query  297  CTGCACCCTCCTGCTCAGCA-ACGTCAGCCCCGAGCTGGGCGGGAAGTACTACTTCCGTGGGGACCTGGGCGGC  369
            |||.|||||.||.||||||| || |.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct  297  CTGTACCCTGCTTCTCAGCACAC-TGAGCCCCGAGCTGGGAGGCAAATACTATTTCCGAGGCGACCTGGGTGGC  369

Query  370  TACAACCAGTACACCTTCTCAGAGCACAGTGTCCTGGATATCGTCAACACCCCCAACATCGTGGTGCCCCCAGA  443
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  370  TACAACCAGTACACCTTCTCGGAGCACAGCGTCCTGGACATCGTCAACACCCCCAACATTGTGGTTCCCCCGGA  443

Query  444  GGTGGTGGCAGGCACGGAGGTGGAGGTCAGCTGCATGGTGCCGGACAACTGCCCAGAGCTGCGCCCTGAGCTGA  517
            .|||||||||||.|||||.||||                                                   
Sbjct  444  AGTGGTGGCAGGAACGGAAGTGG---------------------------------------------------  466

Query  518  GCTGGCTGGGCCACGAGGGGCTGGGGGAGCCCGCTGTGCTGGGCCGGCTGCGGGAGGACGAGGGCACCTGGGTG  591
                                                                                      
Sbjct  467  --------------------------------------------------------------------------  466

Query  592  CAGGTGTCACTGCTGCACTTCGTGCCCACGAGGGAGGCCAACGGCCACAGGCTGGGCTGCCAGGCCTCCTTCCC  665
             |||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||..|||||||
Sbjct  467  -AGGTGTCGCTGCTACACTTCGTGCCTACTAGAGAGGCCAACGGCCACCGTCTGGGCTGTCAGGCTGCCTTCCC  539

Query  666  CAACACCACCCTGCAGTTCGAGGGCTACGCCAGCATGGACGTCAAGTACCCCCCGGTGATTGTGGAGATGAACT  739
            ||||||||||.|||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  540  CAACACCACCTTGCAGTTCGAGGGTTACGCCAGTTTGGACGTCAAGTACCCCCCAGTGATTGTGGAGATGAATT  613

Query  740  CCTCGGTGGAGGCCATCGAGGGCTCCCACGTGAGCCTGCTCTGTGGGGCTGACAGCAACCCCCCGCCGCTGCTG  813
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  614  CCTCTGTGGAGGCCATTGAGGGCTCCCATGTCAGCCTGCTCTGTGGGGCTGACAGCAACCCGCCGCCGCTGCTG  687

Query  814  ACCTGGATGCGGGACGGGACAGTCCTCCGGGAGGCGGTGGCCGAGAGCCTGCTCCTGGAGCTGGAGGAGGTGAC  887
            ||.|||||||||||.||||..||..|..|||||||.||.|||.||||||||..||||||.||||||||||||||
Sbjct  688  ACTTGGATGCGGGATGGGATGGTGTTGAGGGAGGCAGTTGCCAAGAGCCTGTACCTGGATCTGGAGGAGGTGAC  761

Query  888  CCCCGCCGAAGACGGCGTCTATGCCTGCCTGGCCGAGAATGCCTATGGCCAGGACAACCGCACCGTGGGGCTCA  961
            |||.|..||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||.|
Sbjct  762  CCCAGGAGAGGACGGCGTCTATGCTTGCCTAGCAGAGAACGCCTATGGCCAGGACAACCGCACGGTGGAGCTGA  835

Query  962  GTGTCATGTATGCACCCTGGAAGCCAACAGTGAACGGGACAATGGTGGCCGTAGAGGGGGAGACGGTCTCTATC  1035
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  836  GTGTCATGTATGCACCTTGGAAGCCCACAGTGAATGGGACGGTGGTGGCCGTAGAGGGGGAGACTGTCTCTATC  909

Query 1036  TTGTGCTCCACACAGAGCAACCCGGACCCTATTCTCACCATCTTCAAGGAGAAGCAGATCCTGTCCACGGTCAT  1109
            .||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct  910  CTGTGTTCCACACAGAGCAACCCGGACCCCATCCTTACCATCTTCAAGGAGAAGCAGATCCTAGCCACGGTCAT  983

Query 1110  CTACGAGAGCGAGCTGCAGCTGGAGCTGCCGGCCGTGTCACCCGAGGATGATGGAGAGTACTGGTGTGTGGCTG  1183
            |||.|||||..|||||||||||||.||.||.||.|||.|.||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  984  CTATGAGAGTCAGCTGCAGCTGGAACTCCCTGCAGTGACCCCCGAGGATGATGGGGAATACTGGTGTGTGGCTG  1057

Query 1184  AGAACCAGTATGGCCAGAGGGCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTTCGCCCCTGTGCTCCTCCTGGAGTCC  1257
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|..||||.||||||||.
Sbjct 1058  AGAACCAGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTTTGCCCCCATAATCCTTCTGGAGTCA  1131

Query 1258  CACTGCGCGGCAGCCCGAGACACGGTGCAGTGCCTGTGCGTGGTGAAGTCCAACCCGGAGCCGTCCGTGGCCTT  1331
            |||||.||.||.|||.|||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1132  CACTGTGCAGCGGCCAGAGACACCGTGCAGTGTCTATGTGTGGTAAAATCCAACCCGGAACCCTCTGTGGCCTT  1205

Query 1332  TGAGCTGCCATCGCGCAATGTGACCGTGAACGAGAGCGAGCGGGAGTTCGTGTACTCGGAGCGCAGCGGCCTCG  1405
            |||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||..|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||||.
Sbjct 1206  TGAGCTGCCTTCCCGCAACGTGACTGTGAATGAGACGGAGAGGGAGTTTGTGTACTCCGAGCGCAGTGGCCTCC  1279

Query 1406  TGCTCACCAGCATCCTCACGCTGCGGGGGCAGGCCCAGGCCCCGCCCCGCGTCATCTGCACCGCGAGGAACCTC  1479
            ||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||
Sbjct 1280  TGCTCACCAGCATCCTCACGATCCGGGGTCAGGCCCAAGCCCCACCCCGCGTCATTTGTACCTCCAGGAACCTC  1353

Query 1480  TATGGCGCCAAGAGCCTGGAGCTGCCCTTCCAGGGAGCCCATCGACTGATGTGGGCCAAGATCGGGCCTGTGGG  1553
            ||||||.||.|||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1354  TATGGCACCCAGAGCCTCGAGCTGCCTTTCCAGGGAGCACACCGACTGATGTGGGCCAAAATCGGTCCTGTGGG  1427

Query 1554  CGCCGTGGTCGCCTTTGCCATCCTGATTGCCATCGTCTGCTACATTACCCAGACACGCAGGAAAAAGAACGTGA  1627
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||..|.||.||||||||.||.|
Sbjct 1428  TGCTGTGGTCGCCTTTGCCATCCTGATTGCCATTGTGTGCTACATCACCCAGACGAGAAGAAAAAAGAATGTCA  1501

Query 1628  CAGAGAGCCCCAGCTTCTCGGCAGGGGACAACCCTCCCGTCCTGTTCAGCAGCGACTTCCGCATCTCTGGGGCA  1701
            |.||||||.||||||||||.|..||.||||||||||..|||||||.||||..|||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1502  CGGAGAGCTCCAGCTTCTCAGGGGGAGACAACCCTCATGTCCTGTACAGCCCCGAATTCAGAATCTCTGGGGCA  1575

Query 1702  CCAGAGAAGTACGAGAGCGAGA---GGCGCCTGGGATCTGAGAGGAGGCTGCTGGGCCTTCGGGGTGAGCCCCC  1772
            ||.||.|||||.|||||.||||   .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||
Sbjct 1576  CCTGATAAGTATGAGAGTGAGAAGCAGCGCCTGGGATCTGAGAGGAGGCTGCTGGGCCTTCGGGGGGAATCCCC  1649

Query 1773  AGAGCTGGACCTGAGCTATTCTCACTCGGACCTGGGGAAACGGCCCACCAAGGACAGCTACACGCTGACGGAGG  1846
            |||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1650  AGAACTGGACCTCAGTTATTCCCACTCAGACCTGGGAAAACGACCCACCAAGGACAGCTACACCCTGACAGAGG  1723

Query 1847  AGCTAGCTGAGTATGCTGAAATCCGGGTCAAG  1878
            ||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1724  AGCTGGCTGAGTATGCAGAAATCCGAGTCAAG  1755